295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0029 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0029  protein tex  100 
 
 		 706 aa  1418    Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.450976  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2100  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.99 
 
 		 716 aa  571  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0300977  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2137  RNA-binding S1 domain-containing protein  41.99 
 
 		 716 aa  571  1e-161  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.580609  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0270  S1 RNA binding domain protein  39.72 
 
 		 722 aa  549  1e-155  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00390714  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0289  S1 RNA binding domain protein  40 
 
 		 724 aa  550  1e-155  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.032333  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5055  S1 RNA binding domain protein  40.03 
 
 		 722 aa  550  1e-155  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0346453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0275  S1 RNA-binding domain-containing protein  40.14 
 
 		 722 aa  548  1e-154  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.302481  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0233  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.28 
 
 		 722 aa  547  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.712365  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0241  RNA-binding S1 domain-containing protein  40.3 
 
 		 722 aa  546  1e-154  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0577162  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0354  RNA binding S1 domain protein  40.03 
 
 		 718 aa  543  1e-153  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0241  S1 RNA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 724 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0227  transcription accessory protein  40 
 
 		 724 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.409701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0229  transcription accessory protein  40 
 
 		 724 aa  544  1e-153  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0255  s1 RNA-binding domain-containing protein  40 
 
 		 722 aa  542  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.914514  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1388  RNA binding S1 domain protein  38.12 
 
 		 721 aa  544  1e-153  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0267  S1 RNA binding domain protein  40 
 
 		 722 aa  545  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  40.03 
 
 		 722 aa  540  9.999999999999999e-153  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0716  transcriptional regulator  42.94 
 
 		 710 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1676  S1 RNA-binding domain-containing protein  39.89 
 
 		 716 aa  538  1e-151  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1094  Tex-like protein protein-like protein  39.89 
 
 		 721 aa  537  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0319  transcriptional accessory protein  40.93 
 
 		 713 aa  537  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1770  RNA binding S1 domain protein  38.68 
 
 		 718 aa  532  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.133357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1955  RNA binding S1  37.9 
 
 		 718 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0213  RNA binding S1 domain protein  40.5 
 
 		 728 aa  527  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.231146  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0286  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.15 
 
 		 726 aa  524  1e-147  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000736156  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1124  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.55 
 
 		 724 aa  521  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0610  RNA binding S1 domain protein  41.07 
 
 		 727 aa  521  1e-146  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0338  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.71 
 
 		 722 aa  517  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3345  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.89 
 
 		 706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0479  RNA-binding S1 domain-containing protein  39.48 
 
 		 712 aa  512  1e-143  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00985663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0732  transcriptional accessory protein Tex, putative  41.72 
 
 		 720 aa  509  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0450  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.19 
 
 		 722 aa  503  1e-141  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.806006  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0379  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.51 
 
 		 713 aa  500  1e-140  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0908299 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf783  transcription accessory protein Tex  40.37 
 
 		 717 aa  498  1e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1283  transcriptional accessory protein  37.97 
 
 		 730 aa  496  1e-139  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0457  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.69 
 
 		 713 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2426  RNA-binding protein  36.41 
 
 		 720 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2136  transcription accessory protein  36.41 
 
 		 720 aa  489  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1540  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.55 
 
 		 713 aa  488  1e-136  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2028  RNA binding S1 domain protein  37.41 
 
 		 707 aa  485  1e-135  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1534  RNA binding S1  37.44 
 
 		 719 aa  473  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.264491  normal  0.667441 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2338  S1 RNA-binding domain-containing protein  36.58 
 
 		 754 aa  475  1e-132  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.156081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1095  RNA binding S1 domain protein  39.39 
 
 		 762 aa  471  1.0000000000000001e-131  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5424  RNA binding S1 domain protein  36.94 
 
 		 763 aa  470  1.0000000000000001e-131  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4177  RNA binding S1 domain protein  37.74 
 
 		 775 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00696361 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1875  Tex-like protein protein-like protein  37.54 
 
 		 719 aa  470  1.0000000000000001e-131  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6302  RNA binding S1 domain protein  36.95 
 
 		 760 aa  472  1.0000000000000001e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.820559  normal  0.459443 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3940  RNA binding S1 domain protein  39.36 
 
 		 721 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4944  RNA binding S1 domain protein  37.83 
 
 		 718 aa  469  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.840168 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2288  hypothetical protein  35.49 
 
 		 773 aa  468  9.999999999999999e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1339  RNA binding S1  34.9 
 
 		 802 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1021  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.81 
 
 		 707 aa  467  9.999999999999999e-131  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.974178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1085  RNA binding S1 domain protein  36.81 
 
 		 705 aa  466  9.999999999999999e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.972092 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0669  Tex-like protein protein-like protein  36.36 
 
 		 713 aa  466  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125717 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0235  S1 RNA-binding domain-containing protein  34.5 
 
 		 761 aa  462  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.707301  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1469  RNA binding S1 domain protein  35.98 
 
 		 717 aa  465  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2945  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.99 
 
 		 776 aa  462  9.999999999999999e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0681902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1924  RNA binding S1 domain protein  36.19 
 
 		 777 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0525601 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3247  RNA binding S1 domain protein  37.59 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.140684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2849  RNA binding S1 domain protein  37.59 
 
 		 719 aa  460  9.999999999999999e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1819  putative tex protein  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1181  RNA-binding S1 domain-containing protein  38.06 
 
 		 720 aa  457  1e-127  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0767  RNA-binding S1 domain-containing protein  36.38 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1680  RNA binding S1 domain-containing protein  34.54 
 
 		 784 aa  458  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.162131 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1329  transcription accessory protein, TEX  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.279069  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0100  RNA binding S1:resolvase, RNase H-like fold  34.38 
 
 		 777 aa  458  1e-127  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2339  transcription accessory protein, TEX  36.02 
 
 		 821 aa  458  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.367712  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1303  RNA binding S1  36.13 
 
 		 765 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.493241  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0077  putative tex protein  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1091  putative tex protein  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.27369  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1406  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.77 
 
 		 780 aa  457  1e-127  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.252881  decreased coverage  0.0000000874326 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1609  S1 RNA-binding domain-containing protein  34.9 
 
 		 781 aa  456  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.217486  normal  0.534196 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2212  putative tex protein  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2252  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.71 
 
 		 757 aa  456  1e-127  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000694259  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001874  transcription accessory protein  33.79 
 
 		 773 aa  457  1e-127  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1685  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.76 
 
 		 723 aa  457  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1810  RNA-binding S1 domain-containing protein  37.09 
 
 		 728 aa  457  1e-127  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.547595  normal  0.164556 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2174  putative tex protein  35.81 
 
 		 774 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3421  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.56 
 
 		 788 aa  457  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.507063  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2912  Tex-like protein  33.75 
 
 		 797 aa  452  1.0000000000000001e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.336311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1623  putative transcription accessory protein  36.51 
 
 		 779 aa  455  1.0000000000000001e-126  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1942  RNA-binding S1 domain-containing protein  34.2 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0410513  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0356  Tex-like protein protein-like protein  35.1 
 
 		 703 aa  455  1.0000000000000001e-126  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2744  RNA binding S1  34.25 
 
 		 772 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2527  RNA binding S1 domain protein  34.76 
 
 		 782 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.197314  hitchhiker  0.0000000921984 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1585  RNA binding S1  35.86 
 
 		 790 aa  454  1.0000000000000001e-126  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1596  RNA binding S1 domain protein  36.18 
 
 		 788 aa  456  1.0000000000000001e-126  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.702606  normal  0.0459363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1232  RNA binding S1  34.62 
 
 		 787 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.821312  normal  0.0934617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1822  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.81 
 
 		 815 aa  450  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.569031 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5099  RNA binding S1  35.66 
 
 		 774 aa  450  1e-125  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.83854 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1792  putative transcription accessory protein  35 
 
 		 793 aa  449  1e-125  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.781108  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2544  RNA binding S1 domain protein  35.36 
 
 		 762 aa  452  1e-125  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.493353  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2248  transcription accessory protein, TEX  35.65 
 
 		 775 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.673592  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1476  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.95 
 
 		 812 aa  451  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0738998 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6281  RNA binding S1  35.81 
 
 		 815 aa  452  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.319798  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2650  RNA binding S1 domain protein  34.12 
 
 		 795 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00533816  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1798  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.81 
 
 		 774 aa  451  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0747  RNA binding S1 domain protein  38.43 
 
 		 699 aa  451  1e-125  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.338297  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1709  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.37 
 
 		 813 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1042  RNA-binding S1 domain-containing protein  35.42 
 
 		 794 aa  447  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.889463  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>