More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0017 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  100 
 
 		 265 aa  540  1e-153  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.82 
 
 		 457 aa  177  2e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  39.5 
 
 		 266 aa  176  3e-43  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 266 aa  175  5e-43  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  34.96 
 
 		 606 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  34.1 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  33.85 
 
 		 256 aa  165  8e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  37.79 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0992  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.313199  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1106  hydrolase, TatD family  33.99 
 
 		 257 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  33.85 
 
 		 259 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  34.87 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  34.87 
 
 		 256 aa  161  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  31.72 
 
 		 462 aa  160  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  34.1 
 
 		 255 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  34.35 
 
 		 268 aa  159  6e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  35.36 
 
 		 257 aa  158  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1967  TatD family deoxyribonuclease  32.83 
 
 		 260 aa  157  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000974137 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1532  TatD family hydrolase  32.08 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.117065  normal  0.38064 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3793  TatD family hydrolase  32.45 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.23197  normal  0.246181 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  32.09 
 
 		 462 aa  157  2e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  32.17 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  35.66 
 
 		 255 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.51 
 
 		 265 aa  156  3e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1989  hydrolase, TatD family  34.09 
 
 		 260 aa  155  6e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.727306  normal  0.0188315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1497  TatD family hydrolase  32.45 
 
 		 260 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.109711  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32480  hydrolase, TatD family  34.96 
 
 		 285 aa  154  1e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0781  TatD family hydrolase  34.36 
 
 		 322 aa  154  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.063357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  34.22 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  34.62 
 
 		 257 aa  154  2e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0980  hydrolase, TatD family  32.95 
 
 		 276 aa  154  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  32.95 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  37.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  37.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3965  TatD-related deoxyribonuclease  33.97 
 
 		 274 aa  153  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.659781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.25 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.64 
 
 		 255 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  33.46 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  34.6 
 
 		 256 aa  153  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0090  hydrolase, TatD family  36.54 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00880503  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  35.27 
 
 		 255 aa  152  5e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  35.27 
 
 		 255 aa  152  5.9999999999999996e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2184  hydrolase, TatD family  30.97 
 
 		 263 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.124679  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  30.68 
 
 		 458 aa  152  7e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  31.42 
 
 		 458 aa  151  8.999999999999999e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3858  TatD family hydrolase  37.79 
 
 		 275 aa  151  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1551  Mg-dependent DNase  34.5 
 
 		 274 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  34.21 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  36.47 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  36.86 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1654  ATPase  33.07 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.544583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  36.47 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  32.82 
 
 		 261 aa  150  2e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  31.92 
 
 		 461 aa  150  2e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  34.11 
 
 		 257 aa  149  3e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.35 
 
 		 258 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0766  TatD family hydrolase  37.61 
 
 		 274 aa  149  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.288837  normal  0.0375057 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  36.86 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  37.09 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  33.2 
 
 		 464 aa  149  4e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1005  hydrolase TatD family  32.96 
 
 		 272 aa  149  5e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.567423  normal  0.108498 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  36.47 
 
 		 255 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1315  TatD-related deoxyribonuclease  30.6 
 
 		 258 aa  149  6e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.288431  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2641  hydrolase, TatD family  30.6 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0861989  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3900  TatD family hydrolase  32.96 
 
 		 262 aa  148  8e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000164799  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2545  hydrolase, TatD family  30.6 
 
 		 258 aa  148  8e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0902937  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0715  Mg-dependent DNase  36.23 
 
 		 258 aa  148  9e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.514357  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3824  deoxyribonuclease, TatD family  33.97 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0273387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  30.19 
 
 		 264 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  31.95 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  31.03 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0964  TatD family hydrolase  34.51 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.913879  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  34.96 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  34.47 
 
 		 271 aa  147  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  30.71 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  30.71 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  30.71 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25780  TatD family deoxyribonuclease  34.89 
 
 		 258 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.591757 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  30.83 
 
 		 267 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0398  TatD-related deoxyribonuclease  29.23 
 
 		 306 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  32.42 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0819  TatD family hydrolase  34.72 
 
 		 257 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.193936  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1913  putative metallodependent hydrolase  30.3 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000168502  hitchhiker  0.00000614927 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  32.44 
 
 		 259 aa  145  5e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  31.2 
 
 		 267 aa  145  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2448  TatD family hydrolase  30.45 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0109125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  35.32 
 
 		 263 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0725  TatD family hydrolase  33.48 
 
 		 309 aa  145  8.000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00075899 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3626  TatD family hydrolase  30.77 
 
 		 264 aa  145  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.000292684  normal  0.319005 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0660  hydrolase, TatD family  34.7 
 
 		 266 aa  145  9e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0516456  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1655  TatD-related deoxyribonuclease  33.33 
 
 		 261 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0399887  normal  0.199974 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3167  TatD family hydrolase  33.88 
 
 		 285 aa  145  9e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0774  hydrolase, TatD family  30.77 
 
 		 271 aa  144  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0818  TatD family hydrolase  31.99 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  33.46 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  32.95 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2260  TatD-related deoxyribonuclease  31.15 
 
 		 263 aa  143  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.225663  normal  0.492402 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2080  TatD family hydrolase  32.45 
 
 		 264 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.231197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>