More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0010 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0010  50S ribosomal protein L10  100 
 
 
166 aa  339  1e-92  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.76481  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2722  ribosomal protein L10  42.58 
 
 
170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0525449  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0562  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000233555  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0576  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
166 aa  127  7.000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000179203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5206  50S ribosomal protein L10  44.23 
 
 
166 aa  127  9.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000252117  unclonable  5.898740000000001e-26 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0180  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0693527  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0093  50S ribosomal protein L10  42.5 
 
 
166 aa  126  1.0000000000000001e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000759135  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0099  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000477259  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0099  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000073314  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0095  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  8.69083e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0093  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000338487  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0099  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.000000000000718586  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0110  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.02318e-62 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0120  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0130  50S ribosomal protein L10  43.59 
 
 
166 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000124346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0361  50S ribosomal protein L10  44.3 
 
 
190 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000502234  hitchhiker  0.0000804712 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0094  50S ribosomal protein L10  42.95 
 
 
166 aa  122  2e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000793252  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0096  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
166 aa  121  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1302  50S ribosomal protein L10  39.74 
 
 
166 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000076628  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0100  50S ribosomal protein L10  38.75 
 
 
166 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000689021  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0567  50S ribosomal protein L10  38.96 
 
 
167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00969269  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1417  50S ribosomal protein L10  37.97 
 
 
197 aa  110  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000013127  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1387  50S ribosomal protein L10  36.08 
 
 
171 aa  106  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000123079  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0313  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
166 aa  98.6  4e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000558823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0276  50S ribosomal protein L10  35.29 
 
 
175 aa  96.3  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000204852  hitchhiker  0.000495958 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0271  50S ribosomal protein L10  33.76 
 
 
178 aa  95.5  3e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00121092  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2470  50S ribosomal protein L10  33.14 
 
 
176 aa  89  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0147283  hitchhiker  0.00682166 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0310  ribosomal protein L10  30.91 
 
 
176 aa  89  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.109625  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0067  50S ribosomal protein L10  32.93 
 
 
165 aa  88.2  5e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2724  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
166 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000159716  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2410  50S ribosomal protein L10  33.12 
 
 
166 aa  87.4  8e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000332682  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01070  ribosomal protein L10  35.48 
 
 
172 aa  86.7  1e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.51299e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1325  ribosomal protein L10  33.56 
 
 
256 aa  86.7  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0213  ribosomal protein L10  29.76 
 
 
175 aa  85.1  4e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.623588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0408  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 
174 aa  84.7  5e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.79305e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1821  ribosomal protein L10  31.54 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0183  ribosomal protein L10  30.91 
 
 
176 aa  82.8  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000324199  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20980  LSU ribosomal protein L10P  33.33 
 
 
203 aa  81.3  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.996084  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0351  50S ribosomal protein L10  31.41 
 
 
159 aa  80.9  0.000000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00255818  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2850  50S ribosomal protein L10  33.77 
 
 
165 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675463 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3691  ribosomal protein L10  30.82 
 
 
164 aa  80.5  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0464  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0359791  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0179  50S ribosomal protein L10  31.72 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.215322  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1372  50S ribosomal protein L10  28.86 
 
 
178 aa  79.7  0.00000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0205  50S ribosomal protein L10  32.9 
 
 
181 aa  79.3  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000665859  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0479  50S ribosomal protein L10  30.29 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.488036  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2423  50S ribosomal protein L10  29.68 
 
 
205 aa  79  0.00000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0389  ribosomal protein L10  31.43 
 
 
174 aa  79  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3437  50S ribosomal protein L10  31.82 
 
 
165 aa  78.2  0.00000000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153429  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0698  50S ribosomal protein L10  35.57 
 
 
228 aa  78.2  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0571  50S ribosomal protein L10  30.91 
 
 
187 aa  78.2  0.00000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29850  LSU ribosomal protein L10P  34.59 
 
 
176 aa  77.8  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl602  50S ribosomal protein L10  30.49 
 
 
166 aa  77.8  0.00000000000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf208  ribosomal protein L10  32.89 
 
 
165 aa  77.8  0.00000000000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0310  50S ribosomal protein L10  30.77 
 
 
165 aa  77.4  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0746923  normal  0.0249908 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0239  50S ribosomal protein L10  33.81 
 
 
165 aa  76.6  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0229066 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0640  50S ribosomal protein L10  30.54 
 
 
169 aa  77  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.590803  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3654  50S ribosomal protein L10  34.53 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0512272  hitchhiker  0.000000643388 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17270  LSU ribosomal protein L10P  29.34 
 
 
173 aa  76.6  0.0000000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3078  50S ribosomal protein L10  33.81 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.892062  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0304  50S ribosomal protein L10  34.53 
 
 
167 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2702  50S ribosomal protein L10  38.1 
 
 
197 aa  75.9  0.0000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.107317 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3191  50S ribosomal protein L10  28.85 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579756  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0504  50S ribosomal protein L10  31.25 
 
 
180 aa  75.5  0.0000000000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  unclonable  0.0000000340487  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0317  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00438278  normal  0.203557 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2769  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0266  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
165 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.646007  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0338  50S ribosomal protein L10  31.17 
 
 
165 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550948  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0351  ribosomal protein L10  32.47 
 
 
160 aa  75.1  0.0000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0874946  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0172  50S ribosomal protein L10  31.54 
 
 
161 aa  75.1  0.0000000000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.33126  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3036  50S ribosomal protein L10  32.62 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0878547 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3157  ribosomal protein L10  31.79 
 
 
173 aa  75.5  0.0000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.290514 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0700  ribosomal protein L10  28.92 
 
 
174 aa  75.1  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.299689  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0479  ribosomal protein L10  30.07 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6637  ribosomal protein L10  31.58 
 
 
184 aa  74.7  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.858869  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0257  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
188 aa  74.7  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0591157  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2198  50S ribosomal protein L10  30.82 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000006  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000000455583  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0678  ribosomal protein L10  30.43 
 
 
190 aa  74.7  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2969  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.45658 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3316  50S ribosomal protein L10  32.17 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354504  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0838  50S ribosomal protein L10P  30.67 
 
 
172 aa  74.7  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0707377  normal  0.0995834 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2669  ribosomal protein L10  33.33 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.69004  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1784  50S ribosomal protein L10  31.46 
 
 
181 aa  74.3  0.0000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2643  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3788  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6059  50S ribosomal protein L10  29.94 
 
 
182 aa  73.9  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.749447  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1912  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
165 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000184172  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3467  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0108818  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3756  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
184 aa  73.9  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0407684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2990  50S ribosomal protein L10  37.7 
 
 
196 aa  73.9  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.302741  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3818  50S ribosomal protein L10  33.09 
 
 
184 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.881367  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1318  50S ribosomal protein L10  32.87 
 
 
161 aa  73.6  0.000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000548659  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2108  50S ribosomal protein L10  30.19 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.0000349119  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1124  ribosomal protein L10  33.09 
 
 
174 aa  72.4  0.000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2656  50S ribosomal protein L10  36.76 
 
 
175 aa  72.8  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.220618  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3594  50S ribosomal protein L10  30.97 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.196569  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2164  50S ribosomal protein L10P  29.52 
 
 
174 aa  72.8  0.000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0596262  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1529  ribosomal protein L10  26.49 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000554953  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2722  50S ribosomal protein L10P  28.74 
 
 
178 aa  73.2  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000000314918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2344  ribosomal protein L10  26.62 
 
 
173 aa  73.2  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.032292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>