276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0005 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011374  UUR10_0005  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  100 
 
 
186 aa  380  1e-105  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf655  hypothetical protein  34.87 
 
 
157 aa  85.9  3e-16  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1012  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.64 
 
 
216 aa  84.3  8e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.837821  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3718  translation factor SUA5  29.48 
 
 
216 aa  84.3  9e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1547  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.69 
 
 
198 aa  82.8  0.000000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1975  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.05 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.213074  normal  0.800217 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0888  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.94 
 
 
193 aa  80.1  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1466  normal  0.824188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29640  translation factor SUA5  28.34 
 
 
216 aa  77  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1260  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.55 
 
 
241 aa  76.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00492608 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0755  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  33.13 
 
 
189 aa  74.3  0.0000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.995605  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0134  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.11 
 
 
193 aa  73.6  0.000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.17546 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1440  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.68 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.27 
 
 
183 aa  71.6  0.000000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.737949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3928  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.16 
 
 
216 aa  71.6  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.673712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1307  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.48 
 
 
217 aa  71.2  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.816543 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03441  putative translation factor (SUA5)  29.44 
 
 
193 aa  71.2  0.000000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0325  hypothetical protein  29.89 
 
 
193 aa  70.5  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1696  putative translation factor (SUA5)  29.03 
 
 
191 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.802373  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04101  putative translation factor (SUA5)  29.03 
 
 
199 aa  70.1  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.727997  normal  0.412346 
 
 
-
 
NC_002978  WD0820  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.61 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.130442  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.14 
 
 
335 aa  69.3  0.00000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2617  translation factor SUA5  30.05 
 
 
245 aa  69.7  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0742122  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0477  hypothetical protein  31.07 
 
 
199 aa  68.9  0.00000000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0075  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  31.14 
 
 
335 aa  68.9  0.00000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000138931  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1911  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.44 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0227431  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0641  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.57 
 
 
209 aa  68.2  0.00000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00392606  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03431  putative translation factor (SUA5)  29.94 
 
 
193 aa  68.2  0.00000000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.426234  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21600  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.83 
 
 
202 aa  67.8  0.00000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.695386  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1710  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.94 
 
 
196 aa  67  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.200019  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0890  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.98 
 
 
215 aa  67  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0643  translation factor SUA5  26.57 
 
 
219 aa  67.4  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.17897 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4337  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.81 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.635565  normal  0.0996287 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl630  putative translation factor  32 
 
 
168 aa  66.6  0.0000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.948941  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1643  SUA5/yciO/yrdC-like  24.61 
 
 
197 aa  66.2  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.434522  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11328  hypothetical protein  27.12 
 
 
217 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4507  putative ribosome maturation factor  28.02 
 
 
189 aa  66.2  0.0000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000123843  hitchhiker  0.00015333 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2309  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.81 
 
 
221 aa  65.9  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.569528 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2417  translation factor SUA5  29.75 
 
 
259 aa  65.9  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.909334  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0460  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.04 
 
 
198 aa  65.1  0.0000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1897  putative translation factor  31.03 
 
 
224 aa  65.1  0.0000000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1289  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.42 
 
 
338 aa  65.1  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.52734 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03511  putative translation factor (SUA5)  32.26 
 
 
193 aa  64.3  0.0000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1063  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.06 
 
 
236 aa  64.3  0.0000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_739  translation factor SUA5  27.66 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000652312  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2902  hypothetical protein  30.48 
 
 
322 aa  64.3  0.0000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2350  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.89 
 
 
266 aa  64.3  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00004285 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0326  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.48 
 
 
261 aa  64.3  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.11023 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1783  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.9 
 
 
246 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.37756  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2457  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.57 
 
 
236 aa  63.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3044  hypothetical protein  29.95 
 
 
322 aa  62.8  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09940  translation factor SUA5  27.32 
 
 
251 aa  62.8  0.000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19220  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.16 
 
 
347 aa  62.8  0.000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0281  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.94 
 
 
358 aa  62.4  0.000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000413141 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0956  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  27.98 
 
 
195 aa  61.2  0.000000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000001258  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0835  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.47 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000200463  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0044  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.19 
 
 
185 aa  60.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.268227  normal  0.36574 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0562  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  31.15 
 
 
180 aa  60.8  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.440322  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3885  translation factor SUA5  28.81 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0609362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1650  translation factor SUA5  31.93 
 
 
191 aa  60.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2418  translation factor SUA5  29.57 
 
 
321 aa  60.5  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.85919  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0754  translation factor SUA5  25.88 
 
 
213 aa  60.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00690198  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3871  translation factor SUA5  28.81 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.461302  normal  0.0428509 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3959  translation factor SUA5  28.81 
 
 
218 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4831  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.4 
 
 
348 aa  59.7  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0105572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2612  translation factor SUA5  27.47 
 
 
215 aa  59.7  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1238  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.14 
 
 
216 aa  59.7  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03541  putative translation factor (SUA5)  26.47 
 
 
196 aa  59.3  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0436  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.42 
 
 
191 aa  59.7  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.175853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0046  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.76 
 
 
202 aa  59.3  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.79 
 
 
224 aa  59.3  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1485  SUA5/yciO/yrdC-like  24.86 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.189806  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1598  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.49 
 
 
331 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08090  translation factor SUA5  26.63 
 
 
244 aa  58.5  0.00000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18310  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.4 
 
 
440 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.373422  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2464  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.52 
 
 
350 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2174  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.52 
 
 
350 aa  58.2  0.00000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0143173  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2152  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.44 
 
 
357 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2190  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.44 
 
 
357 aa  57.8  0.00000008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.970506  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0257  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.15 
 
 
359 aa  57.8  0.00000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00354892  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4181  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.95 
 
 
343 aa  57.8  0.00000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000833844  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1753  translation factor SUA5  25.52 
 
 
219 aa  57.8  0.00000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.716353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6146  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.22 
 
 
216 aa  57.4  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244825  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0607  Sua5/YciO/YrdC/YwlC  26.7 
 
 
364 aa  57.4  0.0000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.97472  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0404  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  24.61 
 
 
199 aa  56.6  0.0000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.459689  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4023  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.19 
 
 
214 aa  56.6  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000551399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1658  Sua5_yciO_yrdC, YrdC domain protein  27.81 
 
 
221 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0774  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  28.02 
 
 
205 aa  57  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2595  translation factor SUA5  28.31 
 
 
351 aa  56.6  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0328746  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0715  translation factor SUA5  27.91 
 
 
318 aa  55.8  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1857  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.37 
 
 
322 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2103  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.42 
 
 
216 aa  55.8  0.0000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00188792  normal  0.0603823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2993  SUA5/YciO/YrdC family translation initiation protein  27.27 
 
 
315 aa  55.5  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2151  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  25.95 
 
 
358 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1208  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  30.34 
 
 
192 aa  55.1  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4970  SUA5/yciO/yrdC domain-containing protein  22.4 
 
 
192 aa  54.7  0.0000007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109001  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22041  putative translation factor (SUA5)  25.81 
 
 
196 aa  54.7  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12180  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.31 
 
 
220 aa  54.7  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.821155  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0481  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  29.38 
 
 
324 aa  54.7  0.0000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1308  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.16 
 
 
216 aa  54.7  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.283902 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1031  Sua5/YciO/YrdC/YwlC family protein  26.49 
 
 
202 aa  54.7  0.0000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.182295 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>