139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene UUR10_0002 on replicon NC_011374
Organism: Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011374  UUR10_0002  50S ribosomal protein L31  100 
 
 		 95 aa  193  6e-49  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2402  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.115749  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf449  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1009  50S ribosomal protein L31  40.62 
 
 		 78 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.622612  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2999  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 74 aa  50.1  0.000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00163219  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl638  50S ribosomal protein L31  42.42 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0604  50S ribosomal protein L31P  40.3 
 
 		 71 aa  49.7  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1861  50S ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 72 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.985858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0640  50S ribosomal protein L31P  40.62 
 
 		 86 aa  48.9  0.00002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.045358 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0751  ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 67 aa  49.3  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000224583  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4125  ribosomal protein L31  38.81 
 
 		 71 aa  49.3  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.00000000665259  hitchhiker  0.000000407647 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0385  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 75 aa  49.3  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000143362  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0327  50S ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 70 aa  48.5  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.127242  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3721  50S ribosomal protein L31  40.62 
 
 		 78 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0887  50S ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.310372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2252  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 72 aa  48.1  0.00004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.200856  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18350  LSU ribosomal protein L31P  36.92 
 
 		 71 aa  47.8  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.414858  normal  0.888151 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2073  50S ribosomal protein L31  35.38 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000000264126  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2744  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 72 aa  47.8  0.00006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0733  50S ribosomal protein L31  37.93 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.243379  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2209  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 74 aa  47.4  0.00007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0444024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2060  50S ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 75 aa  47.4  0.00007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.725226  normal  0.0217721 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0349  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 75 aa  46.6  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000414614  normal  0.989516 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3438  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 66 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1888  50S ribosomal protein L31  35.38 
 
 		 70 aa  47  0.0001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0909823  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1504  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 67 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.063569  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0163  ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0237125  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0140  50S ribosomal protein L31  32.94 
 
 		 92 aa  45.4  0.0002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001744  LSU ribosomal protein L31p  36.92 
 
 		 73 aa  46.2  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00827277  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2967  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000717812  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2460  ribosomal protein L31  35.94 
 
 		 71 aa  45.4  0.0003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1910  ribosomal protein L31  41.54 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0411  ribosomal protein L31  40 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2156  ribosomal protein L31  34.85 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000333298  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1204  ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 72 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.72511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2420  50S ribosomal protein L31  39.68 
 
 		 69 aa  44.7  0.0005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.534743  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1712  ribosomal protein L31  38.24 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00361207  normal  0.842415 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1750  50S ribosomal protein L31  36.92 
 
 		 75 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.45187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1655  50S ribosomal protein L31  39.06 
 
 		 72 aa  44.3  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00728  50S ribosomal protein L31  35.38 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3328  50S ribosomal protein L31  36.51 
 
 		 66 aa  44.7  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000410329  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0471  ribosomal protein L31  33.85 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000394944  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0061  50S ribosomal protein L31  35.38 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000149068  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2381  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00476114  normal  0.0805503 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03821  50S ribosomal subunit protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4049  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03770  hypothetical protein  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0536  50S ribosomal protein L31 type B  28.57 
 
 		 86 aa  43.9  0.0008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000345186  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0453  50S ribosomal protein L31  35.82 
 
 		 71 aa  43.9  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1087  ribosomal protein L31  34.92 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0220  ribosomal protein L31  32.1 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.109309  normal  0.0100844 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4168  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4472  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4082  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4378  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.427206 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4419  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5394  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.948116  normal  0.943424 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0223  ribosomal protein L31  32.1 
 
 		 82 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0787  50S ribosomal protein L31 type B  27.63 
 
 		 80 aa  43.5  0.0009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4365  50S ribosomal protein L31  37.31 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0039  50S ribosomal protein L31  36.51 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.196539 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0243  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1983  50S ribosomal protein L31  32.84 
 
 		 79 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0498133  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0323  ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 69 aa  43.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.100308 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0165  ribosomal protein L31  42.55 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4188  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 71 aa  43.1  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4037  50S ribosomal protein L31  36.36 
 
 		 70 aa  43.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3932  ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 73 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3807  50S ribosomal protein L31  36.25 
 
 		 72 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1997  50S ribosomal protein L31  35.94 
 
 		 72 aa  43.5  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.285312  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1101  50S ribosomal protein L31  30.38 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.707515  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0348  50S ribosomal protein L31  32.84 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.555862 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0689  50S ribosomal protein L31  40 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.649908  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0062  ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 68 aa  42.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000350095  hitchhiker  0.00194298 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2250  50S ribosomal protein L31 type B  31.17 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19761  50S ribosomal protein L31  28.57 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0818  ribosomal protein L31  32 
 
 		 76 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000168077  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2003  ribosomal protein L31  29.21 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14904  normal  0.58507 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0536  50S ribosomal protein L31  37.88 
 
 		 70 aa  42.7  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0378  50S ribosomal protein L31  37.5 
 
 		 71 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0929  50S ribosomal protein L31  36.51 
 
 		 115 aa  42.7  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000140602  hitchhiker  1.58847e-17 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18000  ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000315531  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1026  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000398278  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0808  ribosomal protein L31  35.82 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1908  ribosomal protein L31  34.67 
 
 		 75 aa  42.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.188174  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0659  ribosomal protein L31  35.82 
 
 		 68 aa  42.7  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2650  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 66 aa  42  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000000189789  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1256  ribosomal protein L31  34.92 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0693718  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0971  50S ribosomal protein L31  32.5 
 
 		 79 aa  42  0.003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0122987  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2100  ribosomal protein L31  34.92 
 
 		 70 aa  41.6  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00185823  normal  0.0569563 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1042  50S ribosomal protein L31  32.5 
 
 		 79 aa  42  0.003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.601276  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0090  50S ribosomal protein L31  38.46 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141122  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2792  ribosomal protein L31  32.31 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0401  50S ribosomal protein L31  39.39 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.584711 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1910  50S ribosomal protein L31  33.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3493  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0459  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3670  50S ribosomal protein L31  38.1 
 
 		 70 aa  41.2  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1352  50S ribosomal protein L31  35.82 
 
 		 75 aa  41.6  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0268891  normal  0.195983 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11325  50S ribosomal protein L31  32.81 
 
 		 80 aa  41.6  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0128784  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>