More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2833 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0096  lipoic acid synthetase  100 
 
 
303 aa  614  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2833  lipoic acid synthetase  100 
 
 
303 aa  614  1e-175  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2548  lipoyl synthase  65.02 
 
 
321 aa  401  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1757  lipoyl synthase  61.37 
 
 
308 aa  364  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.43043  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4487  lipoyl synthase  56.77 
 
 
304 aa  359  3e-98  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.748624 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0124  lipoyl synthase  58.1 
 
 
298 aa  348  5e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00208739  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5116  lipoyl synthase  58.25 
 
 
298 aa  348  8e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00190183  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3568  lipoyl synthase  57.69 
 
 
298 aa  347  1e-94  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4840  lipoyl synthase  57.89 
 
 
298 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000478803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4682  lipoyl synthase  57.89 
 
 
298 aa  347  1e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000492626  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5076  lipoyl synthase  57.89 
 
 
298 aa  347  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5205  lipoyl synthase  57.89 
 
 
298 aa  347  1e-94  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.745622  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5109  lipoyl synthase  58.57 
 
 
298 aa  345  4e-94  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4698  lipoyl synthase  58.57 
 
 
298 aa  345  4e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000012904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5114  lipoyl synthase  58.57 
 
 
298 aa  345  4e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000010765  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4796  lipoyl synthase  57.54 
 
 
298 aa  345  7e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000356063  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0893  lipoyl synthase  53.93 
 
 
298 aa  332  4e-90  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000403544  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2906  lipoyl synthase  57.45 
 
 
298 aa  332  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2644  lipoyl synthase  60.95 
 
 
276 aa  332  7.000000000000001e-90  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1266  lipoic acid synthetase  55.44 
 
 
308 aa  331  1e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0917009  normal  0.305027 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3051  lipoyl synthase  58.06 
 
 
298 aa  330  2e-89  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0511  lipoyl synthase  54.8 
 
 
304 aa  326  3e-88  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0743  lipoic acid synthetase  55.9 
 
 
326 aa  325  8.000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0942  lipoyl synthase  54.09 
 
 
305 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0923  lipoyl synthase  54.09 
 
 
305 aa  323  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.263103  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2195  lipoic acid synthetase  57.04 
 
 
328 aa  323  3e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2036  lipoyl synthase  53.79 
 
 
282 aa  322  4e-87  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3099  lipoic acid synthetase  55.09 
 
 
305 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0244326  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0346  lipoyl synthase  53.33 
 
 
309 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2080  lipoyl synthase  54.35 
 
 
298 aa  316  2e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.111304  normal  0.264728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0227  lipoyl synthase  52.71 
 
 
288 aa  317  2e-85  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.336471  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07861  lipoyl synthase  50.9 
 
 
290 aa  315  6e-85  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1041  lipoyl synthase  52.51 
 
 
320 aa  312  3.9999999999999997e-84  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.456596  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3138  lipoyl synthase  54.74 
 
 
333 aa  312  3.9999999999999997e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.718204  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2640  Lipoyl synthase  54.21 
 
 
309 aa  312  4.999999999999999e-84  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0291657  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0833  lipoic acid synthetase  56.68 
 
 
335 aa  311  6.999999999999999e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2970  lipoyl synthase  53.87 
 
 
321 aa  311  1e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0207097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1771  lipoic acid synthetase  55.96 
 
 
324 aa  310  2e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0949549  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1175  lipoyl synthase  52.82 
 
 
321 aa  310  2e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000143147  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1195  lipoyl synthase  52.82 
 
 
321 aa  310  2e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1779  lipoyl synthase  51.26 
 
 
299 aa  310  2.9999999999999997e-83  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2783  lipoyl synthase  52.51 
 
 
320 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1425  lipoyl synthase  52.51 
 
 
320 aa  309  4e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0392901 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1263  lipoic acid synthetase  53 
 
 
337 aa  308  6.999999999999999e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.330421  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1281  lipoyl synthase  51.46 
 
 
311 aa  308  6.999999999999999e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3136  lipoyl synthase  51.06 
 
 
321 aa  308  8e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.732613 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0527  lipoyl synthase  53.71 
 
 
296 aa  308  8e-83  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.550501 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0116  lipoyl synthase  53.22 
 
 
334 aa  308  9e-83  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1086  lipoyl synthase  53.17 
 
 
321 aa  308  9e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00597  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.361475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2998  lipoic acid synthetase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448089  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0679  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215695  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0716  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000187845  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0648  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.017557  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0688  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0748  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.392718  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3156  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00586  hypothetical protein  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.367538  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0674  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00338135  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0734  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0542  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0792  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.351097  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0652  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000125268  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3017  lipoyl synthase  52.46 
 
 
321 aa  307  1.0000000000000001e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0056635  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1877  lipoyl synthase  51.9 
 
 
314 aa  306  2.0000000000000002e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.329271  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0537  lipoyl synthase  48.76 
 
 
299 aa  306  3e-82  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.587235  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1042  lipoyl synthase  53.29 
 
 
301 aa  306  3e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.984199  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1024  lipoyl synthase  50.91 
 
 
280 aa  306  3e-82  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3897  lipoyl synthase  51.21 
 
 
317 aa  306  4.0000000000000004e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.972193  normal  0.576703 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0165  lipoyl synthase  53.26 
 
 
329 aa  305  5.0000000000000004e-82  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0827434  hitchhiker  0.00380091 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3704  lipoic acid synthetase  53.26 
 
 
321 aa  305  6e-82  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.442827  normal  0.203536 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2955  lipoyl synthase  51.76 
 
 
321 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000378828  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3027  lipoyl synthase  51.76 
 
 
321 aa  305  7e-82  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.200618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1855  lipoyl synthase  51.76 
 
 
321 aa  305  7e-82  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000137205  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1163  lipoyl synthase  52.5 
 
 
321 aa  305  8.000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.924523  normal  0.342744 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2629  lipoyl synthase  55.2 
 
 
324 aa  305  8.000000000000001e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3202  lipoyl synthase  49.3 
 
 
292 aa  304  1.0000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2226  lipoyl synthase  51.42 
 
 
315 aa  304  1.0000000000000001e-81  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0487133  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0701  lipoyl synthase  49.82 
 
 
291 aa  304  1.0000000000000001e-81  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0533  lipoyl synthase  49.82 
 
 
347 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1598  lipoyl synthase  49.82 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000295116 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3561  lipoyl synthase  53.85 
 
 
329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.4266  normal  0.0304655 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2299  lipoyl synthase  54.21 
 
 
316 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1129  lipoyl synthase  54.48 
 
 
306 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0246702 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10420  lipoyl synthase  53.55 
 
 
333 aa  303  3.0000000000000004e-81  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.171036  normal  0.0249814 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1762  lipoyl synthase  56.25 
 
 
296 aa  302  4.0000000000000003e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0164606  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1083  lipoyl synthase  50.69 
 
 
323 aa  302  4.0000000000000003e-81  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1583  lipoyl synthase  51.21 
 
 
316 aa  302  6.000000000000001e-81  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.681458  normal  0.0313019 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1371  lipoyl synthase  50.52 
 
 
330 aa  302  6.000000000000001e-81  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.113855  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2751  lipoyl synthase  50 
 
 
351 aa  301  6.000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.0114913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1966  lipoyl synthase  49.1 
 
 
304 aa  301  7.000000000000001e-81  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000000953811  normal  0.439511 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3370  lipoic acid synthetase  52.28 
 
 
324 aa  301  7.000000000000001e-81  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1774  lipoyl synthase  54.58 
 
 
328 aa  301  8.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.181485 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0062  lipoyl synthase  49.47 
 
 
335 aa  301  8.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5917  lipoyl synthase  54.32 
 
 
328 aa  301  8.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0392  lipoyl synthase  48.57 
 
 
287 aa  301  9e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0538  lipoyl synthase  50 
 
 
317 aa  301  9e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0149329  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2501  lipoyl synthase  50.88 
 
 
325 aa  301  1e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.698153  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4893  lipoic acid synthetase  52.38 
 
 
311 aa  301  1e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1376  lipoyl synthase  50.52 
 
 
315 aa  301  1e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>