10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2808 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2808  O-antigen polymerase  100 
 
 		 494 aa  978    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3078  O-antigen polymerase  24.42 
 
 		 500 aa  52.8  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2459  O-antigen polymerase  26.49 
 
 		 437 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3113  O-antigen polymerase  22.64 
 
 		 467 aa  48.5  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000000265772  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3077  O-antigen polymerase  25.68 
 
 		 504 aa  48.1  0.0004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3579  O-antigen polymerase  23.76 
 
 		 501 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18850  O-antigen polymerase  25.38 
 
 		 393 aa  46.2  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0065  O-antigen polymerase  28.83 
 
 		 502 aa  44.7  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.321315  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1955  O-antigen polymerase  28.28 
 
 		 468 aa  44.7  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.324728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2338  O-antigen polymerase  28.57 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>