62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2671 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2671  ABC-2 type transporter  100 
 
 		 372 aa  728    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000231405  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0856  ABC-2 type transporter, permease protein  26.3 
 
 		 368 aa  70.1  0.00000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2850  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.146675  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0846  ABC-2 type transporter, permease protein  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00759  predicted transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2851  ABC-2 type transporter  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579888 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0814  ABC-2 type transporter, permease protein  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.547864  normal  0.91145 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2561  ABC-2 type transporter, permease protein  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0939  ABC-2 type transporter, permease protein  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00776  hypothetical protein  26.91 
 
 		 368 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1283  ABC-2 type transporter  26.25 
 
 		 368 aa  66.6  0.0000000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0942  ABC-2 type transporter, permease  25.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0820172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0878  ABC-2 type transporter, permease protein  25.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0963  ABC-2 type transporter permease  25.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0850  ABC-2 type transporter, permease protein  25.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0910  ABC transporter permease  25.91 
 
 		 368 aa  65.1  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.881818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0255  ABC-2 type transporter  25.16 
 
 		 357 aa  63.2  0.000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1326  ABC-2 type transporter  26.13 
 
 		 368 aa  62.4  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2903  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.751562  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2815  ABC transporter, permease protein  25.93 
 
 		 368 aa  62  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0114  ABC transporter, substrate-binding protein, putative  25.57 
 
 		 357 aa  60.5  0.00000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5546  ABC-2 type transporter  28.74 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000580029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2919  ABC-2 type transporter  26.1 
 
 		 368 aa  56.6  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.856849  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0601  putative ABC-2 type transport system permease protein  24.25 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3069  ABC-2 type transporter  25.58 
 
 		 373 aa  55.8  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.669525  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5374  putative ABC transporter, permease protein  28.89 
 
 		 234 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0186467 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1529  ABC-type Na+ efflux pump, permease component  24.57 
 
 		 409 aa  55.1  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.508402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_123  ABC transporter, type 2, substrate-binding protein  24.26 
 
 		 357 aa  54.3  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4983  ABC transporter, permease  28.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.209432  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0255  ABC-2 type transporter  26.55 
 
 		 373 aa  53.1  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.889591 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2423  ABC-2 type transporter  24.92 
 
 		 366 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0514426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5132  ABC transporter permease  28.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5525  ABC transporter permease  28.89 
 
 		 234 aa  53.1  0.000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5404  putative ABC transporter, permease protein  31.25 
 
 		 234 aa  52.8  0.000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00753294  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3114  ABC transporter, inner membrane subunit  27.83 
 
 		 380 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4965  ABC transporter, permease  28.89 
 
 		 234 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000124148  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5081  ABC-2 type transporter  30.19 
 
 		 234 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0143169  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0520  ABC-2 type transporter  25.63 
 
 		 349 aa  50.8  0.00004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2449  ABC-type multidrug transport system permease component  23.56 
 
 		 369 aa  50.8  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5459  putative ABC transporter, permease protein  28.33 
 
 		 234 aa  50.4  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00659493  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0115  ABC transporter, permease protein, putative  31.69 
 
 		 352 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0112  ABC-2 type transporter  23.44 
 
 		 372 aa  48.9  0.0002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0225544  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_124  ABC transporter, type 2, permease protein  30.6 
 
 		 352 aa  48.5  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0976  ABC-2 type transporter  25.55 
 
 		 377 aa  47.4  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2826  hypothetical protein  22.96 
 
 		 376 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2825  hypothetical protein  25.63 
 
 		 377 aa  47  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0254  ABC-2 type transporter  30.6 
 
 		 352 aa  46.6  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1899  hypothetical protein  21.88 
 
 		 379 aa  46.2  0.0008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5408  ABC transporter, permease protein, putative  28.67 
 
 		 235 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.298823  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0521  ABC-2 type transporter  24.05 
 
 		 352 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0721  ABC-2 type transporter  20.8 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00179914  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3802  ABC-2 type transporter  31.39 
 
 		 235 aa  44.7  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.589167  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1037  hypothetical protein  26.22 
 
 		 382 aa  45.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.209314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0858  hypothetical protein  23.45 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.137935  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3223  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 380 aa  44.3  0.003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0649112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2808  ABC-2 type transporter  26.24 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.514512 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0810  ABC-2 type transporter  22.63 
 
 		 366 aa  43.9  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0811  ABC-2 type transporter  22.07 
 
 		 377 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3308  ABC-2 type transporter  31.62 
 
 		 380 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_701  ABC transporter, permease protein  21.6 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.222918  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1462  hypothetical protein  25.48 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0019  ABC-2 type transporter  29.23 
 
 		 373 aa  42.7  0.01  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>