More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2659 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2659  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 495 aa  998    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0361435  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3251  extracellular solute-binding protein family 1  49.12 
 
 		 427 aa  341  1e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.829082  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2049  extracellular solute-binding protein  40.71 
 
 		 435 aa  298  2e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3985  putative ABC sugar transporter (substrate binding protein)  41.39 
 
 		 419 aa  284  3.0000000000000004e-75  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0614  extracellular solute-binding protein family 1  40.65 
 
 		 435 aa  280  3e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11540  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  37.93 
 
 		 428 aa  278  1e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0159385 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2950  extracellular solute-binding protein  38.48 
 
 		 435 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.110397  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2719  extracellular solute-binding protein family 1  36.07 
 
 		 434 aa  273  5.000000000000001e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1126  extracellular solute-binding protein family 1  36.53 
 
 		 433 aa  268  1e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.162135  hitchhiker  0.000581091 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2072  extracellular solute-binding protein family 1  37.19 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.0000000238529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2762  extracellular solute-binding protein  36.8 
 
 		 431 aa  268  2e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3054  extracellular solute-binding protein family 1  38.5 
 
 		 429 aa  260  3e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0183103 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1874  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  37.75 
 
 		 427 aa  256  5e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0756635  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2404  extracellular solute-binding protein family 1  36.36 
 
 		 424 aa  253  5.000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000132449  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1685  extracellular solute-binding protein family 1  37.04 
 
 		 434 aa  249  8e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3052  extracellular solute-binding protein family 1  36.57 
 
 		 427 aa  248  2e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.854825  normal  0.208902 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1866  extracellular solute-binding protein family 1  36.16 
 
 		 434 aa  238  1e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  35.94 
 
 		 420 aa  229  7e-59  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3587  extracellular solute-binding protein family 1  34.92 
 
 		 441 aa  215  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.935518  normal  0.988969 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0944  extracellular solute-binding protein  36.16 
 
 		 422 aa  214  1.9999999999999998e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.544942  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1133  extracellular solute-binding protein family 1  33.5 
 
 		 451 aa  213  9e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0185  extracellular solute-binding protein family 1  34.48 
 
 		 436 aa  209  9e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.515223  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2754  extracellular solute-binding protein family 1  30.95 
 
 		 443 aa  197  3e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4017  extracellular solute-binding protein  32.91 
 
 		 435 aa  189  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0477  extracellular solute-binding protein family 1  33.25 
 
 		 432 aa  187  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.838392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1136  extracellular solute-binding protein family 1  28.43 
 
 		 431 aa  183  6e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  32.51 
 
 		 434 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0200  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 441 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  30.45 
 
 		 424 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23430  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  32.11 
 
 		 435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.969599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1105  extracellular solute-binding protein family 1  30.08 
 
 		 442 aa  165  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.314126  normal  0.258829 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0090  extracellular solute-binding protein  29.17 
 
 		 441 aa  159  8e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.214251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2716  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3573  extracellular solute-binding protein family 1  31.59 
 
 		 441 aa  157  3e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.862573  normal  0.0197328 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0972  extracellular solute-binding protein family 1  31 
 
 		 442 aa  153  5.9999999999999996e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2351  extracellular solute-binding protein  33.55 
 
 		 421 aa  150  6e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.576024  normal  0.167209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 451 aa  146  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0069  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 448 aa  145  1e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1025  extracellular solute-binding protein family 1  27.96 
 
 		 444 aa  144  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000399953  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01550  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  28.4 
 
 		 438 aa  142  9.999999999999999e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4880  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3285  extracellular solute-binding protein  29.73 
 
 		 412 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3251  extracellular solute-binding protein family 1  28.21 
 
 		 428 aa  142  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.292164  normal  0.0559218 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6324  extracellular solute-binding protein  32.33 
 
 		 412 aa  141  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5487  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000866815 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  32.42 
 
 		 417 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3196  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 419 aa  139  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.461238  normal  0.154514 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4932  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 419 aa  138  2e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0556288 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6024  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 412 aa  139  2e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4586  extracellular solute-binding protein family 1  31.92 
 
 		 417 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5201  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5658  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 420 aa  137  5e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0866592  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4577  extracellular solute-binding protein  31.73 
 
 		 419 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00216886 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3651  hypothetical protein  26.77 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.943877  normal  0.0762923 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3941  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  28.26 
 
 		 436 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.487085  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27700  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.44 
 
 		 426 aa  127  4.0000000000000003e-28  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 468 aa  126  1e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2016  extracellular solute-binding protein  26.22 
 
 		 408 aa  123  6e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00148299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0296  hypothetical protein  26.19 
 
 		 439 aa  123  8e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.77 
 
 		 424 aa  122  9.999999999999999e-27  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1248  extracellular solute-binding protein family 1  27.54 
 
 		 414 aa  120  7e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.494424  normal  0.639356 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3155  extracellular solute-binding protein family 1  32.06 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2391  extracellular solute-binding protein family 1  29.51 
 
 		 422 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.436445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5736  ABC transporter, substrate-binding protein  26.49 
 
 		 410 aa  117  3e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.214535  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3304  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 431 aa  117  6e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1529  extracellular solute-binding protein  28.18 
 
 		 439 aa  116  6.9999999999999995e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0626  extracellular solute-binding protein  27.7 
 
 		 408 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000892518  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2502  extracellular solute-binding protein family 1  25.95 
 
 		 493 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2008  ABC transporter extracellular solute-binding protein  25.45 
 
 		 408 aa  114  3e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.247518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1184  ABC transporter, substrate-binding protein  28.23 
 
 		 413 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.186568  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2818  carbohydrate ABC transporter periplasmic binding protein  28.23 
 
 		 399 aa  114  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1301  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  30.15 
 
 		 441 aa  114  6e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13200  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 424 aa  111  3e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1924  extracellular solute-binding protein  28.83 
 
 		 415 aa  106  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.121968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0208  extracellular solute-binding protein family 1  28.72 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1174  extracellular solute-binding protein  27.93 
 
 		 455 aa  103  6e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.273661  normal  0.401546 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0621  extracellular solute-binding protein  25.6 
 
 		 427 aa  103  8e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.178997  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3483  extracellular solute-binding protein  23.24 
 
 		 417 aa  103  9e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2115  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 432 aa  102  2e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.845793  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0238  extracellular solute-binding protein family 1  26.92 
 
 		 423 aa  101  3e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2572  extracellular solute-binding protein  25.68 
 
 		 414 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1808  extracellular solute-binding protein family 1  28.75 
 
 		 414 aa  100  6e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0803  extracellular solute-binding protein  28.32 
 
 		 435 aa  99.4  1e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0818  extracellular solute-binding protein  28.8 
 
 		 415 aa  99.4  1e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2306  extracellular solute-binding protein family 1  26.96 
 
 		 432 aa  97.4  5e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.432824  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.8 
 
 		 380 aa  97.1  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.283496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09490  extracellular solute-binding protein family 1  29.7 
 
 		 424 aa  97.1  7e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.48456e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1291  extracellular solute-binding protein family 1  27.51 
 
 		 470 aa  97.1  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1862  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 430 aa  95.5  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.144249  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0598  extracellular solute-binding protein family 1  27.24 
 
 		 446 aa  95.9  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.764573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0127  extracellular solute-binding protein family 1  26.37 
 
 		 442 aa  94  6e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4454  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 466 aa  93.6  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2151  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 		 466 aa  92.8  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3169  extracellular solute-binding protein family 1  26.23 
 
 		 445 aa  92.8  1e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.187022 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  31.51 
 
 		 510 aa  92  2e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3838  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 420 aa  89.7  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.754768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3246  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 443 aa  88.6  2e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0184  extracellular solute-binding protein family 1  25.07 
 
 		 450 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1094  extracellular solute-binding protein  26.02 
 
 		 434 aa  87.4  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.161365  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8236  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.01 
 
 		 434 aa  87.4  6e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.953199  normal  0.764848 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>