279 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2623 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1148  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  48.36 
 
 
863 aa  738  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.064662  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8766  FO synthase  45.63 
 
 
857 aa  685  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.977085  normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0946  FO synthase  49.82 
 
 
860 aa  734  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4075  Radical SAM domain protein  47.68 
 
 
859 aa  726  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0900  Radical SAM domain protein  51.83 
 
 
757 aa  692  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.180074  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1376  FO synthase  48.68 
 
 
867 aa  726  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0975  FO synthase  64.81 
 
 
792 aa  966  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.156535  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4032  FO synthase  49.1 
 
 
859 aa  731  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.249392  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0888  FO synthase  49.94 
 
 
836 aa  751  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1483  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.57 
 
 
872 aa  741  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6472  FO synthase  48.33 
 
 
838 aa  705  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2623  Radical SAM domain protein  100 
 
 
800 aa  1630  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000614503  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0717  FO synthase  59.26 
 
 
779 aa  870  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00851827 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11198  FO synthase  48.48 
 
 
856 aa  711  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.152769  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4423  FO synthase  62.91 
 
 
820 aa  988  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.308289  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51122  predicted protein  54.64 
 
 
841 aa  805  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0345053 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3771  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  47.49 
 
 
875 aa  718  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3619  FO synthase  48.07 
 
 
841 aa  702  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0746  radical SAM domain-containing protein  50.18 
 
 
881 aa  709  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.331413 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2519  FO synthase  47.6 
 
 
871 aa  726  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.391262  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0863  FO synthase  48.24 
 
 
852 aa  729  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.241376  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4262  FO synthase  49.1 
 
 
859 aa  731  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0918112 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0814  FO synthase  49.1 
 
 
842 aa  734  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.333048  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4107  FO synthase  49.1 
 
 
859 aa  731  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4262  Radical SAM domain protein  55.56 
 
 
826 aa  816  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.296294  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4533  FO synthase  48.73 
 
 
859 aa  724  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.434673  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2167  FO synthase  48.54 
 
 
859 aa  720  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0462649 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13970  FO synthase subunit 1 /FO synthase subunit 2  43.5 
 
 
811 aa  560  1e-158  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.256326  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4165  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  41.16 
 
 
741 aa  497  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.358903  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4090  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.84 
 
 
737 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.0388859 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4147  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  39.37 
 
 
737 aa  468  1e-130  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.280737  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4049  FO synthase subunit 1  54.9 
 
 
392 aa  400  1e-110  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0769  FO synthase  58.54 
 
 
884 aa  399  1e-110  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0435943  normal  0.470763 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1115  radical SAM domain-containing protein  51.71 
 
 
418 aa  394  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4048  hypothetical protein  49.48 
 
 
429 aa  388  1e-106  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.129032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3324  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  53.23 
 
 
416 aa  382  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1114  FO synthase subunit 1  53.8 
 
 
380 aa  374  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.785548  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5865  FO synthase  50.28 
 
 
944 aa  374  1e-102  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342546  normal  0.564684 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0745  FO synthase  47.88 
 
 
899 aa  373  1e-102  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4252  Radical SAM domain protein  46.91 
 
 
435 aa  357  5e-97  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0238128  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0592  radical SAM domain-containing protein  48.33 
 
 
419 aa  355  1e-96  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4251  FO synthase subunit 1  54.1 
 
 
386 aa  350  4e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0115249  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3632  Radical SAM domain protein  51.94 
 
 
430 aa  350  5e-95  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0687937  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0059  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  49.86 
 
 
453 aa  338  3e-91  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.17333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0048  radical SAM domain-containing protein  49.32 
 
 
367 aa  335  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0050  Radical SAM domain protein  48.2 
 
 
365 aa  325  2e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0058  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  53.61 
 
 
419 aa  323  8e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.161997 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2970  hypothetical protein  45.88 
 
 
366 aa  322  1e-86  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0750  FO synthase subunit 2  43.63 
 
 
362 aa  321  3e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.054782  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1071  FO synthase subunit 2  44.07 
 
 
359 aa  321  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3416  FO synthase subunit 2  46.72 
 
 
376 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.90673  normal  0.237046 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1053  FO synthase subunit 2  43.36 
 
 
370 aa  318  4e-85  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0893  FO synthase subunit 2  44.07 
 
 
359 aa  317  6e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0593  radical SAM domain-containing protein  41.29 
 
 
390 aa  315  2e-84  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0040  radical SAM domain-containing protein  44.97 
 
 
362 aa  314  5e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1621  FO synthase subunit 2  43.79 
 
 
359 aa  313  1e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0044  FO synthase subunit 1  41.57 
 
 
351 aa  307  4e-82  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0911  FO synthase subunit 1  43.5 
 
 
380 aa  303  7e-81  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.143979  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0284  radical SAM domain-containing protein  47.98 
 
 
358 aa  301  5e-80  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0047  radical SAM domain-containing protein  46.11 
 
 
362 aa  299  1e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2410  hypothetical protein  43.8 
 
 
361 aa  296  1e-78  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0124  FO synthase subunit 1  41.18 
 
 
352 aa  296  1e-78  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.785163  normal  0.654692 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0038  radical SAM domain-containing protein  43.33 
 
 
362 aa  295  2e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1779  FO synthase subunit 1  40.9 
 
 
352 aa  295  2e-78  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.431297  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0684  FO synthase subunit 1  40.9 
 
 
352 aa  293  8e-78  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.46158  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1303  FO synthase subunit 2  47.56 
 
 
356 aa  293  1e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0775  FO synthase subunit 2  41.99 
 
 
391 aa  290  7e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.848355  hitchhiker  0.00153433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3281  FO synthase subunit 2  43.99 
 
 
381 aa  289  2e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.370195  normal  0.662491 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3417  FO synthase subunit 2  43.65 
 
 
384 aa  285  2e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.1497 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1072  FO synthase subunit 2  41.19 
 
 
358 aa  284  4e-75  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3415  FO synthase subunit 1  44.81 
 
 
325 aa  284  4e-75  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.678705  normal  0.642517 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1434  FO synthase subunit 2  41.82 
 
 
376 aa  284  5e-75  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0411  Radical SAM domain protein  43.14 
 
 
364 aa  281  4e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1253  phosphoribosylaminoimidazole-succinocarboxamide synthase  47.06 
 
 
565 aa  281  4e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0348661  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3080  FO synthase subunit 2  40.48 
 
 
384 aa  280  6e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3040  FO synthase subunit 2  40.75 
 
 
384 aa  280  1e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2116  FO synthase subunit 2  40.16 
 
 
398 aa  277  5e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0194  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofH subunit  40.75 
 
 
382 aa  275  2e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.200924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1304  FO synthase subunit 1  48.46 
 
 
368 aa  275  3e-72  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.366684  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1304  FO synthase subunit 2  42.73 
 
 
356 aa  274  5e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0123  hypothetical protein  40.28 
 
 
361 aa  274  6e-72  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1894  FO synthase subunit 1  47.08 
 
 
387 aa  273  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.373224 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0686  FO synthase subunit 2  41.36 
 
 
386 aa  273  1e-71  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2633  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  44.41 
 
 
389 aa  270  6e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0537539  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1302  FO synthase subunit 1  42.77 
 
 
330 aa  266  9e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1054  FO synthase subunit 2  41.81 
 
 
358 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2201  radical SAM domain-containing protein  45.2 
 
 
329 aa  265  3e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.524494 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1415  FO synthase subunit 1  44.73 
 
 
372 aa  263  7e-69  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.499362  normal  0.994987 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0976  Radical SAM domain protein  46.65 
 
 
327 aa  263  8e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.401774  normal  0.977803 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1620  FO synthase subunit 2  42.37 
 
 
358 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1838  radical SAM domain-containing protein  46.25 
 
 
331 aa  258  2e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.162234  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0642  7,8-didemethyl-8-hydroxy-5-deazariboflavin synthase, CofG subunit  46.36 
 
 
393 aa  259  2e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3391  hypothetical protein  38.57 
 
 
360 aa  245  2e-63  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.352496  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0441  radical SAM domain-containing protein  39.27 
 
 
361 aa  244  5e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2193  radical SAM domain-containing protein  38.84 
 
 
355 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1089  radical SAM domain-containing protein  39.89 
 
 
368 aa  242  2e-62  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1590  hypothetical protein  43.48 
 
 
321 aa  241  3e-62  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00904391  hitchhiker  0.000759826 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1645  Radical SAM domain protein  37.57 
 
 
358 aa  239  2e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  4.914e-09  hitchhiker  6.24327e-09 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0319  hypothetical protein  40.5 
 
 
362 aa  236  1e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.96234e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4284  radical SAM domain-containing protein  36.64 
 
 
360 aa  235  2e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>