More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2563 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2563  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
543 aa  1085    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2371  multi-sensor signal transduction histidine kinase  46.6 
 
 
1171 aa  243  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.516834  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2663  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
979 aa  230  5e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.366427 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4251  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
674 aa  221  3e-56  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.323255  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.15 
 
 
733 aa  216  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0362  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.87 
 
 
1184 aa  216  8e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.656273  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1171  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.94 
 
 
601 aa  214  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.764922  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1239  GAF sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 
601 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1111  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.1 
 
 
463 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2092  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.13 
 
 
882 aa  202  9.999999999999999e-51  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.112279  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2090  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.97 
 
 
763 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.163656  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1788  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.85 
 
 
763 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1867  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.62 
 
 
763 aa  196  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1722  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 
763 aa  194  4e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.418059 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2235  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.03 
 
 
716 aa  193  8e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.530022  normal  0.014643 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3853  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 
591 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3724  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 
592 aa  187  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3781  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.97 
 
 
592 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.233259  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 
592 aa  179  9e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.130733  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3211  bacteriophytochrome-like protein  28.88 
 
 
842 aa  178  2e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.880007  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1191  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
431 aa  178  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.105208  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.98 
 
 
1070 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2207  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.96 
 
 
866 aa  166  8e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2775  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
431 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.163384  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3005  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 
549 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.303527  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2680  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
431 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0421491  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2991  GAF sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
1069 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2900  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
1069 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.095908  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1498  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.57 
 
 
1070 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.308131  normal  0.537019 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4417  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 
1548 aa  159  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.409401 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0144  sensory box histidine kinase  26.17 
 
 
709 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5580  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.18 
 
 
699 aa  157  6e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0190821  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0328  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  58.02 
 
 
951 aa  156  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.37 
 
 
1431 aa  153  7e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.41 
 
 
456 aa  152  1e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4180  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  54.93 
 
 
657 aa  152  2e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0157583  normal  0.971406 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3715  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 
739 aa  151  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.500892  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0249  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  55.07 
 
 
484 aa  151  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 
885 aa  150  5e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3758  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.08 
 
 
408 aa  149  9e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.734482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3124  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.1 
 
 
1374 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.957955  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1193  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  55.3 
 
 
857 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.146062  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2005  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
408 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.343751 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2145  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
408 aa  147  6e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.001377 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35660  signal transduction histidine kinase  38.52 
 
 
572 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  37.5 
 
 
581 aa  145  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6438  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  53.1 
 
 
668 aa  145  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.160303  normal  0.0428099 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2725  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.6 
 
 
568 aa  145  2e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
815 aa  145  3e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0806  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
587 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3508  putative PAS/PAC sensor protein  47.86 
 
 
554 aa  144  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.254838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
587 aa  144  4e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.773486  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1797  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.43 
 
 
1419 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2142  histidine kinase  38.52 
 
 
502 aa  144  5e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.000590991  normal  0.0793761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2448  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  34.32 
 
 
393 aa  143  9e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.760608  hitchhiker  0.00120668 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1796  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.21 
 
 
1965 aa  143  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 
473 aa  142  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2325  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.830525  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2237  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.13 
 
 
381 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.5102  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0694  external sensor signal transduction histidine kinase  35.32 
 
 
592 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.52754  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4616  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
701 aa  142  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.524944 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0539  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.08 
 
 
816 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.146269  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4807  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.82 
 
 
1287 aa  141  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00341781  normal  0.634217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1623  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.84 
 
 
377 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.632325  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2209  GAF sensor signal transduction histidine kinase  37.85 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.73 
 
 
1153 aa  140  3.9999999999999997e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.359014  hitchhiker  0.0000017622 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.91 
 
 
1010 aa  139  8.999999999999999e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2715  sensor histidine kinase/response regulator  34.19 
 
 
393 aa  139  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.615592  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1446  histidine kinase  38.43 
 
 
486 aa  139  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8216  histidine kinase  33.91 
 
 
392 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1933  ATPase domain-containing protein  40.82 
 
 
535 aa  139  1e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.493372  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2875  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.43 
 
 
1261 aa  139  1e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.948484 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.97 
 
 
709 aa  139  2e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2802  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.48 
 
 
406 aa  139  2e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 
582 aa  138  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.91 
 
 
581 aa  139  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1885  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.46 
 
 
792 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3930  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
342 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0182336 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2744  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.64 
 
 
446 aa  138  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000449051 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0275  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.9 
 
 
359 aa  137  4e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0719  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
531 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3817  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 
392 aa  137  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.59485  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0197  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.05 
 
 
710 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.283964 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0583  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  38.08 
 
 
816 aa  137  7.000000000000001e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.412959  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4422  signal transduction histidine kinase with CheB and CheR activity  32.78 
 
 
1274 aa  136  8e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.381764  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1756  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
844 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.68 
 
 
402 aa  136  8e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.947697  normal  0.86399 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0819  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  52.89 
 
 
393 aa  136  9e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0536941  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0470  histidine kinase  39.06 
 
 
425 aa  136  9e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.53157 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2015  putative PAS/PAC sensor protein  25.41 
 
 
1119 aa  136  9e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000673901 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.02 
 
 
585 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.25 
 
 
581 aa  135  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.78 
 
 
593 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2060  sensor histidine kinase  34.57 
 
 
453 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000124716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1685  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.33 
 
 
844 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0234  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 
563 aa  135  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.32 
 
 
878 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
470 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1701  PAS sensor protein  34.12 
 
 
975 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.454558  hitchhiker  0.00934608 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>