More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2559 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2559  UspA domain protein  100 
 
 
295 aa  577  1e-164  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3070  hypothetical protein  43.77 
 
 
300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3141  hypothetical protein  46.28 
 
 
297 aa  177  2e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3071  hypothetical protein  44.59 
 
 
317 aa  162  7e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  40.85 
 
 
297 aa  160  3e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1744  UspA domain protein  43.94 
 
 
296 aa  157  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0169  hypothetical protein  47.89 
 
 
151 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3085  hypothetical protein  33.11 
 
 
303 aa  96.3  5e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2611  hypothetical protein  47.65 
 
 
152 aa  93.6  4e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0104  hypothetical protein  44.59 
 
 
149 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3072  hypothetical protein  43.71 
 
 
161 aa  87.4  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2564  UspA domain protein  32.76 
 
 
282 aa  84.3  0.000000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.143275  normal  0.0151057 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4804  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  32.65 
 
 
299 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.21431 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0954  universal stress protein UspA-like nucleotide-binding protein  34.06 
 
 
141 aa  80.1  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1884  UspA domain-containing protein  36.5 
 
 
137 aa  79.3  0.00000000000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1131  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
292 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.849287  normal  0.887084 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1102  hypothetical protein  33.99 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.608802  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0948  UspA domain-containing protein  31.16 
 
 
290 aa  78.2  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00710468  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1119  UspA domain-containing protein  33.99 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.708169 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  30.24 
 
 
288 aa  76.6  0.0000000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4632  UspA domain protein  36.02 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1273  universal stress protein  33.33 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1532  UspA domain-containing protein  31.49 
 
 
289 aa  76.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000990893 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1445  universal stress protein UspA  41.13 
 
 
162 aa  76.6  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1230  UspA domain-containing protein  34.31 
 
 
137 aa  76.3  0.0000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0254  UspA domain protein  29.95 
 
 
288 aa  76.3  0.0000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.422805 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0914  UspA domain-containing protein  28.23 
 
 
297 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0386207 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1801  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  32.67 
 
 
148 aa  75.1  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1766  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
166 aa  75.1  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.81708  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 
150 aa  74.3  0.000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0337  UspA domain-containing protein  35.04 
 
 
137 aa  74.3  0.000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1489  UspA domain-containing protein  32.12 
 
 
137 aa  73.9  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.854212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0762  UspA domain protein  34.69 
 
 
148 aa  73.9  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0180  UspA domain-containing protein  34.25 
 
 
160 aa  73.6  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.149543  normal  0.974446 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2502  UspA domain protein  41.84 
 
 
162 aa  73.2  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.187507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4830  hypothetical protein  33.33 
 
 
283 aa  73.2  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3775  UspA domain-containing protein  37.41 
 
 
138 aa  73.2  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.309835  normal  0.427023 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1459  UspA domain protein  35.71 
 
 
147 aa  72.8  0.000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000152331  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3533  UspA domain protein  28.06 
 
 
305 aa  72.8  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  36.13 
 
 
180 aa  72.8  0.000000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0884  UspA domain protein  32.14 
 
 
310 aa  72.4  0.000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.314663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2701  UspA domain protein  35.81 
 
 
149 aa  72.4  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2338  UspA domain protein  26.87 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  36.23 
 
 
156 aa  71.6  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  33.8 
 
 
152 aa  71.6  0.00000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2415  UspA domain protein  41.13 
 
 
162 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3327  UspA domain-containing protein  38.31 
 
 
156 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.360261  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2109  UspA domain-containing protein  36.76 
 
 
128 aa  71.6  0.00000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2770  UspA domain protein  28.72 
 
 
298 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0325172  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1125  UspA domain-containing protein  29.97 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2716  hypothetical protein  40.65 
 
 
168 aa  70.5  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1425  UspA domain-containing protein  31.42 
 
 
297 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1466  UspA domain-containing protein  36.3 
 
 
144 aa  70.1  0.00000000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.838968  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1963  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
294 aa  70.5  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.351193  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  36.73 
 
 
148 aa  70.1  0.00000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2196  UspA domain-containing protein  31.72 
 
 
143 aa  69.7  0.00000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.11 
 
 
150 aa  69.7  0.00000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1097  hypothetical protein  29.63 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.185588  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1114  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 
294 aa  69.7  0.00000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.98551 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4807  Universal stress protein UspA and related nucleotide-binding protein-like protein  29.9 
 
 
288 aa  69.3  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.839178 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  33.1 
 
 
157 aa  68.9  0.00000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  34.75 
 
 
153 aa  68.9  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0982  UspA domain protein  33.09 
 
 
140 aa  68.9  0.0000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00474456  normal  0.0330842 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2634  UspA domain protein  35.33 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.765417  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  34.53 
 
 
151 aa  68.6  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2643  universal stress protein UspA-like protein  36.81 
 
 
168 aa  68.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.795343  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1133  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.292295  normal  0.867379 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2500  UspA domain protein  36.71 
 
 
164 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.419356  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3451  UspA domain-containing protein  28.81 
 
 
293 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2538  UspA domain protein  35.33 
 
 
170 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205387  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1206  hypothetical protein  35.4 
 
 
154 aa  68.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.670905  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1104  hypothetical protein  29.73 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1121  UspA domain-containing protein  29.73 
 
 
295 aa  68.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.368186 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1861  hypothetical protein  29.39 
 
 
282 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2388  UspA domain-containing protein  35.64 
 
 
293 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3134  hypothetical protein  31.06 
 
 
285 aa  67.4  0.0000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2088  UspA domain-containing protein  38.26 
 
 
153 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0358891 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2339  UspA domain-containing protein  37.5 
 
 
128 aa  67  0.0000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0225784 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1581  UspA domain-containing protein  32.21 
 
 
288 aa  67.4  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.582811 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1269  UspA domain protein  26.8 
 
 
275 aa  67  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  34.01 
 
 
148 aa  67  0.0000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0913  UspA domain-containing protein  35.81 
 
 
138 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0346302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1321  universal stress protein UspA  36 
 
 
169 aa  67  0.0000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  33.77 
 
 
152 aa  66.6  0.0000000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2716  UspA domain protein  33.8 
 
 
154 aa  67  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  33.56 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.51 
 
 
142 aa  66.6  0.0000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2413  UspA domain protein  36.08 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.53784  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0289  UspA domain protein  27.03 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.503473 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3480  UspA domain-containing protein  30.03 
 
 
289 aa  66.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.420945 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0866  UspA domain protein  33.33 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.682094  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2714  UspA domain protein  33.58 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3452  UspA domain-containing protein  28.52 
 
 
289 aa  66.2  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.936527 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1407  universal stress protein  31.82 
 
 
161 aa  66.2  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.192272  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1831  putative universal stress protein  31.48 
 
 
167 aa  65.9  0.0000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.322893  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  28.87 
 
 
281 aa  65.9  0.0000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  34.93 
 
 
145 aa  65.9  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1627  UspA domain-containing protein  25.26 
 
 
274 aa  65.9  0.0000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4978  UspA domain-containing protein  32.67 
 
 
293 aa  65.9  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>