More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2524 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 
483 aa  989  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  3.31289e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  29.77 
 
 
454 aa  205  1e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 
458 aa  202  8e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 
441 aa  200  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  32.23 
 
 
420 aa  137  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.9 
 
 
442 aa  137  6e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.65 
 
 
479 aa  136  1e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.01 
 
 
427 aa  132  1e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.04 
 
 
449 aa  130  4e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.32 
 
 
431 aa  130  4e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  29.46 
 
 
427 aa  130  4e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  25.97 
 
 
454 aa  122  2e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  27.46 
 
 
460 aa  116  1e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  29.78 
 
 
443 aa  112  1e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  2.54304e-05  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 
488 aa  112  1e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 
503 aa  112  2e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  24.16 
 
 
449 aa  111  3e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.12 
 
 
414 aa  109  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  28.86 
 
 
439 aa  108  3e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  29.11 
 
 
443 aa  108  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  3.82941e-06 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 
421 aa  106  8e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.93 
 
 
416 aa  105  2e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.93 
 
 
416 aa  104  3e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
447 aa  103  7e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  3.8068e-08  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  28.36 
 
 
510 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  27.11 
 
 
420 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  25.51 
 
 
429 aa  100  5e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 
421 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 
441 aa  98.6  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.47 
 
 
443 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  27.68 
 
 
422 aa  97.4  5e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 
425 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  29.32 
 
 
425 aa  95.5  2e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  26.61 
 
 
411 aa  94.7  3e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 
417 aa  94.7  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  27.25 
 
 
445 aa  94.4  4e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.88 
 
 
450 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  2.63225e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  24.66 
 
 
443 aa  92.8  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  34.12 
 
 
488 aa  92  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3240  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 
434 aa  90.9  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  24.13 
 
 
504 aa  90.1  8e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  32.94 
 
 
488 aa  88.6  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  24.57 
 
 
488 aa  89  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  25.59 
 
 
456 aa  88.6  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  26.81 
 
 
408 aa  89  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.79 
 
 
407 aa  88.2  3e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 
435 aa  88.2  3e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.73 
 
 
418 aa  87.8  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  26.12 
 
 
413 aa  87.4  5e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6192  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  26.82 
 
 
431 aa  86.7  1e-15  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0222852  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0274  extracellular solute-binding protein  27.59 
 
 
439 aa  85.5  2e-15  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.285114  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  29.34 
 
 
406 aa  85.5  2e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1773  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 
465 aa  84.7  3e-15  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.504545  normal  0.290135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 
467 aa  84.7  3e-15  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 
435 aa  84.3  4e-15  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.95 
 
 
415 aa  84  6e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  30.82 
 
 
459 aa  83.6  8e-15  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0890  extracellular solute-binding protein  27.11 
 
 
450 aa  83.2  9e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.315589  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2920  extracellular solute-binding protein family 1  27.43 
 
 
424 aa  82.4  2e-14  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.5 
 
 
430 aa  81.3  3e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  24.12 
 
 
484 aa  81.6  3e-14  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  1.08946e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0381  extracellular solute-binding protein family 1  25.33 
 
 
445 aa  81.3  4e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.491759  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1105  extracellular solute-binding protein family 1  28.29 
 
 
443 aa  80.5  7e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.698754  normal  0.0706181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25.64 
 
 
430 aa  80.1  8e-14  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.55 
 
 
426 aa  80.1  9e-14  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  26.26 
 
 
414 aa  79.7  1e-13  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2526  extracellular solute-binding protein family 1  28.14 
 
 
520 aa  78.6  2e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  4.30481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  26.58 
 
 
431 aa  79  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  24.24 
 
 
427 aa  78.2  3e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1296  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 
443 aa  78.6  3e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.190784  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.63 
 
 
431 aa  78.2  3e-13  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  29.04 
 
 
436 aa  77.8  4e-13  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 
410 aa  77.4  5e-13  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 
420 aa  77.4  6e-13  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3988  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 
422 aa  77  7e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3808  extracellular solute-binding protein family 1  28.03 
 
 
427 aa  76.6  9e-13  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.750227 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 
432 aa  76.6  1e-12  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1750  extracellular solute-binding protein family 1  24.63 
 
 
448 aa  76.6  1e-12  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.48272e-08 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.27 
 
 
419 aa  76.3  1e-12  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 
441 aa  75.9  1e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 
925 aa  76.3  1e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  21.07 
 
 
480 aa  75.9  2e-12  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  25.83 
 
 
424 aa  75.1  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 
429 aa  75.9  2e-12  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 
430 aa  75.1  2e-12  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  23.9 
 
 
410 aa  75.9  2e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  23.72 
 
 
393 aa  75.1  3e-12  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  23.54 
 
 
415 aa  74.7  4e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  24.85 
 
 
415 aa  73.9  5e-12  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.57 
 
 
410 aa  73.9  5e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5002  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  24.88 
 
 
426 aa  73.9  5e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.287585  normal  0.158884 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  23.64 
 
 
411 aa  73.9  5e-12  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  24.12 
 
 
410 aa  73.6  7e-12  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3842  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 
429 aa  73.6  8e-12  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0316121  normal  0.0422385 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29010  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.92 
 
 
434 aa  73.6  8e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  24.62 
 
 
417 aa  73.2  9e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2539  putative ABC transporter, substrate binding protein  27.97 
 
 
437 aa  72.8  1e-11  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3459  extracellular solute-binding protein family 1  27.5 
 
 
458 aa  73.2  1e-11  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.725469  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  27.02 
 
 
442 aa  72.8  1e-11  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3566  extracellular solute-binding protein family 1  25.8 
 
 
426 aa  73.2  1e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>