More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2513 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2513  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 441 aa  910    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3566  extracellular solute-binding protein  52.77 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.42847  normal  0.297516 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1359  extracellular solute-binding protein  53.48 
 
 		 458 aa  488  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  28.4 
 
 		 483 aa  199  6e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  29.69 
 
 		 442 aa  133  6e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 479 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2731  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.52 
 
 		 420 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  26.16 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  26.16 
 
 		 416 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  29.93 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  28.23 
 
 		 422 aa  114  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 421 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  27.86 
 
 		 457 aa  105  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0265  extracellular solute-binding protein family 1  32.05 
 
 		 510 aa  105  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 429 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  25.97 
 
 		 427 aa  103  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.04 
 
 		 431 aa  102  1e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0513  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 447 aa  102  1e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000038068  hitchhiker  0.000703825 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0375  extracellular solute-binding protein family 1  27.39 
 
 		 421 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.07 
 
 		 414 aa  100  4e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4320  extracellular solute-binding protein family 1  25.25 
 
 		 425 aa  99.4  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.811375  hitchhiker  0.00841489 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3106  ABC transporter, substrate binding periplasmic component  24.75 
 
 		 408 aa  99.4  1e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0378  extracellular solute-binding protein family 1  26.63 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  25.8 
 
 		 419 aa  97.8  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0592  extracellular solute-binding protein  23.06 
 
 		 456 aa  96.3  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000165278  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29320  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.53 
 
 		 443 aa  95.5  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  27.41 
 
 		 413 aa  94.4  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3619  extracellular solute-binding protein  25.77 
 
 		 488 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  26.72 
 
 		 430 aa  93.2  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  25.32 
 
 		 437 aa  93.2  9e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3394  ABC-type sugar transport systems permease component  24.7 
 
 		 411 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.498756  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  26.3 
 
 		 488 aa  90.9  4e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.36 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.65 
 
 		 488 aa  85.9  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  27.1 
 
 		 488 aa  86.3  0.000000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  25.96 
 
 		 503 aa  85.1  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2315  extracellular solute-binding protein  26.13 
 
 		 455 aa  85.1  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.271919 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  28.76 
 
 		 418 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2137  extracellular solute-binding protein family 1  26.28 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0137  extracellular solute-binding protein family 1  23.95 
 
 		 453 aa  84  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  22.44 
 
 		 414 aa  82.8  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2603  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 445 aa  80.9  0.00000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0144502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26 
 
 		 417 aa  80.9  0.00000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.34 
 
 		 403 aa  80.9  0.00000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  25.27 
 
 		 443 aa  79.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0310  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 443 aa  79  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 410 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1468  extracellular solute-binding protein family 1  23.9 
 
 		 457 aa  78.6  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  24.84 
 
 		 410 aa  78.6  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1522  extracellular solute-binding protein family 1  25.39 
 
 		 421 aa  78.2  0.0000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.569671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4621  extracellular solute-binding protein family 1  25.7 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  23.35 
 
 		 449 aa  78.2  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2652  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, maltose/maltodextrin-binding protein  24.44 
 
 		 408 aa  77.8  0.0000000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12078  sugar-binding lipoprotein  26.59 
 
 		 439 aa  77.8  0.0000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.42 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  22.89 
 
 		 415 aa  77.4  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  28.04 
 
 		 431 aa  77  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.66 
 
 		 445 aa  76.6  0.0000000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00116931 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2545  extracellular solute-binding protein family 1  25.71 
 
 		 442 aa  76.6  0.0000000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3793  extracellular solute-binding protein family 1  22.51 
 
 		 459 aa  76.3  0.000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.46649  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.43 
 
 		 480 aa  75.9  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2873  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 425 aa  75.9  0.000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.99 
 
 		 419 aa  76.3  0.000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.033461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 410 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2574  extracellular solute-binding protein family 1  23.6 
 
 		 401 aa  75.5  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000602333  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1619  putative sugar-binding lipoprotein  25.69 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.195944  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1181  extracellular solute-binding protein  24.4 
 
 		 413 aa  75.5  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000595288  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2703  extracellular solute-binding protein family 1  24.86 
 
 		 450 aa  75.5  0.000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000263225  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2552  extracellular solute-binding protein  22.11 
 
 		 443 aa  75.5  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000382941 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.21 
 
 		 426 aa  75.1  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 504 aa  74.3  0.000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  25.32 
 
 		 432 aa  74.3  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  26.58 
 
 		 436 aa  73.9  0.000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.94 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2403  extracellular solute-binding protein  21.43 
 
 		 441 aa  73.2  0.000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  27.49 
 
 		 415 aa  72.8  0.00000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7590  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  25.07 
 
 		 447 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  24.62 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2696  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 420 aa  71.6  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.240659  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2474  extracellular solute-binding protein family 1  24.31 
 
 		 484 aa  72  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000108946  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2345  extracellular solute-binding protein family 1  24.87 
 
 		 424 aa  72  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.822896  normal  0.413258 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2338  maltose-binding periplasmic protein precursor  23.61 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  23.84 
 
 		 431 aa  71.6  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  27.53 
 
 		 415 aa  71.2  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2808  extracellular solute-binding protein family 1  26.67 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.512241 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2313  extracellular solute-binding protein  28.47 
 
 		 901 aa  70.1  0.00000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.708196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1686  extracellular solute-binding protein family 1  26.54 
 
 		 493 aa  70.1  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05090  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.57 
 
 		 430 aa  70.1  0.00000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0203  extracellular solute-binding protein family 1  22.96 
 
 		 441 aa  69.7  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.346278  normal  0.123927 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1927  extracellular solute-binding protein family 1  26.71 
 
 		 439 aa  69.7  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2714  extracellular solute-binding protein family 1  24.58 
 
 		 414 aa  69.7  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.36636  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13140  extracellular solute-binding protein family 1  25.48 
 
 		 424 aa  68.9  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0224  extracellular solute-binding protein  28.78 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2315  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 925 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25 
 
 		 410 aa  68.6  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28390  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  22.35 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2025  extracellular solute-binding protein family 1  23.69 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165485  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>