38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2508 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2521  hypothetical protein  99.48 
 
 
381 aa  752  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  5.40402e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2508  hypothetical protein  100 
 
 
381 aa  755  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  1.56846e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3246  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  29.95 
 
 
358 aa  129  1e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3583  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  31.28 
 
 
357 aa  119  7e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.445439  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2346  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  26.61 
 
 
368 aa  108  1e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3234  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 
377 aa  108  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0700  hypothetical protein  26.56 
 
 
366 aa  105  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3385  Radical SAM domain protein  28.98 
 
 
843 aa  102  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0319  hypothetical protein  23.39 
 
 
358 aa  98.2  2e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0334  hypothetical protein  23.85 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0615  glycosyl transferase, group 1  27.55 
 
 
1247 aa  96.7  6e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00376413  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0298  hypothetical protein  25.19 
 
 
358 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3239  tetratricopeptide TPR_2  26.48 
 
 
955 aa  95.9  9e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.502177  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1054  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.85 
 
 
734 aa  95.5  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.393158  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03177  hypothetical protein  27.13 
 
 
695 aa  95.5  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0713638  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2479  glycosyl transferase family protein  27.23 
 
 
882 aa  94.4  3e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.524105  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0128  glycosyl transferase family 2  26.51 
 
 
1077 aa  94.4  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0538  lipopolysaccharide biosynthesis protein  26.72 
 
 
734 aa  94  4e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.644164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0253  hypothetical protein  23.33 
 
 
358 aa  92  1e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0304  hypothetical protein  24.04 
 
 
358 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0042  polysaccharide biosynthesis protein  24.56 
 
 
383 aa  90.5  4e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1508  hypothetical protein  25 
 
 
381 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.261269  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0519  hypothetical protein  26.94 
 
 
686 aa  87.4  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.414817  normal  0.208211 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2554  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like protein  24.68 
 
 
364 aa  81.6  2e-14  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2105  polysaccharide biosynthesis protein  23.04 
 
 
363 aa  81.6  2e-14  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6326  glycosyl transferase group 1  26.17 
 
 
787 aa  80.1  6e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2561  glycosyl transferase, group 2 family protein  25.91 
 
 
957 aa  72.8  8e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1198  WbwX  21.28 
 
 
361 aa  71.2  3e-11  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.696944  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0320  methyltransferase type 11  21.47 
 
 
1082 aa  70.9  4e-11  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1412  tetratricopeptide TPR_2  21.46 
 
 
372 aa  70.5  5e-11  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0237532 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0273  hypothetical protein  32.2 
 
 
317 aa  64.3  4e-09  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.798634  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0259  hypothetical protein  32.2 
 
 
317 aa  64.3  4e-09  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3918  hypothetical protein  24.29 
 
 
751 aa  62.4  1e-08  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4087  lipopolysaccharide biosynthesis protein-like  24.29 
 
 
751 aa  62.8  1e-08  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.885758  normal  0.378221 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47966  predicted protein  21.49 
 
 
391 aa  61.2  3e-08  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.667552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1633  hypothetical protein  21.41 
 
 
609 aa  53.1  8e-06  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3365  hypothetical protein  18.34 
 
 
348 aa  52.8  1e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.792231  normal  0.845884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0540  hypothetical protein  28.08 
 
 
381 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.524708 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>