257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2482 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2482  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  100 
 
 
163 aa  331  2e-90  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32090  ribose 5-phosphate isomerase  56.85 
 
 
153 aa  179  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.124709  normal  0.300701 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2561  ribose 5-phosphate isomerase  56.25 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4071  ribose 5-phosphate isomerase  55.26 
 
 
156 aa  163  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.204632  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2606  ribose 5-phosphate isomerase  56.25 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2600  ribose 5-phosphate isomerase  56.25 
 
 
159 aa  162  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0412  ribose 5-phosphate isomerase  55.03 
 
 
163 aa  159  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3952  ribose-5-phosphate isomerase  53.69 
 
 
163 aa  157  7e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_57049  Ribose-5-phosphate isomerase B (Phosphoriboisomerase B) (LACB) (RPIB)  51.39 
 
 
156 aa  157  7e-38  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.392593  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0885  ribose 5-phosphate isomerase  54.86 
 
 
163 aa  153  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0405085  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05907  conserved hypothetical protein  46.71 
 
 
157 aa  152  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1505  ribose 5-phosphate isomerase  53.9 
 
 
156 aa  150  5e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.562135  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4221  ribose 5-phosphate isomerase  51.37 
 
 
158 aa  150  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0185  ribose 5-phosphate isomerase  57.64 
 
 
171 aa  148  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000979367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29800  ribose 5-phosphate isomerase  55.94 
 
 
156 aa  145  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0881  ribose 5-phosphate isomerase  49.37 
 
 
165 aa  145  3e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.729816  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28680  ribose 5-phosphate isomerase  53.47 
 
 
152 aa  140  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.786447  normal  0.033398 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00530  ribose 5-phosphate isomerase  52.78 
 
 
156 aa  140  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA08060  conserved hypothetical protein  47.37 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4226  ribose 5-phosphate isomerase  50.34 
 
 
167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.245693  normal  0.688481 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2648  ribose 5-phosphate isomerase  59.63 
 
 
160 aa  138  3e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1918  ribose 5-phosphate isomerase  49.66 
 
 
167 aa  138  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1548  ribose 5-phosphate isomerase  53.47 
 
 
152 aa  132  1.9999999999999998e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.672639  normal  0.270598 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1815  ribose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.12125  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1791  ribose 5-phosphate isomerase B  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0813  ribose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1104  ribose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0454  ribose 5-phosphate isomerase B  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0359  ribose 5-phosphate isomerase B  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.167619  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2077  ribose 5-phosphate isomerase  47.44 
 
 
164 aa  130  9e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1460  ribose-5-phosphate isomerase  48.99 
 
 
149 aa  128  4.0000000000000003e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.293951 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0621  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  47.3 
 
 
152 aa  127  8.000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3422  ribose-5-phosphate isomerase B  44.9 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.208549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0952  ribose-5-phosphate isomerase B  44.9 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3289  ribose-5-phosphate isomerase B  44.9 
 
 
151 aa  124  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1922  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  46.48 
 
 
153 aa  120  6e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0357  ribose-5-phosphate isomerase  46.94 
 
 
166 aa  120  8e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1640  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.76 
 
 
152 aa  119  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000194465  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4584  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  44.9 
 
 
157 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.782125  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1334  ribose-5-phosphate isomerase  44.9 
 
 
148 aa  118  3.9999999999999996e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.126498  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3431  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
147 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000280792  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2149  ribose-5-phosphate isomerase B  42.96 
 
 
145 aa  117  7e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4652  ribose-5-phosphate isomerase B  43.66 
 
 
148 aa  117  7e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278077 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22120  Ribose 5-phosphate isomerase B protein  42.04 
 
 
157 aa  117  9e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1359  ribose-5-phosphate isomerase  45.52 
 
 
158 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.632474  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1638  ribose-5-phosphate isomerase B  43.84 
 
 
149 aa  116  1.9999999999999998e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0652  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  42.18 
 
 
149 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.867126  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0410  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.86 
 
 
149 aa  114  6e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.52921 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2572  ribose/galactose isomerase  43.04 
 
 
153 aa  111  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0070  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  43.92 
 
 
149 aa  112  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.212167  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2042  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  40.14 
 
 
159 aa  112  3e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.673423 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2150  ribose-5-phosphate isomerase B  41.33 
 
 
152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2905  ribose-5-phosphate isomerase B  41.55 
 
 
152 aa  111  5e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0870  ribose-5-phosphate isomerase B  41.55 
 
 
151 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0817  ribose-5-phosphate isomerase B  41.55 
 
 
151 aa  110  6e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3427  ribose-5-phosphate isomerase B  45.53 
 
 
149 aa  110  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2463  ribose-5-phosphate isomerase B  43.85 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2173  ribose-5-phosphate isomerase B  43.85 
 
 
149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0388966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3315  ribose-5-phosphate isomerase B  39.33 
 
 
148 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.16807  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0747  ribose-5-phosphate isomerase B  42.18 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03270  ribose-5-phosphate isomerase  38.71 
 
 
158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000645996  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1263  ribose-5-phosphate isomerase  44.62 
 
 
152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.649363 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0983  ribose-5-phosphate isomerase B  42.38 
 
 
152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2385  ribose 5-phosphate isomerase B  40.54 
 
 
149 aa  108  3e-23  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000941182  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2597  ribose-5-phosphate isomerase  45.74 
 
 
149 aa  108  3e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0696545  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5329  ribose-5-phosphate isomerase B  40.14 
 
 
151 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.594587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3112  ribose-5-phosphate isomerase B  39.07 
 
 
153 aa  106  1e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0171013  hitchhiker  0.000249114 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1117  ribose-5-phosphate isomerase B  34.67 
 
 
150 aa  105  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2148  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  49.23 
 
 
152 aa  105  2e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0098  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.38 
 
 
148 aa  105  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0809  ribose 5-phosphate isomerase B  40.43 
 
 
148 aa  103  9e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4828  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  41.89 
 
 
149 aa  103  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305549  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17930  ribose-5-phosphate isomerase  44.62 
 
 
322 aa  102  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1747  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  45.31 
 
 
148 aa  102  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0569698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0259  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  39.87 
 
 
149 aa  102  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000129497  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0369  ribose 5-phosphate isomerase B  34.01 
 
 
148 aa  100  8e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2593  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.25 
 
 
153 aa  99.8  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1376  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  42.14 
 
 
146 aa  98.2  4e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3745  RpiB/LacA/LacB family sugar-phosphate isomerase  43.75 
 
 
142 aa  98.2  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0446576  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2392  ribose-5-phosphate isomerase  41.1 
 
 
181 aa  97.4  7e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.73759  normal  0.0712618 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0488  ribose-5-phosphate isomerase B  34.69 
 
 
149 aa  97.1  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.136003  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0632  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  37.69 
 
 
148 aa  96.7  1e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03962  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3901  ribose 5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2809  ribose-5-phosphate isomerase B  33.56 
 
 
149 aa  95.9  2e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119147  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3936  ribose-5-phosphate isomerase B  39.46 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03922  hypothetical protein  39.46 
 
 
149 aa  96.3  2e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0942  uracil phosphoribosyltransferase  39.46 
 
 
370 aa  94.7  5e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5409  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.20464e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5167  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000705511  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl105  ribose 5-phosphate isomerase  36.72 
 
 
146 aa  94.4  6e-19  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5017  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000649757  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5560  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  6e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000246279  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5443  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000304947  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5000  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000586604  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3131  ribose-5-phosphate isomerase B  35.51 
 
 
148 aa  94  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00448812 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5496  ribose-5-phosphate isomerase B  42.72 
 
 
147 aa  94.4  7e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000908103  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2692  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  40.94 
 
 
157 aa  93.6  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0651624  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3821  sugar-phosphate isomerase, RpiB/LacA/LacB family  38.81 
 
 
146 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0187638  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0615  ribose-5-phosphate isomerase B  34.69 
 
 
152 aa  93.2  1e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>