144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2355 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 
260 aa  537  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  58.02 
 
 
263 aa  289  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  53.09 
 
 
253 aa  261  8e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  31.56 
 
 
273 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.3 
 
 
270 aa  135  4e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2518  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.09 
 
 
276 aa  124  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139368  normal  0.951713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.44 
 
 
277 aa  119  7e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.44 
 
 
300 aa  102  8e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.63 
 
 
269 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 
320 aa  100  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.11 
 
 
257 aa  94  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.77 
 
 
293 aa  89  7e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.24 
 
 
273 aa  88.2  1e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.12 
 
 
261 aa  87.4  2e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.88 
 
 
303 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.88 
 
 
303 aa  85.5  7e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.81 
 
 
260 aa  82.8  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.88 
 
 
303 aa  82.8  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.21 
 
 
282 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.73 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.34 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.84 
 
 
282 aa  80.1  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.47 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.47 
 
 
282 aa  79.3  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.74 
 
 
282 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.72 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.348283 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.47 
 
 
282 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  26.69 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.45 
 
 
280 aa  75.5  0.0000000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.79 
 
 
253 aa  75.1  0.000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.12 
 
 
280 aa  73.6  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.96 
 
 
283 aa  72.8  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.02 
 
 
274 aa  73.2  0.000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6429  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.69 
 
 
281 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 
257 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  33.97 
 
 
263 aa  72  0.000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3097  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.55 
 
 
257 aa  70.5  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.820493 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.32 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.25 
 
 
263 aa  70.5  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.52 
 
 
257 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  27.85 
 
 
275 aa  69.7  0.00000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.22 
 
 
282 aa  68.9  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3079  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.55 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  29.65 
 
 
281 aa  68.2  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4837  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.07 
 
 
267 aa  68.2  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0756988 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
253 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.49 
 
 
270 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.78 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 
260 aa  67.4  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  24.57 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 
257 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2465  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.11 
 
 
257 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  23.87 
 
 
276 aa  65.5  0.0000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  24.46 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.57 
 
 
279 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  25.56 
 
 
302 aa  63.9  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  25.98 
 
 
298 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.23 
 
 
278 aa  63.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.27 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.42 
 
 
276 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  23.83 
 
 
300 aa  62.8  0.000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0147  CmaB  24.07 
 
 
354 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0830798  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1661  cmaB protein  24.07 
 
 
352 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.057676  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  28.77 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1581  cmaB protein  24.62 
 
 
307 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  24.89 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.89 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.48 
 
 
278 aa  60.8  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  24.89 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0201  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.89 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  24.89 
 
 
297 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  24.89 
 
 
253 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.7 
 
 
275 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1224  CmaB  23.08 
 
 
307 aa  59.7  0.00000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6049  chlorinating enzyme  23.46 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00398666  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.46 
 
 
284 aa  59.7  0.00000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5819  chlorinating enzyme  23.46 
 
 
308 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.03 
 
 
285 aa  59.3  0.00000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  25.94 
 
 
315 aa  58.9  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  58.9  0.00000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.99 
 
 
239 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  22.14 
 
 
266 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0133  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.11 
 
 
264 aa  57.8  0.0000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.387052  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.36 
 
 
305 aa  57.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  24.35 
 
 
276 aa  57  0.0000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.45 
 
 
230 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1483  hypothetical protein  27.41 
 
 
287 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0852  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.46 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  33.12 
 
 
254 aa  55.8  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3440  chlorinating enzyme  26.29 
 
 
296 aa  56.2  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.197593 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.01 
 
 
274 aa  55.8  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.1 
 
 
309 aa  55.5  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29130  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  23.71 
 
 
289 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  24.64 
 
 
266 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2621  hypothetical protein  24.68 
 
 
276 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.72 
 
 
309 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1776  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.94 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0218629 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>