84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2312 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2312  Alpha-L-fucosidase  100 
 
 
466 aa  954    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.931291  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0315  Alpha-L-fucosidase  60.39 
 
 
464 aa  581  1.0000000000000001e-165  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3569  Alpha-L-fucosidase  57.85 
 
 
515 aa  538  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0390  Alpha-L-fucosidase  56.21 
 
 
484 aa  530  1e-149  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0617324  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01643  alpha-L-fucosidase  54.76 
 
 
532 aa  519  1e-146  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.20303  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2262  Alpha-L-fucosidase  51.79 
 
 
606 aa  518  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2169  Alpha-L-fucosidase  51.59 
 
 
584 aa  517  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.600207  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0902  Alpha-L-fucosidase  53.75 
 
 
505 aa  516  1.0000000000000001e-145  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.13799 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0831  Alpha-L-fucosidase  49.26 
 
 
537 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000199076  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0802  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L-fucosidase)  50.33 
 
 
495 aa  480  1e-134  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.246166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0823  Alpha-L-fucosidase  41.41 
 
 
534 aa  377  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000144391  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3218  Alpha-L-fucosidase  41.98 
 
 
798 aa  326  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.266545  normal  0.296598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1302  glycoside hydrolase family alpha-L-fucosidase  39.04 
 
 
540 aa  318  1e-85  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.186001 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2072  Alpha-L-fucosidase  39.32 
 
 
486 aa  316  5e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4932  Alpha-L-fucosidase  38.38 
 
 
663 aa  306  7e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00307055  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4241  glycoside hydrolase family 29 (alpha-L- fucosidase)  37.57 
 
 
555 aa  305  8.000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.525329  normal  0.717793 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1541  Alpha-L-fucosidase  39.09 
 
 
516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.664624 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4875  Alpha-L-fucosidase  38.4 
 
 
483 aa  299  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.185578  normal  0.768755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4476  Alpha-L-fucosidase  34.04 
 
 
731 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.766125  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0611  Alpha-L-fucosidase  33.49 
 
 
446 aa  224  3e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.620777  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0625  Alpha-L-fucosidase  33.1 
 
 
446 aa  220  5e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2972  Alpha-L-fucosidase  33.93 
 
 
490 aa  212  9e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.245374  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2554  Alpha-L-fucosidase  33.73 
 
 
478 aa  201  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0869924  normal  0.838653 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48865  predicted protein  30.94 
 
 
500 aa  198  2.0000000000000003e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2605  Alpha-L-fucosidase  29.36 
 
 
463 aa  193  5e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00783953  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2814  Alpha-L-fucosidase  33.4 
 
 
471 aa  193  5e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.547268  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_29821  predicted protein  30.46 
 
 
473 aa  192  1e-47  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.979957  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1483  Alpha-L-fucosidase  29.29 
 
 
482 aa  172  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000503275  normal  0.454676 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39282  predicted protein  27.04 
 
 
492 aa  155  1e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.218149  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3023  Alpha-L-fucosidase  28.21 
 
 
435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.202324  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2045  Alpha-L-fucosidase  31.9 
 
 
464 aa  143  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.118416  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00800  alpha-L-fucosidase  32.17 
 
 
474 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2695  Alpha-L-fucosidase  28.93 
 
 
627 aa  136  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000601937  normal  0.037659 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2693  Alpha-L-fucosidase  23.94 
 
 
479 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.101343  hitchhiker  0.00474294 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2190  Alpha-L-fucosidase  29.11 
 
 
435 aa  134  3e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0010  Alpha-L-fucosidase  29.87 
 
 
538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.886548  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2703  Alpha-L-fucosidase  28.82 
 
 
596 aa  134  5e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.487466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0886  Alpha-L-fucosidase  30.56 
 
 
408 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0105586  normal  0.109873 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1916  Alpha-L-fucosidase  26.58 
 
 
446 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7054  Alpha-L-fucosidase  26.13 
 
 
485 aa  129  8.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000348467  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2595  Alpha-L-fucosidase  25.62 
 
 
473 aa  129  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2842  Alpha-L-fucosidase  24.49 
 
 
479 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00471674 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1127  Alpha-L-fucosidase  25.9 
 
 
479 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.95278 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0019  Alpha-L-fucosidase  28.02 
 
 
441 aa  126  7e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6806  Alpha-L-fucosidase  24.62 
 
 
452 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  hitchhiker  0.00000369598 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3264  Alpha-L-fucosidase  25.05 
 
 
471 aa  121  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.868809 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2040  Alpha-L-fucosidase  24.54 
 
 
494 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.983344  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4947  Alpha-L-fucosidase  26.56 
 
 
644 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00851313  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2796  Alpha-L-fucosidase  26.7 
 
 
581 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0480  alpha-L-fucosidase family protein  24.4 
 
 
478 aa  110  8.000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00391877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0130  Alpha-L-fucosidase  27.94 
 
 
450 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.159466  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3943  Alpha-L-fucosidase  23.89 
 
 
429 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13010  alpha-L-fucosidase  27.23 
 
 
445 aa  101  3e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0825018  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1903  Alpha-L-fucosidase  25.12 
 
 
431 aa  101  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1884  alpha-L-fucosidase precursor, putative  26.58 
 
 
674 aa  100  4e-20  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05120  alpha-L-fucosidase  27.35 
 
 
474 aa  99.8  9e-20  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0146  Alpha-L-fucosidase  24.79 
 
 
711 aa  99  2e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5348  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 
440 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.559613 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3467  Alpha-L-fucosidase  26.39 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.565754 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3615  Alpha-L-fucosidase  24.49 
 
 
429 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.669923  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3540  Alpha-L-fucosidase  28.33 
 
 
340 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.747964  normal  0.742804 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0435  alpha-L-fucosidase  27.35 
 
 
212 aa  82  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2841  Alpha-L-fucosidase  31.5 
 
 
473 aa  81.3  0.00000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  hitchhiker  0.00495105 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2596  Alpha-L-fucosidase  39.74 
 
 
447 aa  64.3  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000031745  normal  0.128111 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0308  Alpha-L-fucosidase  26.85 
 
 
463 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1447  Alpha-L-fucosidase  26.09 
 
 
410 aa  57  0.0000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.821107  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0086  alpha-L-fucosidase  24.44 
 
 
460 aa  55.1  0.000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2596  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.63 
 
 
487 aa  55.1  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1750  alpha-1,3/4-fucosidase, putative  36.84 
 
 
606 aa  54.7  0.000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2028  Alpha-L-fucosidase  31.96 
 
 
704 aa  54.7  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2130  calx-beta domain-containing protein  21.11 
 
 
932 aa  54.3  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.538147  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0072  Alpha-L-fucosidase  25 
 
 
460 aa  54.3  0.000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6474  coagulation factor 5/8 type domain protein  22.29 
 
 
467 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.904376  normal  0.80795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12980  alpha-L-fucosidase  35.53 
 
 
434 aa  52  0.00002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0194467  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3028  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 
470 aa  52  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2160  Alpha-L-fucosidase  28.95 
 
 
690 aa  51.6  0.00003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0846  coagulation factor 5/8 type domain protein  29.46 
 
 
704 aa  50.8  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.197  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2423  twin-arginine translocation pathway signal  24.64 
 
 
638 aa  50.8  0.00005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.204978  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1843  FucA  21.43 
 
 
750 aa  50.8  0.00006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3894  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.15 
 
 
688 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.813544 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1415  coagulation factor 5/8 type domain protein  28 
 
 
698 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6558  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.03 
 
 
687 aa  48.1  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00192951  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0392  coagulation factor 5/8 type domain protein  28.45 
 
 
709 aa  47  0.0007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01697  F5/8 type C domain protein  34.88 
 
 
581 aa  46.2  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>