More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2304 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2304  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 
347 aa  704    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  44.97 
 
 
342 aa  281  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4711  LacI family transcription regulator  45.05 
 
 
334 aa  277  2e-73  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1708  transcriptional regulator, LacI family  41.96 
 
 
342 aa  263  4e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000920501  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1398  ribose operon repressor RbsR  40.9 
 
 
334 aa  262  6e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0520  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  41.49 
 
 
338 aa  261  1e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.532617  hitchhiker  0.0000174135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0831  LacI family transcription regulator  42.69 
 
 
326 aa  260  3e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09530  transcriptional regulator, LacI family  39.4 
 
 
340 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00123183  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  40.12 
 
 
349 aa  241  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4315  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.86 
 
 
352 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0957821 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2511  LacI family transcriptional regulator  39.64 
 
 
346 aa  239  5e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.743819  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  38.1 
 
 
335 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  39.58 
 
 
333 aa  238  2e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2952  transcriptional regulator, LacI family  37.84 
 
 
337 aa  236  3e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  39.07 
 
 
346 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0945  LacI family transcription regulator  37.5 
 
 
348 aa  235  8e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0000657853  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0905  LacI family transcription regulator  39.88 
 
 
333 aa  233  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.069217  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2029  transcriptional regulator, LacI family  41.02 
 
 
337 aa  233  4.0000000000000004e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3127  transcriptional regulator, LacI family  38.91 
 
 
331 aa  231  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.501484  hitchhiker  0.00254336 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3653  hypothetical protein  38.08 
 
 
353 aa  230  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.101524 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.39 
 
 
330 aa  230  3e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0525  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.69 
 
 
356 aa  229  5e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0501  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  39.52 
 
 
335 aa  229  5e-59  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0579669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  35.38 
 
 
347 aa  228  1e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3939  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 
354 aa  225  9e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4628  transcriptional regulator, LacI family  38.62 
 
 
332 aa  224  1e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.656687 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3984  transcriptional regulator, LacI family  40.83 
 
 
336 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5553  transcriptional regulator LacI family  35.45 
 
 
356 aa  224  2e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.539573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.91 
 
 
336 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00486  transcriptional regulator LacI family  38.82 
 
 
331 aa  220  3e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0186  alanine racemase  39.17 
 
 
335 aa  219  3.9999999999999997e-56  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5883  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  36.02 
 
 
356 aa  219  3.9999999999999997e-56  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.92391 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2197  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.5 
 
 
337 aa  218  1e-55  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0113721  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0432  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  38.92 
 
 
334 aa  216  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.103589  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1186  transcriptional regulator, LacI family  38.97 
 
 
358 aa  216  5e-55  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0882106  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4253  LacI family transcription regulator  42.03 
 
 
354 aa  216  5.9999999999999996e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1234  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 
343 aa  215  7e-55  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50127  normal  0.134178 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1628  LacI family transcription regulator  35.44 
 
 
343 aa  216  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1973  LacI family transcription regulator  40.53 
 
 
341 aa  215  8e-55  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.768247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1574  transcriptional regulator, LacI family  38.53 
 
 
337 aa  215  9e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2860  putative transcription regulation repressor transcription regulator protein  42.01 
 
 
329 aa  214  9.999999999999999e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2662  LacI family transcription regulator  39.22 
 
 
328 aa  214  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0040  transcriptional regulator, LacI family  38.86 
 
 
330 aa  214  1.9999999999999998e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1506  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1525  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.420738  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1785  LacI family transcription regulator  38.62 
 
 
334 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5456  alanine racemase  35.47 
 
 
368 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000537083  normal  0.747323 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1586  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122412  normal  0.650271 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1129  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1609  LacI family transcription regulator  35.14 
 
 
343 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0684889  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  36.29 
 
 
353 aa  212  9e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4748  LacI family transcription regulator  34.83 
 
 
343 aa  211  1e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.395057 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  37.31 
 
 
348 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  36.78 
 
 
336 aa  211  2e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2472  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 
343 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7934  putative LacI-family transcriptional regulator  37.57 
 
 
335 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2022  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 
343 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.662423  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0879  transcriptional regulator, LacI family  36.55 
 
 
346 aa  210  3e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0496177  normal  0.310275 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1857  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 
343 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1870  ribose operon repressor RbsR  34.62 
 
 
343 aa  210  3e-53  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585666  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0609  alanine racemase  37.13 
 
 
347 aa  209  5e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.960235  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0944  transcriptional regulator, LacI family  36.55 
 
 
346 aa  209  5e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.12331  normal  0.110635 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1696  transcriptional regulator, LacI family  35.38 
 
 
342 aa  209  7e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0812  ribose operon repressor, putative  35.84 
 
 
343 aa  208  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4416  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
343 aa  207  2e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.506908  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03819  DNA-binding transcriptional dual regulator  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4051  transcriptional regulator, LacI family  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03768  hypothetical protein  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5391  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
330 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.504328  normal  0.696689 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4084  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0187  transcriptional regulator, LacI family  40.13 
 
 
339 aa  207  2e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  34.5 
 
 
344 aa  207  2e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4376  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.76111 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4166  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
343 aa  207  2e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4470  DNA-binding transcriptional regulator CytR  34.44 
 
 
341 aa  207  2e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3559  transcriptional regulator, LacI family  36.72 
 
 
339 aa  206  4e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.156963  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2260  transcriptional regulator, LacI family  34.23 
 
 
346 aa  206  4e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.167374  normal  0.588495 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1736  transcriptional regulator, LacI family  34.82 
 
 
333 aa  206  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000004003  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2664  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 
352 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.686839  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0710  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 
334 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0832389  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5940  transcriptional regulator, LacI family  37.03 
 
 
347 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146898  normal  0.555591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.54 
 
 
332 aa  204  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2000  LacI family transcription regulator  33.63 
 
 
346 aa  203  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.121919  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3131  transcriptional regulator, LacI family  37.2 
 
 
334 aa  203  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.159166  hitchhiker  0.005841 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01040  transcriptional regulator  34.32 
 
 
336 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1005  transcriptional regulator, LacI family  32.54 
 
 
336 aa  202  6e-51  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.436284  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1014  transcriptional regulatory DNA-binding repressor transcription regulator protein  35.4 
 
 
347 aa  202  8e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.106948  normal  0.302245 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23020  transcriptional regulator, LacI family  34.03 
 
 
336 aa  202  9e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000406909  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  36.42 
 
 
339 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  34.69 
 
 
339 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2742  transcriptional regulator, LacI family  41.54 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0297688  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3107  transcriptional regulator, LacI family  40.65 
 
 
331 aa  201  1.9999999999999998e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4506  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  32.44 
 
 
332 aa  200  3e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0038285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2250  DNA-binding transcriptional regulator CytR  32.93 
 
 
335 aa  200  3.9999999999999996e-50  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0559  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.31 
 
 
323 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000011059  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3400  transcriptional regulator, LacI family  37.17 
 
 
338 aa  199  7e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.125574 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4813  catabolite control protein A  31.85 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0449  catabolite control protein A  31.85 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.486602 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  38.08 
 
 
333 aa  198  1.0000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4790  catabolite control protein A  31.85 
 
 
332 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>