More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2301 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2301  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  100 
 
 
285 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.866945  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0827  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.15 
 
 
295 aa  294  1e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.122805 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3141  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  53.09 
 
 
300 aa  291  9e-78  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.522421  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3269  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  52.48 
 
 
301 aa  277  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2522  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.11 
 
 
297 aa  236  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227991  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.49 
 
 
299 aa  212  3.9999999999999995e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0352539  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2216  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.14 
 
 
301 aa  212  5.999999999999999e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0185  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.97 
 
 
301 aa  210  2e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.73 
 
 
299 aa  209  5e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0114  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.43 
 
 
299 aa  207  2e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0163331  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0478  ABC transporter, permease protein  41.15 
 
 
275 aa  206  3e-52  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4196  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.49 
 
 
292 aa  205  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0956  monosaccharide-transporting ATPase  41.6 
 
 
277 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0922285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0727  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.84 
 
 
279 aa  205  7e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000188602  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20610  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.04 
 
 
273 aa  205  7e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7904  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.31 
 
 
271 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0320  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.41 
 
 
300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0429  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
287 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0646  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.95 
 
 
301 aa  198  7e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1636  sugar ABC transporter, permease  37.04 
 
 
277 aa  198  9e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2317  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.15 
 
 
299 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2572  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 
281 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0717  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.02 
 
 
279 aa  196  3e-49  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0525  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.23 
 
 
282 aa  196  5.000000000000001e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.641488  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29030  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.56 
 
 
275 aa  195  7e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1657  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 
284 aa  195  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.354053  normal  0.174244 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1901  sugar ABC transporter, permease protein  36.3 
 
 
277 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.682079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3806  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.6 
 
 
300 aa  194  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06290  carbohydrate ABC transporter membrane protein  40.16 
 
 
291 aa  195  9e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5335  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.64 
 
 
278 aa  194  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.716321  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2918  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.61 
 
 
290 aa  192  4e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.787566  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.9 
 
 
296 aa  192  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000371485  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2573  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.21 
 
 
272 aa  192  4e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.91 
 
 
310 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4398  Monosaccharide-transporting ATPase  38.43 
 
 
281 aa  192  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000709548  normal  0.804646 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7346  ABC transporter membrane spanning protein (sugar)  36.86 
 
 
278 aa  192  7e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.477248  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4986  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 
301 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00963253  hitchhiker  0.006941 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.26 
 
 
278 aa  191  1e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.482027  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2094  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  37.23 
 
 
279 aa  190  2e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.179988  hitchhiker  0.00000184258 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0383  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.92 
 
 
268 aa  190  2e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3791  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 
300 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.17142  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1507  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.59 
 
 
303 aa  190  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.659062  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4633  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.18 
 
 
275 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.326622  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2917  ABC-type sugar transport system, permease component  40.58 
 
 
273 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2512  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.23 
 
 
292 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.660216  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3981  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.65 
 
 
274 aa  190  2.9999999999999997e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.270796  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2293  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
297 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0312  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.88 
 
 
298 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7693  putative transmembrane permease component of ABC transporter  37.02 
 
 
286 aa  187  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.673988 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2820  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.46 
 
 
299 aa  187  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0050805  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2265  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.07 
 
 
308 aa  187  2e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000413276 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3568  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.25 
 
 
315 aa  187  2e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.74 
 
 
275 aa  186  3e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2716  binding-protein-dependent transporter inner membrane component  38.64 
 
 
293 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.684184  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4623  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.04 
 
 
285 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2544  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.59 
 
 
299 aa  186  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.238071  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2832  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.66 
 
 
324 aa  186  4e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.051903  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2243  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 
307 aa  186  6e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.556058 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0634  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
284 aa  185  7e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.146391  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0659  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.37 
 
 
284 aa  185  7e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0401383  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0205  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.9 
 
 
279 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.67338  normal  0.16615 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21170  carbohydrate ABC transporter membrane protein  39.3 
 
 
302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.281989  normal  0.140209 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2194  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.16 
 
 
296 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.982521  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1358  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.88 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2483  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.88 
 
 
283 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0788706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2681  Monosaccharide-transporting ATPase  36.25 
 
 
278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.515759  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0289  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.96 
 
 
276 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3565  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.92 
 
 
291 aa  183  3e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.276199 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12076  sugar ABC transporter membrane protein  40.08 
 
 
280 aa  182  4.0000000000000006e-45  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2231  Monosaccharide-transporting ATPase  37.7 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2285  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.7 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00314445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0594  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.6 
 
 
293 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000740706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2366  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.15 
 
 
288 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.125554  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00882  L-arabinose transport system permease protein AraQ  34.06 
 
 
278 aa  182  8.000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0407955  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1044  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.47 
 
 
277 aa  181  1e-44  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0396  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.63 
 
 
722 aa  181  1e-44  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0626826  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1548  monosaccharide-transporting ATPase  36.69 
 
 
278 aa  181  1e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0471  ABC-type sugar transport system permease component-like  37.6 
 
 
276 aa  181  2e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4318  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.78 
 
 
295 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.574995  hitchhiker  0.00173435 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14810  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.92 
 
 
305 aa  181  2e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0148237 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4881  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.87 
 
 
295 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.48115  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4690  oxidoreductase domain protein  44.04 
 
 
699 aa  180  2.9999999999999997e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.614925  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03070  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.21 
 
 
296 aa  179  5.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.386443  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1605  ABC transporter sugar permease  36.69 
 
 
278 aa  178  9e-44  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2662  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.78 
 
 
304 aa  178  9e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3420  proteophosphoglycan ppg4  40.08 
 
 
272 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.257772  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5582  ABC transporter membrane spanning protein (galacturonic acid)  37.68 
 
 
293 aa  177  1e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.542291  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3228  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.08 
 
 
272 aa  178  1e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00685083  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.19 
 
 
276 aa  177  1e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0775264  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2199  monosaccharide-transporting ATPase  37.89 
 
 
269 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.139368  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2207  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.52 
 
 
299 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05110  carbohydrate ABC transporter membrane protein  37.26 
 
 
295 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29710  carbohydrate ABC transporter membrane protein  35.98 
 
 
304 aa  177  2e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.942295  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0506  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.82 
 
 
294 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0320  monosaccharide-transporting ATPase  40.72 
 
 
701 aa  177  2e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5332  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 
297 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.195165  normal  0.550162 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3073  sugar ABC transporter permease  35.9 
 
 
277 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.146884 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2313  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.11 
 
 
280 aa  177  3e-43  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0326071  normal  0.242877 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0296  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  35.32 
 
 
301 aa  176  3e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0210527 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0956  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.76 
 
 
286 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.143013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>