More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2271 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2271  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 
257 aa  526  1e-149  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2836  short chain dehydrogenase  45.88 
 
 
269 aa  218  7e-56  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.348617  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3773  short chain dehydrogenase  46.46 
 
 
273 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.302075  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3485  short chain dehydrogenase  47.24 
 
 
273 aa  217  2e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.591182 
 
 
-
 
NC_004310  BR1338  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.16343  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1298  short chain dehydrogenase  46.09 
 
 
269 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2407  short chain dehydrogenase  47.22 
 
 
278 aa  211  9e-54  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3912  short chain dehydrogenase  47.45 
 
 
275 aa  209  5e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1563  short chain dehydrogenase  45.67 
 
 
273 aa  206  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.17236 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2324  short chain dehydrogenase  45.31 
 
 
270 aa  205  5e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298747  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1834  short chain dehydrogenase  42.97 
 
 
269 aa  204  1e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.674997  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1815  short chain dehydrogenase  46.03 
 
 
258 aa  198  9e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.644023 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1726  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 
265 aa  191  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0937598  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1365  short chain dehydrogenase  42.02 
 
 
268 aa  188  9e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.468892  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1425  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  42.02 
 
 
268 aa  187  1e-46  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3593  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.14 
 
 
258 aa  179  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4654  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
272 aa  169  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.101922  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1771  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.69 
 
 
252 aa  167  2e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0123  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
268 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0201969  normal  0.963829 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26200  short chain dehydrogenase  38.58 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1783  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  37.9 
 
 
255 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000332127  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4841  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.49 
 
 
258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.166683  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1659  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
251 aa  161  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7696  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.15 
 
 
251 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.984897  normal  0.462493 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0729  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
251 aa  160  3e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0262547  n/a   
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3712  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.11 
 
 
252 aa  157  1e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0594  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
251 aa  158  1e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000426585  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0608  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38 
 
 
251 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.236394  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5136  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.11 
 
 
254 aa  157  1e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.708802  normal 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.98 
 
 
257 aa  156  4e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19857  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2450  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.36 
 
 
249 aa  155  6e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5536  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.46 
 
 
254 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0819159 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1592  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0734  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2279  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3005  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.7567  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1076  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1082  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
252 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1234  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
252 aa  154  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1510  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
258 aa  152  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.623129  normal  0.55267 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1173  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.89 
 
 
256 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0283651  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0213  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.06 
 
 
264 aa  152  7e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0268  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
250 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0541  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
251 aa  151  8e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7135  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.16 
 
 
254 aa  150  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0065631  normal  0.440854 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1783  glucose 1-dehydrogenase  34.8 
 
 
247 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.88349  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3466  glucose 1-dehydrogenase  34.8 
 
 
247 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0764776  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0553  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.2 
 
 
255 aa  150  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4827  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 
295 aa  150  2e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2035  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.2 
 
 
248 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000355798  normal  0.0941785 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2457  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
265 aa  149  3e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3255  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.04 
 
 
250 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1402  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  149  4e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1757  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.46 
 
 
302 aa  148  7e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1784  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.25 
 
 
280 aa  148  7e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.531836 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1680  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  38.55 
 
 
251 aa  148  8e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.447885  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.96 
 
 
244 aa  148  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3068  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.76 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1363  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.92 
 
 
254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000027503  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1526  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3667  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.6 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0876  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.58 
 
 
252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11090  Short-chain dehydrogenase/reductase  37.65 
 
 
286 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1963  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.89 
 
 
257 aa  146  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.922459 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0884  dehydrogenase  37.6 
 
 
257 aa  146  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2585  short chain dehydrogenase  36.08 
 
 
259 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.25122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0926  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.6 
 
 
249 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.598625  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1834  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.85 
 
 
252 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2867  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.69 
 
 
272 aa  145  5e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1326  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.54 
 
 
254 aa  145  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.393683 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3239  short chain dehydrogenase  37.65 
 
 
254 aa  145  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.304035  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0904  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  39.76 
 
 
256 aa  145  6e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.74 
 
 
251 aa  145  7.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22411  predicted protein  36.4 
 
 
321 aa  145  8.000000000000001e-34  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.339546  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5564  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.14 
 
 
250 aa  144  9e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0387947  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2071  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
256 aa  145  9e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00640028  hitchhiker  0.00000248708 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3357  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.82 
 
 
253 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00078495  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0761  putative oxidoreductase  34.39 
 
 
255 aa  144  1e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.429001 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1211  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
250 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.663428  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.15 
 
 
263 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.101369  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
256 aa  144  1e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00682949  normal  0.0302653 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0373  Short-chain alcohol dehydrogenase  37.89 
 
 
243 aa  144  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3132  3-hydroxybutyrate dehydrogenase  33.73 
 
 
258 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0908587  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5463  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.15 
 
 
251 aa  144  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230582  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2515  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 
250 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0834  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.4 
 
 
299 aa  144  2e-33  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.391136 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0926  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  40.16 
 
 
256 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1990  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.99 
 
 
256 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0224708  unclonable  0.0000202886 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2079  short chain dehydrogenase  37.89 
 
 
255 aa  143  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6225  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.3 
 
 
252 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40 
 
 
248 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.872133 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.93 
 
 
246 aa  143  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2162  3-ketoacyl-(acyl-carrier-protein) reductase  36.86 
 
 
252 aa  143  2e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0100529  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5682  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.35 
 
 
239 aa  143  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0460  short chain dehydrogenase  35.43 
 
 
291 aa  143  3e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3563  p-cumic alcohol dehydrogenase (CymB)  37.5 
 
 
252 aa  143  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.822337  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0936  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.44 
 
 
248 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.340631  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2365  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.29 
 
 
288 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000784864  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0242  Short-chain alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
253 aa  143  3e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>