More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2267 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2267  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  100 
 
 		 412 aa  842    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.213701  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0947  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.65 
 
 		 417 aa  472  1e-132  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0680792  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1541  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, C- domain protein  54.18 
 
 		 417 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.315954  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3948  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  54.05 
 
 		 451 aa  441  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1008  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.68 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.570237  normal  0.309423 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1377  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  53.53 
 
 		 438 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.488669 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5328  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.49 
 
 		 415 aa  430  1e-119  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2214  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  52.45 
 
 		 415 aa  424  1e-117  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0909  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  50.49 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.598164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4410  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.64 
 
 		 429 aa  386  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.164749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0977  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.74 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000913378  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.58 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3278  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  49.02 
 
 		 403 aa  355  7.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1427  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.77 
 
 		 403 aa  350  2e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.993388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2883  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.67 
 
 		 403 aa  348  9e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0617503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4254  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.01 
 
 		 399 aa  348  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.851358  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1004  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.67 
 
 		 403 aa  345  6e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.123594 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4063  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.77 
 
 		 399 aa  345  7e-94  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.546488  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4500  starvation sensing protein  46.08 
 
 		 404 aa  345  7e-94  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.244455  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2277  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.03 
 
 		 402 aa  345  8.999999999999999e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.612864  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0192  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.77 
 
 		 399 aa  344  1e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1270  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.45 
 
 		 404 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.525682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2635  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.19 
 
 		 404 aa  343  5e-93  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0759429  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1932  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.94 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0487555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1036  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.21 
 
 		 404 aa  342  7e-93  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07140  D-mannonate dehydratase  45.81 
 
 		 402 aa  342  9e-93  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.537507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4132  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.93 
 
 		 407 aa  342  9e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0168136  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0802  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.95 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3563  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.57 
 
 		 404 aa  341  1e-92  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.851149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0037  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.94 
 
 		 403 aa  341  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1162  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.5 
 
 		 404 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.233578  normal  0.767056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01550  predicted dehydratase  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.292633  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2062  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0579559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1654  starvation-sensing protein RspA  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0315691  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01540  hypothetical protein  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.531925  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1788  starvation-sensing protein RspA  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.533189  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2049  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.94 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.362051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1619  starvation-sensing protein RspA  45.94 
 
 		 404 aa  339  5e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.000210785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3561  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.59 
 
 		 431 aa  339  5.9999999999999996e-92  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03854  starvation sensing protein  48.44 
 
 		 419 aa  337  1.9999999999999998e-91  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0048  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.21 
 
 		 405 aa  337  2.9999999999999997e-91  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.396103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0790  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.5 
 
 		 409 aa  336  3.9999999999999995e-91  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1835  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.3 
 
 		 403 aa  336  5e-91  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0553665 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1675  starvation sensing protein RspA  46.7 
 
 		 404 aa  335  7.999999999999999e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1889  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  46.04 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0204033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1667  starvation sensing protein RspA  46.45 
 
 		 404 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.546434  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4722  Galactonate dehydratase  46.73 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.44454  normal  0.932737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1693  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  47.52 
 
 		 402 aa  335  1e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.721451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1607  starvation sensing protein RspA  46.45 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1616  starvation sensing protein RspA  46.45 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1834  starvation sensing protein RspA  46.45 
 
 		 404 aa  334  2e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.768737  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2983  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.82 
 
 		 411 aa  333  5e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0331585  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1424  mandelate racemase / muconate lactonizing enzyme  45.05 
 
 		 402 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1364  starvation sensing protein  45.05 
 
 		 402 aa  332  1e-89  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.185612  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0510  starvation sensing protein RspA  46.29 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.631035  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2096  starvation sensing protein RspA  46.29 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2001  starvation sensing protein RspA  46.29 
 
 		 402 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3318  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.26 
 
 		 411 aa  330  4e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0708913 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2974  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  44.94 
 
 		 403 aa  329  6e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5132  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.79 
 
 		 402 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4599  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.79 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.316488  normal  0.738385 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02420  D-mannonate dehydratase  44.33 
 
 		 402 aa  327  3e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296933  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0766  starvation sensing protein RspA  45.79 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03730  D-mannonate dehydratase  43.34 
 
 		 411 aa  326  4.0000000000000003e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.723045 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0583  starvation sensing protein RspA  45.79 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0980874  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0694  starvation sensing protein RspA  45.79 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.58786  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1648  starvation sensing protein RspA  45.79 
 
 		 402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3978  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme  43.7 
 
 		 403 aa  325  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.610383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1064  galactokinase  44.06 
 
 		 402 aa  323  3e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.32364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5060  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.97 
 
 		 402 aa  318  1e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000550231  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2407  mandelate racemase/muconate-lactonizing protein  42.2 
 
 		 409 aa  318  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.360808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2128  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  43.32 
 
 		 402 aa  316  4e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0291  mandelate racemase/muconate lactonizing-like protein  44.39 
 
 		 423 aa  314  9.999999999999999e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0398096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4403  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  44.12 
 
 		 406 aa  315  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.73485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0504  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45 
 
 		 409 aa  314  1.9999999999999998e-84  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3675  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  45.05 
 
 		 402 aa  311  1e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.468042  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01410  D-mannonate dehydratase  43.73 
 
 		 412 aa  310  2e-83  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4287  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  40.98 
 
 		 405 aa  301  1e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.723676 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2597  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  32.34 
 
 		 388 aa  193  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.598556  normal  0.375027 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0122  galactonate dehydratase  33.7 
 
 		 384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.041758  normal  0.798356 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1664  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 		 382 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2866  galactonate dehydratase  32.78 
 
 		 382 aa  179  7e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4653  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.97 
 
 		 400 aa  175  9.999999999999999e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0414891  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51320  galactonate dehydratase  33.24 
 
 		 382 aa  175  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3894  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.9 
 
 		 384 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.519515  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3392  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  34.05 
 
 		 398 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0131029  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5256  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.56 
 
 		 392 aa  168  1e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0025  galactonate dehydratase  31.14 
 
 		 382 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.192366  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3598  galactonate dehydratase  32.43 
 
 		 382 aa  167  4e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.729698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3848  mandelate racemase/muconate lactonizing protein  33.42 
 
 		 388 aa  167  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.161688 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1554  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.29 
 
 		 393 aa  167  4e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.124139  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0586  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  30.65 
 
 		 382 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00367627 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0390  galactonate dehydratase  31.99 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.100514  normal  0.488186 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0044  galactonate dehydratase  30.89 
 
 		 382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.360565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2688  Mandelate racemase/muconate lactonizing protein  31.53 
 
 		 393 aa  166  6.9999999999999995e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0433  galactonate dehydratase  31.14 
 
 		 382 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.34187  normal  0.994334 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2055  galactonate dehydratase  31.9 
 
 		 382 aa  166  9e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2695  galactonate dehydratase  31.9 
 
 		 382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0631  galactonate dehydratase  32.15 
 
 		 382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2666  galactonate dehydratase  31.9 
 
 		 382 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>