106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2201 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2201  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  100 
 
 
343 aa  700    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2732  glycoside hydrolase family 43  53.87 
 
 
315 aa  309  4e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04520  beta-xylosidase  49.84 
 
 
491 aa  263  3e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.130696  normal  0.0670778 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2813  glycoside hydrolase family 43  49.16 
 
 
331 aa  262  6e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0257715  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3750  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  46.6 
 
 
319 aa  251  2e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00407758  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1995  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.04 
 
 
355 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000026265  hitchhiker  0.0000968585 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4284  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  43.67 
 
 
327 aa  243  3e-63  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1390  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  43.32 
 
 
341 aa  243  3.9999999999999997e-63  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.287204  normal  0.664348 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1980  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.04 
 
 
355 aa  242  9e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000532018  hitchhiker  0.000349844 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2051  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.23 
 
 
357 aa  240  2e-62  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2082  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.75 
 
 
356 aa  239  4e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000230744  hitchhiker  0.000000189943 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0516  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  41.06 
 
 
366 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.00000112186  decreased coverage  0.000226611 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0989  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  46.42 
 
 
334 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0127699  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0179  cellulose-binding family II  43.71 
 
 
598 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00318302 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2156  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  39.94 
 
 
352 aa  235  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000116592  hitchhiker  0.00999646 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0786  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  40.07 
 
 
346 aa  222  6e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000141301  normal  0.447167 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1014  arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  42.07 
 
 
472 aa  219  6e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000194163  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0078  Arabinan endo-1,5-alpha-L-arabinosidase  44.63 
 
 
379 aa  213  2.9999999999999995e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144884  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1729  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 
472 aa  178  1e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.101805  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6081  glycoside hydrolase family 43  37.5 
 
 
480 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2449  glycoside hydrolase family 43  32.65 
 
 
537 aa  135  9.999999999999999e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114761  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08007  Endo-alpha-1,5-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AUM3]  36.1 
 
 
320 aa  134  3e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.766445 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02534  endoarabinanase (Eurofung)  35.48 
 
 
380 aa  126  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06352  Endo-alpha-1,5-L-arabinanasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q5AZC8]  29.09 
 
 
400 aa  125  7e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.605603  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03044  Endo-arabinanase [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q1HFU2]  29.83 
 
 
386 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4703  glycoside hydrolase family 43  33.65 
 
 
341 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.184013  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0510  glycoside hydrolase family 43  29.91 
 
 
456 aa  112  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0180422  hitchhiker  0.00320544 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2423  glycoside hydrolase family 43  31.04 
 
 
699 aa  112  7.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4496  glycoside hydrolase family 43  30.36 
 
 
503 aa  110  5e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0241272  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3403  glycoside hydrolase family 43  33.33 
 
 
357 aa  108  1e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000194853  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2047  glycoside hydrolase family protein  29.03 
 
 
1112 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000114958  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0637  glycoside hydrolase family protein  33.83 
 
 
471 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000622549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0639  glycoside hydrolase family protein  28.96 
 
 
475 aa  105  1e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000370471  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0015  alpha-L-arabinofuranosidase B  27.84 
 
 
707 aa  102  8e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1622  glycoside hydrolase family 43  31.89 
 
 
703 aa  99.8  5e-20  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.372812  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0662  glycoside hydrolase family protein  31.97 
 
 
471 aa  99.8  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0000191922  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0664  glycoside hydrolase family protein  28.32 
 
 
476 aa  99  9e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2809  ATPase  26.42 
 
 
789 aa  97.8  2e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.153749  decreased coverage  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1623  glycoside hydrolase family 43  29.8 
 
 
804 aa  95.1  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0299424  normal  0.680345 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29390  beta-xylosidase  31.78 
 
 
494 aa  94  3e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.838648  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4504  glycoside hydrolase family 43  30.52 
 
 
510 aa  94  3e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1999  glycoside hydrolase family protein  28.64 
 
 
1121 aa  94  4e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000101187  decreased coverage  0.0000000170847 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1976  glycoside hydrolase family protein  28.57 
 
 
1121 aa  93.2  5e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00565193  hitchhiker  0.00420486 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3292  glycoside hydrolase family 43  31.34 
 
 
488 aa  92  1e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.223704  hitchhiker  0.00299224 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2086  beta-xylosidase-like protein  28.4 
 
 
1121 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00280414  decreased coverage  0.0000000469917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1393  immunoglobulin I-set domain-containing protein  29.1 
 
 
810 aa  84.3  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0473  glycoside hydrolase family 43  29.86 
 
 
829 aa  83.6  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.658009  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6044  glycoside hydrolase family 43  26.41 
 
 
501 aa  82.8  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.845022  normal  0.0554344 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0737  glycoside hydrolase family protein  25.95 
 
 
345 aa  79.7  0.00000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.612706  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2161  glycoside hydrolase family protein  26.3 
 
 
1143 aa  77  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000526501  hitchhiker  0.0000457644 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1524  glycoside hydrolase family 43  26.56 
 
 
524 aa  74.7  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3360  glycoside hydrolase family 43  27.27 
 
 
522 aa  75.1  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0779432 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3317  Beta-xylosidase-like  25.65 
 
 
1174 aa  67.8  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00018095  hitchhiker  0.000000702951 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2728  hypothetical protein  28.5 
 
 
848 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1543  beta-xylosidase  23.48 
 
 
531 aa  60.1  0.00000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.000200892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0507  glycoside hydrolase family 43  22.9 
 
 
337 aa  59.3  0.00000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.412329 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1542  beta-xylosidase  26.12 
 
 
581 aa  58.2  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0430  glycoside hydrolase family 43  26.27 
 
 
497 aa  58.2  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.710686 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4511  glycoside hydrolase family protein  24.91 
 
 
341 aa  57.4  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2866  glycoside hydrolase family 43  25.95 
 
 
487 aa  57  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.141314  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0501  glycoside hydrolase family 43  24.76 
 
 
525 aa  56.6  0.0000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00998877 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2723  glycoside hydrolase family protein  24.07 
 
 
345 aa  55.8  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.469303  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4087  glycoside hydrolase family 43  25.66 
 
 
357 aa  55.8  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0875  glycoside hydrolase family protein  24.08 
 
 
636 aa  55.5  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000412559  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2022  glycoside hydrolase family 43  25.69 
 
 
334 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3569  glycoside hydrolase family 43  25.79 
 
 
484 aa  54.3  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0058203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3228  glycoside hydrolase family protein  24.55 
 
 
563 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  decreased coverage  0.00674596  normal  0.0120766 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  28.99 
 
 
535 aa  53.5  0.000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2409  hypothetical protein  24.5 
 
 
541 aa  52.8  0.000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0289  xylan 1,4-beta-xylosidase  26.28 
 
 
532 aa  52.8  0.000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000021727  normal  0.556687 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1143  Alpha-L-arabinofuranosidase  24.84 
 
 
523 aa  52.4  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0191  glycoside hydrolase family protein  26.18 
 
 
512 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5511  glycoside hydrolase family 43  24.61 
 
 
536 aa  51.6  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0274092 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2090  Alpha-N-arabinofuranosidase  24.16 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00759162  normal  0.572245 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2329  Xylan 1,4-beta-xylosidase  24.09 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.80101  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3438  glycoside hydrolase family 43  24.45 
 
 
519 aa  50.4  0.00004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.990127  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0650  glycoside hydrolase family 43  23.3 
 
 
495 aa  50.1  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0713148  normal  0.104092 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1150  glycoside hydrolase family 43  25.56 
 
 
560 aa  50.4  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2318  alpha-N-arabinofuranosidase  27.04 
 
 
512 aa  50.4  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.389032  normal  0.249416 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0795  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.41 
 
 
346 aa  50.1  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000173963  normal  0.0629112 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2459  Xylan 1,4-beta-xylosidase  25.11 
 
 
488 aa  49.3  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1710  Alpha-N-arabinofuranosidase  25 
 
 
541 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.783601  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4788  Xylan 1,4-beta-xylosidase  27.31 
 
 
562 aa  48.5  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.771274  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2698  glycoside hydrolase family 43  26.21 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.898004  normal  0.338928 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_07864  conserved hypothetical protein  23.87 
 
 
540 aa  47.8  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0157749  normal  0.535242 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3728  Alpha-L-arabinofuranosidase  25.81 
 
 
383 aa  47.4  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3599  glycoside hydrolase family 43  23.11 
 
 
497 aa  47.8  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0127437  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0206  glycoside hydrolase family 43  24.05 
 
 
304 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.306204  normal  0.253285 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1616  alpha-L-arabinofuranosidase  28.19 
 
 
550 aa  47.4  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.347525  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3531  glycoside hydrolase family 43  24.3 
 
 
511 aa  47.4  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.185955 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3351  glycoside hydrolase family 43  24.42 
 
 
522 aa  47  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2041  polyfunctional acetylxylan esterase/b-xylosidase/a-L-arabinofuranosidase, CBM9 module, glycoside hydrolase family 43 protein and carbohydrate esterase family 6 protein  25 
 
 
1585 aa  46.2  0.0008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2632  glycoside hydrolase family protein  24.71 
 
 
543 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0211688  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3398  glycoside hydrolase family protein  27.99 
 
 
514 aa  46.2  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0740676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4681  glycoside hydrolase family protein  26.05 
 
 
492 aa  45.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.026787  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3224  Alpha-N-arabinofuranosidase  27.35 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.136595  normal  0.135367 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1878  beta-xylosidase  25.76 
 
 
539 aa  45.8  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4501  Alpha-N-arabinofuranosidase  29.44 
 
 
316 aa  45.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.570213  normal  0.69004 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0353  Xylan 1,4-beta-xylosidase  22.51 
 
 
346 aa  45.8  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0936  Alpha-N-arabinofuranosidase  23.46 
 
 
546 aa  45.1  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.789253 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>