More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2183 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2183  ABC transporter related protein  100 
 
 
608 aa  1236    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3260  ABC transporter related  37.38 
 
 
623 aa  363  3e-99  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2538  ABC transporter related  36.39 
 
 
619 aa  353  7e-96  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0661  ABC transporter related  39.5 
 
 
625 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.127952  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0404  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
609 aa  346  6e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0389  ABC transporter related protein  37.23 
 
 
616 aa  345  1e-93  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1927  ABC transporter related  36.75 
 
 
615 aa  342  9e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.682605  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0530  ABC transporter related  36.1 
 
 
625 aa  338  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164173  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2224  ABC transporter-like  35.5 
 
 
604 aa  336  7e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3357  ABC transporter related  34.29 
 
 
592 aa  325  1e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2067  ABC transporter related  34.96 
 
 
621 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.351689  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1982  ABC transporter-related protein  34.96 
 
 
621 aa  324  3e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.186428  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2389  ABC transporter related  35.93 
 
 
615 aa  324  3e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.168027 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2085  ABC transporter related  36.15 
 
 
618 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.836292 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0429  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
618 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2490  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.14 
 
 
603 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1897  ABC transporter, ATPase subunit  34.62 
 
 
621 aa  319  7.999999999999999e-86  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.423681  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2295  ABC transporter, transmembrane region:ABC transporter  35.69 
 
 
603 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000465139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0478  ABC transporter related  34.63 
 
 
611 aa  318  2e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0961856  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1868  ABC transporter related  36.72 
 
 
638 aa  317  4e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.133041  normal  0.243769 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2353  ABC transporter related  35.83 
 
 
618 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3698  ABC transporter related  34.62 
 
 
611 aa  311  2.9999999999999997e-83  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.736817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4332  ABC transporter related  35.12 
 
 
614 aa  310  6.999999999999999e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.754277  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2658  ABC transporter related  35.95 
 
 
623 aa  308  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.0555578 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00656  ABC transporter ATP-binding protein  34.34 
 
 
626 aa  302  1e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0755055  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0603  ABC transporter-like protein  36.94 
 
 
599 aa  300  6e-80  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.131331 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0894  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  32.78 
 
 
600 aa  298  2e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.652846  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2541  ABC transporter related  33.67 
 
 
613 aa  298  2e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00684037 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2701  ABC transporter related  34.93 
 
 
605 aa  295  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1963  ABC transporter related  35.55 
 
 
625 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0472516  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1915  ABC transporter related  33.5 
 
 
613 aa  279  1e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7737  carbohydrate ABC transporter  32.89 
 
 
619 aa  278  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.160042  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0061  ABC transporter related  36.03 
 
 
606 aa  276  6e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0397  carbohydrate ABC transporter  32.72 
 
 
626 aa  276  1.0000000000000001e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0315  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  28.84 
 
 
594 aa  273  4.0000000000000004e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0532583  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4186  ABC transporter related  32.07 
 
 
611 aa  272  1e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.938404  hitchhiker  0.0036434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4501  ABC transporter related  31.7 
 
 
621 aa  271  2e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2000  ABC transporter ATP-binding protein/peptidase  29.88 
 
 
566 aa  271  2.9999999999999997e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0533598  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3756  ABC transporter related  33.55 
 
 
595 aa  271  4e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0323  ABC transporter-related protein  28.57 
 
 
608 aa  270  8e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0411  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  30.64 
 
 
587 aa  267  4e-70  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2561  ABC transporter related protein  31.64 
 
 
616 aa  260  5.0000000000000005e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.870774 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2944  subtilin ABC transporter  27.17 
 
 
597 aa  258  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000010922  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0971  ABC transporter related protein  33.11 
 
 
626 aa  258  3e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0086  ABC transporter related  30.94 
 
 
618 aa  250  4e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0117635  unclonable  0.0000119825 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2022  ABC transporter related  32.64 
 
 
605 aa  246  6e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0029505 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5831  ABC transporter related  33.83 
 
 
633 aa  244  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5809  ABC transporter related  34.52 
 
 
578 aa  243  7e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3487  ABC transporter related protein  28.6 
 
 
616 aa  239  8e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908956  normal  0.590401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0479  ABC transporter related protein  30.61 
 
 
596 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1719  ABC transporter related  29.5 
 
 
631 aa  233  1e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.737168  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2201  ABC transporter related  31.34 
 
 
618 aa  231  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0878043  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0830  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
596 aa  230  6e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0162208  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0829  ABC transporter, ATP-binding protein  28.18 
 
 
603 aa  230  7e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.588647  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0818  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 
596 aa  229  1e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1838  ABC transporter related protein  29.51 
 
 
611 aa  228  2e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.355315  normal  0.263806 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0817  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein  28.2 
 
 
603 aa  229  2e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1832  ABC transporter related  30.39 
 
 
608 aa  225  2e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5807  ABC transporter related  32.38 
 
 
627 aa  224  4e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2200  ABC transporter related  28.08 
 
 
626 aa  224  4e-57  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.565977  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7945  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  30.74 
 
 
633 aa  224  4.9999999999999996e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.340553  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1278  ABC transporter related protein  29.83 
 
 
617 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44710  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.51 
 
 
596 aa  219  7.999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3116  ABC transporter related  33.48 
 
 
610 aa  218  2e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2586  ABC transporter related  28.27 
 
 
619 aa  218  2e-55  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000702067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0594  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.08 
 
 
613 aa  218  2e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3115  ABC transporter related  36.94 
 
 
606 aa  218  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0807  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  33.33 
 
 
605 aa  216  8e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2031  ABC transporter related  33.84 
 
 
500 aa  214  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3591  ABC transporter related protein  30.58 
 
 
623 aa  214  2.9999999999999995e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.727827  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2876  ABC transporter related  27.85 
 
 
619 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.39915  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1807  ABC transporter related protein  29.82 
 
 
662 aa  211  2e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0965737  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00588  lipid A export permease/ATP-binding protein MsbA  35.54 
 
 
569 aa  211  3e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.232531  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5649  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.62 
 
 
583 aa  210  5e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2356  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  37.88 
 
 
618 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.249841 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5367  lipid ABC transporter ATPase/inner membrane protein  36.84 
 
 
614 aa  210  8e-53  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.765695  decreased coverage  0.00185624 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2635  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  37.88 
 
 
618 aa  209  1e-52  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.239281 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4067  ABC transporter related  31.95 
 
 
596 aa  209  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00142757  normal  0.169154 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0971  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.05 
 
 
594 aa  209  1e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2226  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.44 
 
 
593 aa  209  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.472493  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  38.68 
 
 
556 aa  209  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1695  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  36.44 
 
 
623 aa  209  2e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.733558  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2346  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.44 
 
 
583 aa  208  2e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.571332  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2330  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.44 
 
 
593 aa  208  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.273025 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2313  lipid A ABC exporter family, fused ATPase and inner membrane subunits  39.27 
 
 
622 aa  208  3e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0680321 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0184  ABC transporter, ATP-binding protein  28.24 
 
 
586 aa  207  4e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0389  ABC transporter ATP-binding protein  35.71 
 
 
582 aa  207  4e-52  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2307  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  36.44 
 
 
583 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1062  ABC transporter ATP-binding protein  36.1 
 
 
625 aa  207  6e-52  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.908887  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0353  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.45 
 
 
582 aa  207  6e-52  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.693994  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2507  lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  38.83 
 
 
579 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0481  Lipid A export ATP-binding/permease protein MsbA  33.64 
 
 
600 aa  206  1e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1860  ABC transporter related  38.11 
 
 
584 aa  206  1e-51  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.827939  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0185  ABC transporter related  42.17 
 
 
611 aa  205  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.821513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0310  lipid A ABC exporter, fused ATPase and inner membrane subunits MsbA  35.48 
 
 
592 aa  204  3e-51  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1517  ABC transporter related  31.5 
 
 
622 aa  204  3e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0270  ABC transporter related  33.65 
 
 
626 aa  204  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3290  ABC multidrug efflux pump, fused ATPase and inner membrane subunits  34.83 
 
 
597 aa  204  3e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66080  transport protein MsbA  34.31 
 
 
603 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0730  ABC transporter related  37.84 
 
 
579 aa  203  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.264899  normal  0.102225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>