233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2051 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_2051  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 536 aa  1103    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0258  extracellular solute-binding protein family 1  64.4 
 
 		 477 aa  614  9.999999999999999e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0287  extracellular solute-binding protein family 1  63.96 
 
 		 477 aa  607  9.999999999999999e-173  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.635572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3584  hypothetical protein  58.37 
 
 		 484 aa  570  1e-161  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.638591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2095  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.76 
 
 		 569 aa  128  3e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.105917 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2047  extracellular solute-binding protein  26.73 
 
 		 580 aa  120  6e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.120072  normal  0.523187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0375  extracellular solute-binding protein  26.76 
 
 		 574 aa  120  9e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.812044  normal  0.244045 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1898  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 579 aa  118  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.477877  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5939  extracellular solute-binding protein family 1  26.1 
 
 		 610 aa  118  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2416  extracellular solute-binding protein  25.78 
 
 		 577 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  unclonable  0.000000012875  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1738  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 579 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.217891 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2696  extracellular solute-binding protein  27.06 
 
 		 498 aa  115  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4387  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  26.86 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.136814 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2264  extracellular solute-binding protein, family 1  25.56 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.864304  decreased coverage  0.00109234 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2456  extracellular solute-binding protein  26.46 
 
 		 451 aa  115  3e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.674954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1445  extracellular solute-binding protein family 1  25.89 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0779886  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3473  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 579 aa  115  3e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.971584  hitchhiker  0.00076059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2089  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115344  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9075  hypothetical protein  26.29 
 
 		 558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2227  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  27.04 
 
 		 580 aa  110  5e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.272484  normal  0.0425945 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4889  putative periplasmic binding ABC transporter protein, putative sugar binding precursor  25.83 
 
 		 596 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2317  extracellular solute-binding protein  25.82 
 
 		 577 aa  110  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000660046  normal  0.503814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0487  extracellular solute-binding protein family 1  27.13 
 
 		 433 aa  110  9.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3735  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.95 
 
 		 590 aa  109  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.217509  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3630  extracellular solute-binding protein  25.67 
 
 		 580 aa  109  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.535547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2663  ABC sugar (glycerol) transporter, periplasmic binding protein  26.45 
 
 		 574 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.716249  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0483  twin-arginine translocation pathway signal  25.15 
 
 		 579 aa  108  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00131469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1969  extracellular solute-binding protein  25.94 
 
 		 588 aa  108  2e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.386461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5977  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.78 
 
 		 574 aa  108  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4098  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 569 aa  108  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00991271  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3333  conserved hypothetical signal peptide protein  25.36 
 
 		 578 aa  108  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1201  extracellular solute-binding protein  26.05 
 
 		 572 aa  108  3e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.487559  normal  0.842714 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1742  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  24.79 
 
 		 590 aa  107  4e-22  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.284147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2986  putative signal peptide protein  25.21 
 
 		 581 aa  107  4e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7822  putative ABC-type sugar transport system, periplasmic component  25.48 
 
 		 486 aa  107  4e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3051  putative signal peptide protein  25.25 
 
 		 580 aa  107  5e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0886733 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6464  putative sugar ABC transporter, substrate-binding protein  25.78 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.724776 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1321  extracellular solute-binding protein  26.25 
 
 		 574 aa  107  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  decreased coverage  0.00160153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4211  extracellular solute-binding protein  25.52 
 
 		 598 aa  107  7e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.64235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2286  extracellular solute-binding protein family 1  25.21 
 
 		 484 aa  106  8e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.322369 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0389  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 577 aa  105  1e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.83487  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1743  extracellular solute-binding protein family 1  25.69 
 
 		 447 aa  105  1e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1367  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 595 aa  105  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.15999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3127  sugar ABC transporter  24.58 
 
 		 579 aa  105  3e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2426  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.741734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0381  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 577 aa  104  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0000205955  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3671  extracellular solute-binding protein  25.26 
 
 		 577 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  decreased coverage  0.00462233  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3391  extracellular solute-binding protein  24.85 
 
 		 577 aa  103  8e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.285234  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3169  sugar ABC transporter extracellular solute-binding family 1 protein  24.57 
 
 		 573 aa  103  9e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  0.0000122164  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1030  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 577 aa  103  9e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2909  extracellular solute-binding protein  25.46 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175958  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0100  hypothetical protein  24.48 
 
 		 574 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0356789  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1597  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 573 aa  102  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491116  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1918  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  23.98 
 
 		 573 aa  102  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000332483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0671  extracellular solute-binding protein  29.81 
 
 		 436 aa  100  8e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.687145  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2229  extracellular solute-binding protein  25.3 
 
 		 580 aa  100  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0301867  normal  0.190368 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2610  extracellular solute-binding protein  26.39 
 
 		 477 aa  99.8  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2204  extracellular solute-binding protein  24.9 
 
 		 579 aa  98.6  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5372  extracellular solute-binding protein  24.54 
 
 		 580 aa  99  2e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.737373 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0609  extracellular solute-binding protein  24.24 
 
 		 577 aa  99.4  2e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.348028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4989  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 436 aa  99  2e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.192631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4063  extracellular solute-binding protein  24.69 
 
 		 599 aa  95.5  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.159076  normal  0.524387 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3982  extracellular solute-binding protein  25.36 
 
 		 573 aa  95.9  2e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.227864  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0305  extracellular solute-binding protein  24.7 
 
 		 428 aa  93.2  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.937006  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 449 aa  92  2e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5858  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 435 aa  91.3  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.437643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0699  extracellular solute-binding protein  22.44 
 
 		 443 aa  90.9  5e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0309  extracellular solute-binding protein  26.5 
 
 		 438 aa  89.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.242924  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1357  extracellular solute-binding protein family 1  23.8 
 
 		 467 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000953949 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4940  extracellular solute-binding protein family 1  22.29 
 
 		 484 aa  87.8  4e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6724  extracellular solute-binding protein family 1  23.53 
 
 		 580 aa  87.8  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1212  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 497 aa  87.8  5e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3006  extracellular solute-binding protein  23.51 
 
 		 467 aa  87.8  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1283  extracellular solute-binding protein  23.82 
 
 		 497 aa  87  7e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1420  extracellular solute-binding protein  24.8 
 
 		 478 aa  87  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.30312  normal  0.358597 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1533  extracellular solute-binding protein  25.14 
 
 		 478 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.219593 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1213  extracellular solute-binding protein  24.43 
 
 		 497 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3164  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.625995  hitchhiker  0.00215615 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 424 aa  84  0.000000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3021  extracellular solute-binding protein  23.85 
 
 		 487 aa  84  0.000000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5638  extracellular solute-binding protein family 1  25.15 
 
 		 443 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3333  transporter, putative  24.14 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2082  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.89 
 
 		 422 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.890991  normal  0.0137332 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2172  carbohydrate ABC transporter periplasmic-binding protein  23.89 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00849198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2280  extracellular solute-binding protein  23.89 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4125  extracellular solute-binding protein  23.56 
 
 		 408 aa  80.9  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4707  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 419 aa  80.9  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0228  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.89 
 
 		 439 aa  80.1  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6371  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 443 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.970426 
 
 
-
 
NC_004310  BR0235  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.34 
 
 		 439 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.61248  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2375  transporter, putative  23.1 
 
 		 479 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.229304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2459  extracellular solute-binding protein  23.34 
 
 		 443 aa  77.4  0.0000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.924766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5744  extracellular solute-binding protein family 1  26.24 
 
 		 419 aa  77  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.593109 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4979  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 439 aa  76.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.336131  normal  0.060129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2420  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.783182  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2465  extracellular solute-binding protein  23.11 
 
 		 443 aa  75.9  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.270585  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2670  extracellular solute-binding protein  22.48 
 
 		 482 aa  73.9  0.000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00030492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3495  extracellular solute-binding protein, family 1  23.7 
 
 		 487 aa  73.2  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413396  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0048  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 513 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2278  extracellular solute-binding protein  23.67 
 
 		 448 aa  72  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>