More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1920 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
563 aa  1137    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.39 
 
 
552 aa  401  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.68 
 
 
562 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.05 
 
 
535 aa  364  3e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.32 
 
 
624 aa  360  3e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.11 
 
 
546 aa  356  5e-97  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.14 
 
 
568 aa  356  5.999999999999999e-97  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.64 
 
 
602 aa  352  1e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.04 
 
 
543 aa  348  1e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
543 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.85 
 
 
543 aa  346  6e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
545 aa  344  2.9999999999999997e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.96 
 
 
716 aa  339  9e-92  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.72 
 
 
590 aa  338  9.999999999999999e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.75 
 
 
1376 aa  333  7.000000000000001e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.37 
 
 
646 aa  327  3e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.95 
 
 
793 aa  326  6e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.65 
 
 
630 aa  317  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.63 
 
 
588 aa  317  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.04 
 
 
626 aa  310  2.9999999999999997e-83  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1009  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.12 
 
 
571 aa  308  2.0000000000000002e-82  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.752624 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.2 
 
 
556 aa  308  2.0000000000000002e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1208  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.09 
 
 
515 aa  305  2.0000000000000002e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000154408  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.51 
 
 
607 aa  302  1e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.6 
 
 
708 aa  302  1e-80  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0436  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.34 
 
 
503 aa  299  9e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.08 
 
 
590 aa  298  2e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.91 
 
 
557 aa  292  9e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1540  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
509 aa  292  1e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000119534  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1394  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
509 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000165058  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1505  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.31 
 
 
509 aa  292  1e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000020318  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  45.07 
 
 
615 aa  290  5.0000000000000004e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.07 
 
 
497 aa  289  1e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3805  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.92 
 
 
509 aa  288  2e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000127885  hitchhiker  1.2294e-16 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1366  ATP-dependent DNA helicase Q  36.01 
 
 
509 aa  288  2e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000433489  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1413  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.31 
 
 
594 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1367  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.81 
 
 
509 aa  287  4e-76  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000501878  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1407  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.8 
 
 
509 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.00000181661  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1902  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.95 
 
 
630 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.204638  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1579  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 
509 aa  285  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.50409e-40 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4237  RecQ domain-containing protein  44.57 
 
 
690 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1318  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.78 
 
 
419 aa  283  6.000000000000001e-75  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.227704  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  45.43 
 
 
621 aa  283  6.000000000000001e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1056  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.4 
 
 
584 aa  283  7.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.56 
 
 
595 aa  282  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1646  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 
509 aa  281  2e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000105464  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  44.28 
 
 
679 aa  281  2e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.28 
 
 
595 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.99 
 
 
527 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0617  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 
681 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1924  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family protein  36.21 
 
 
669 aa  279  1e-73  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  41.21 
 
 
597 aa  279  1e-73  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0041  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.39 
 
 
615 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00446699  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.87 
 
 
707 aa  278  3e-73  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.7 
 
 
605 aa  277  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 
658 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 
665 aa  277  4e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0760  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.37 
 
 
479 aa  276  5e-73  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000462487  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3741  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.66 
 
 
705 aa  276  7e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.158627  normal  0.0164028 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1262  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.94 
 
 
634 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.32 
 
 
626 aa  276  9e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.74 
 
 
658 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.171649 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4189  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.69 
 
 
611 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00948478 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4343  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
609 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3763  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 
607 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.228349 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 
607 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4157  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.41 
 
 
611 aa  274  3e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4289  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
609 aa  274  3e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4046  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
609 aa  274  3e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5263  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
611 aa  274  3e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.695622 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.27 
 
 
607 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2380  RecQ domain-containing protein  43.11 
 
 
654 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03701  ATP-dependent DNA helicase  42.41 
 
 
611 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.644555  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03650  hypothetical protein  42.41 
 
 
609 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.738686  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1309  hypothetical protein  33.54 
 
 
637 aa  273  6e-72  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.41 
 
 
609 aa  273  6e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.802851 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.57 
 
 
617 aa  273  8.000000000000001e-72  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2085  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.42 
 
 
662 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0787976  hitchhiker  0.00232303 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
615 aa  272  1e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42 
 
 
607 aa  272  1e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5465  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.47 
 
 
637 aa  271  2e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
662 aa  271  2e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.88 
 
 
617 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2377  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
662 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0320482  normal  0.0846524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0193  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.79 
 
 
599 aa  271  2.9999999999999997e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.372053  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2260  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.42 
 
 
662 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0596276  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0072  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.4 
 
 
674 aa  270  7e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.234386  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0053  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.54 
 
 
619 aa  269  8e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4154  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 
608 aa  269  1e-70  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00653276  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0199  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
602 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 
606 aa  268  1e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2928  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.3 
 
 
728 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000212564  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3964  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
608 aa  268  2e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.9333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.06 
 
 
607 aa  267  4e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.54 
 
 
721 aa  267  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2318  23S rRNA (Gm2251)-methyltransferase  39.78 
 
 
648 aa  266  5.999999999999999e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0019664  hitchhiker  0.00147511 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 
599 aa  266  5.999999999999999e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0011  putative ATP-dependent DNA helicase  41.4 
 
 
639 aa  266  5.999999999999999e-70  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4166  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 
615 aa  266  7e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4238  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.5 
 
 
615 aa  266  8e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>