More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1919 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 252 aa  499  1e-140  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 		 251 aa  249  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  52.38 
 
 		 251 aa  241  1e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  52.78 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 251 aa  240  2e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  50.4 
 
 		 251 aa  238  6.999999999999999e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  50.79 
 
 		 251 aa  238  8e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  52 
 
 		 254 aa  237  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  47.2 
 
 		 253 aa  229  5e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  50.4 
 
 		 251 aa  217  1e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  44.05 
 
 		 251 aa  198  7e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  44.64 
 
 		 261 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  47.62 
 
 		 252 aa  194  9e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  42.86 
 
 		 251 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  41.39 
 
 		 261 aa  190  1e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  44.63 
 
 		 251 aa  190  2e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  43.25 
 
 		 248 aa  190  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 254 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  44 
 
 		 250 aa  181  1e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  38 
 
 		 270 aa  179  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  38.4 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 249 aa  175  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  41.06 
 
 		 259 aa  174  9.999999999999999e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  36.8 
 
 		 248 aa  171  7.999999999999999e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  38.19 
 
 		 248 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  38.36 
 
 		 249 aa  169  4e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  36.4 
 
 		 248 aa  167  1e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 265 aa  167  1e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 		 261 aa  167  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 259 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  35.34 
 
 		 248 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  38.1 
 
 		 253 aa  161  7e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  36.21 
 
 		 249 aa  160  1e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  38.98 
 
 		 247 aa  160  2e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  38.02 
 
 		 257 aa  152  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  34.94 
 
 		 249 aa  150  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 253 aa  149  3e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.18 
 
 		 247 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 315 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  37.65 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  38.37 
 
 		 253 aa  145  8.000000000000001e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  38.06 
 
 		 376 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 253 aa  145  9e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 286 aa  144  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  35.85 
 
 		 263 aa  144  2e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  32.53 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  32.53 
 
 		 258 aa  142  5e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 274 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  36.08 
 
 		 258 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  37.94 
 
 		 248 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  38.19 
 
 		 266 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 260 aa  138  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  38.49 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 257 aa  136  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  33.74 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  33.74 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 		 260 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  33.33 
 
 		 252 aa  135  6.0000000000000005e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  36.74 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  32.77 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  39.08 
 
 		 257 aa  133  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 264 aa  132  5e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 		 252 aa  132  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 288 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 260 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.89 
 
 		 254 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.68 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  36.61 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.41 
 
 		 269 aa  129  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  31.02 
 
 		 258 aa  129  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>