144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1895 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013526  Tter_1895  CRISPR-associated helicase Cas3  100 
 
 		 944 aa  1894    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000246489  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4095  CRISPR-associated helicase Cas3  39.33 
 
 		 887 aa  566  1e-160  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2438  CRISPR-associated helicase Cas3  33.16 
 
 		 908 aa  466  9.999999999999999e-131  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2343  CRISPR-associated helicase Cas3  36.86 
 
 		 879 aa  450  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3020  CRISPR-associated helicase Cas3  37.95 
 
 		 899 aa  451  1e-125  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00270264  normal  0.0711602 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  38.36 
 
 		 905 aa  442  9.999999999999999e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000382234  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2824  CRISPR-associated helicase Cas3  34.69 
 
 		 854 aa  410  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0759  CRISPR-associated helicase Cas3  30.97 
 
 		 948 aa  404  1e-111  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0254151 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3763  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.37 
 
 		 885 aa  399  1e-109  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0421659 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0989  CRISPR-associated helicase Cas3  35.75 
 
 		 922 aa  385  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2679  CRISPR-associated helicase Cas3  37.15 
 
 		 965 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000878559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1593  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  37.15 
 
 		 944 aa  377  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0156673  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2629  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.13 
 
 		 971 aa  371  1e-101  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.174712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3909  CRISPR-associated protein, Cse1 family  36.84 
 
 		 1540 aa  367  1e-100  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0587749  normal  0.0865606 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17170  CRISPR-associated helicase Cas3, core  35.27 
 
 		 901 aa  362  2e-98  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.908442  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1536  CRISPR-associated helicase Cas3  36.03 
 
 		 968 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1601  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  35.12 
 
 		 970 aa  354  4e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0436721  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1971  CRISPR-associated helicase Cas3  34.67 
 
 		 929 aa  353  7e-96  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.685894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0651  CRISPR-associated helicase Cas3  34.16 
 
 		 927 aa  344  5e-93  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.522649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0017  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  32.09 
 
 		 962 aa  343  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17130  CRISPR-associated helicase Cas3  36.9 
 
 		 919 aa  341  2.9999999999999998e-92  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.390014 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17360  CRISPR-associated helicase Cas3  33.58 
 
 		 943 aa  322  1.9999999999999998e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2572  CRISPR-associated helicase Cas3  32.86 
 
 		 986 aa  310  5.9999999999999995e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00323142 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0941  CRISPR-associated helicase Cas3  35.04 
 
 		 933 aa  306  9.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.156849  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13860  CRISPR-associated helicase Cas3  32.21 
 
 		 832 aa  296  9e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.234704  normal  0.222328 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0175  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.46 
 
 		 920 aa  296  1e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3055  CRISPR-associated helicase Cas3  34.65 
 
 		 918 aa  295  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.107976  hitchhiker  0.000610459 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0826  CRISPR-associated helicase Cas3  33.84 
 
 		 854 aa  288  2.9999999999999996e-76  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2889  CRISPR-associated helicase Cas3  32.22 
 
 		 899 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0793506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3063  CRISPR-associated helicase Cas3  32.18 
 
 		 885 aa  286  9e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.949207  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0865  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  33.21 
 
 		 892 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4014  CRISPR-associated helicase Cas3  31.85 
 
 		 899 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.317175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0922  CRISPR-associated helicase Cas3  29.91 
 
 		 860 aa  284  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.226971  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2983  CRISPR-associated helicase Cas3  32.32 
 
 		 899 aa  280  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0397  CRISPR-associated helicase Cas3  31.77 
 
 		 907 aa  274  5.000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0215688  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1608  CRISPR-associated helicase Cas3  32.48 
 
 		 912 aa  274  5.000000000000001e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.152444  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2480  CRISPR-associated helicase Cas3  32.4 
 
 		 906 aa  272  2e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0593  CRISPR-associated helicase Cas3  30.93 
 
 		 921 aa  271  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.834864  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0956  putative helicase  33.76 
 
 		 904 aa  271  5.9999999999999995e-71  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.38721  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3072  crispr-associated helicase Cas3  30.75 
 
 		 887 aa  269  2e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1419  CRISPR-associated helicase Cas3  32.71 
 
 		 860 aa  268  2.9999999999999995e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.144597 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3591  CRISPR-associated helicase Cas3  31.64 
 
 		 912 aa  268  4e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.355005  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3138  crispr-associated helicase Cas3  29.94 
 
 		 887 aa  268  4e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0912  CRISPR-associated helicase Cas3  32.61 
 
 		 871 aa  261  6e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0224  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  31.87 
 
 		 897 aa  259  2e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.249114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0927  CRISPR-associated helicase Cas3  29.35 
 
 		 888 aa  254  7e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.732097  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3314  CRISPR-associated helicase Cas3  32.75 
 
 		 892 aa  254  8.000000000000001e-66  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.036255  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2901  hypothetical protein  29.95 
 
 		 888 aa  253  1e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1384  hypothetical protein  33.8 
 
 		 883 aa  251  4e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5415  CRISPR-associated helicase Cas3  36.89 
 
 		 897 aa  251  4e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0951  hypothetical protein  29.35 
 
 		 888 aa  251  6e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.324 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2670  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  31.59 
 
 		 837 aa  250  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0428  CRISPR-associated helicase Cas3  32.64 
 
 		 897 aa  249  2e-64  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00752021  normal  0.154756 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00865  CRISPR-associated helicase Cas3  30.13 
 
 		 915 aa  245  3e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.798987  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1586  hypothetical protein  28.17 
 
 		 823 aa  244  6e-63  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.271584  normal  0.677902 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1814  CRISPR-associated helicase Cas3  35.06 
 
 		 701 aa  241  5.999999999999999e-62  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2158  CRISPR-associated helicase Cas3  36.42 
 
 		 594 aa  223  1.9999999999999999e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3548  CRISPR-associated helicase Cas3  28.07 
 
 		 908 aa  211  7e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.18776 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2228  CRISPR-associated helicase Cas3  28.95 
 
 		 876 aa  194  5e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.229037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0480  CRISPR-associated helicase Cas3  29 
 
 		 868 aa  186  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227979  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0955  CRISPR-associated helicase Cas3  28.8 
 
 		 871 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0936  CRISPR-associated helicase Cas3  29.49 
 
 		 881 aa  181  4.999999999999999e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0340  CRISPR-associated helicase Cas3 family protein protein  29.96 
 
 		 885 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3214  cas3: CRISPR-associated helicase Cas3  29.14 
 
 		 857 aa  174  9e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  29.92 
 
 		 887 aa  164  9e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0778  CRISPR-associated helicase Cas3  30.23 
 
 		 888 aa  157  1e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0261363  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0604  hypothetical protein  34.25 
 
 		 456 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0901  CRISPR-associated helicase Cas3  23.45 
 
 		 737 aa  128  7e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.656814  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1813  metal dependent phosphohydrolase  27.98 
 
 		 729 aa  126  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.496732  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0309  hypothetical protein  25.16 
 
 		 741 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0192284  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1228  CRISPR-associated helicase Cas3  22.39 
 
 		 764 aa  107  8e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1290  CRISPR-associated helicase Cas3  29.5 
 
 		 795 aa  107  1e-21  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2005  CRISPR-associated helicase Cas3  24.07 
 
 		 726 aa  106  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3301  CRISPR-associated helicase Cas3  27.23 
 
 		 779 aa  105  4e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.733843 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0444  CRISPR-associated helicase Cas3  25.05 
 
 		 750 aa  105  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5079  CRISPR-associated helicase Cas3  25.66 
 
 		 804 aa  102  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2299  CRISPR-associated helicase Cas3  27.22 
 
 		 750 aa  101  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2024  CRISPR-associated helicase Cas3  23.39 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0917  CRISPR-associated helicase Cas3  22.4 
 
 		 744 aa  99.8  2e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000123408 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0569  metal dependent phosphohydrolase  26.51 
 
 		 781 aa  99.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.495857 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1868  CRISPR-associated helicase Cas3  25.98 
 
 		 783 aa  99.4  3e-19  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0922  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  20.95 
 
 		 736 aa  98.2  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2016  CRISPR-associated helicase Cas3  27.97 
 
 		 778 aa  97.1  2e-18  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.580429 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1084  CRISPR-associated helicase Cas3  24.68 
 
 		 763 aa  93.2  2e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1729  CRISPR-associated helicase Cas3  26.74 
 
 		 917 aa  92.4  3e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0125  CRISPR-associated helicase Cas3  25.33 
 
 		 775 aa  89.4  3e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0671  CRISPR-associated helicase Cas3  22.35 
 
 		 729 aa  88.2  6e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5524  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 		 827 aa  86.3  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.262681 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6018  CRISPR-associated helicase Cas3  23.43 
 
 		 762 aa  82.8  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0478884  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2649  CRISPR-associated helicase Cas3  35.03 
 
 		 873 aa  79.7  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00423349  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1001  CRISPR-associated helicase Cas3  26.75 
 
 		 801 aa  79.3  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1639  CRISPR-associated helicase Cas3  29.24 
 
 		 791 aa  71.6  0.00000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1354  CRISPR-associated helicase Cas3  32.22 
 
 		 566 aa  70.1  0.0000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.245938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3123  hypothetical protein  32.56 
 
 		 843 aa  67.4  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.44073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1422  CRISPR-associated helicase Cas3 domain-containing protein  20.78 
 
 		 733 aa  66.2  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0408027  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1390  CRISPR-associated helicase Cas3  25.89 
 
 		 811 aa  66.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0935  metal dependent phosphohydrolase  39.02 
 
 		 1027 aa  65.5  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2661  CRISPR-associated helicase Cas3  22.9 
 
 		 807 aa  64.7  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0351  CRISPR-associated helicase Cas3  20.35 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0262148  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1622  CRISPR-associated helicase Cas3  31.75 
 
 		 780 aa  62.8  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>