More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1856 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1856  nitroreductase  100 
 
 
350 aa  717    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0973  nitroreductase  53.54 
 
 
348 aa  342  4e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3978  nitroreductase  56.1 
 
 
209 aa  233  4.0000000000000004e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0811138 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1137  nitroreductase  54.41 
 
 
209 aa  224  1e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.038928 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0363  nitroreductase  54.55 
 
 
200 aa  206  5e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0929502 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2956  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  43.7 
 
 
138 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3303  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  37.77 
 
 
458 aa  114  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.76615  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13291  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.22 
 
 
448 aa  109  9.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2518  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.9 
 
 
423 aa  108  2e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0675541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4073  F420-dependent oxidoreductase  37.57 
 
 
431 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.578682  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4731  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.97 
 
 
446 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.227563  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1379  coenzyme F420-0 gamma-glutamyl ligase  32.12 
 
 
439 aa  100  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.539165  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6334  F420-0--gamma-glutamyl ligase  38.46 
 
 
461 aa  100  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0741  F420-0--gamma-glutamyl ligase  40 
 
 
442 aa  96.7  5e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.918099 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2325  nitroreductase  33.33 
 
 
170 aa  95.5  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000978378  hitchhiker  0.00152148 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1182  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  33.53 
 
 
450 aa  95.5  1e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1732  F420-0--gamma-glutamyl ligase  33.68 
 
 
446 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.897259 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5438  putative F420-dependent enzyme  40.54 
 
 
150 aa  94.7  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1962  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.79 
 
 
430 aa  92.8  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.679609  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2174  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  40.48 
 
 
155 aa  92.8  8e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.794209 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3768  F420 biosynthesis protein FbiB, C-terminal domain protein  32.12 
 
 
431 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1359  F420-0--gamma-glutamyl ligase  35.52 
 
 
471 aa  89  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.576813  normal  0.392124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5869  F420-0--gamma-glutamyl ligase  37.28 
 
 
526 aa  88.6  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0435784  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1323  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.97 
 
 
455 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1340  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.97 
 
 
455 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.887486  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0748  F420-dependent oxidoreductase  32.95 
 
 
427 aa  87.4  4e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0318949  normal  0.411209 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1448  nitroreductase  31.79 
 
 
170 aa  85.9  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1045  nitroreductase  31.79 
 
 
174 aa  85.9  9e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.644951  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1079  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  38.4 
 
 
142 aa  85.5  0.000000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.17105  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0019  nitroreductase  30.37 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4176  F420-0--gamma-glutamyl ligase  30.42 
 
 
463 aa  84.3  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.1007  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1834  nitroreductase  31.82 
 
 
190 aa  84  0.000000000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000154259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8501  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  83.6  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19860  Pyridoxamine 5'-phosphate oxidase  38.13 
 
 
152 aa  82.8  0.000000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00417181  hitchhiker  0.000280532 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5743  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.89 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06230  F420-0--gamma-glutamyl ligase  34.39 
 
 
448 aa  82.4  0.00000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.574814  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2533  PPOX class putative F420-dependent enzyme  34 
 
 
147 aa  81.3  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1074  nitroreductase  32.14 
 
 
167 aa  81.3  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00616634 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1291  nitroreductase  32.34 
 
 
191 aa  80.9  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0153  nitroreductase  29.8 
 
 
174 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.027489  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1464  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  36.64 
 
 
200 aa  80.5  0.00000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1167  nitroreductase  33.15 
 
 
174 aa  79.7  0.00000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2525  nitroreductase family protein  32.99 
 
 
167 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.208181  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0372  nitroreductase  29.23 
 
 
178 aa  77.4  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2164  nitroreductase  29.26 
 
 
190 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2126  nitroreductase  28.72 
 
 
176 aa  74.3  0.000000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0664  nitroreductase  33.13 
 
 
180 aa  73.9  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.237638  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5509  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.34 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5129  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding protein  35.34 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.583553  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5218  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  35.34 
 
 
135 aa  73.6  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3401  PPOX class putative F420-dependent enzyme  30.06 
 
 
168 aa  73.6  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0599  nitroreductase  29.67 
 
 
166 aa  73.2  0.000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2428  nitroreductase  33.17 
 
 
200 aa  73.2  0.000000000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0315  PPOX class putative F420-dependent enzyme  32.03 
 
 
137 aa  72  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2170  nitroreductase  34.16 
 
 
204 aa  72  0.00000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0545  nitroreductase  34.46 
 
 
172 aa  72  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.361368  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1628  nitroreductase  33.89 
 
 
207 aa  72  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.627423 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0221  nitroreductase  28.42 
 
 
180 aa  71.2  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.602782  normal  0.0189765 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0897  nitroreductase  30 
 
 
192 aa  71.6  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.304401  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10122  hypothetical protein  33.56 
 
 
144 aa  71.2  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0196572  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3085  nitroreductase family protein  27.14 
 
 
215 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000000156331 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3073  nitroreductase  32.78 
 
 
201 aa  70.9  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.000978726  normal  0.396217 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3382  nitroreductase  26.84 
 
 
234 aa  70.9  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.385821 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2671  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related, FMN-binding  34.81 
 
 
170 aa  71.2  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0139978  normal  0.4191 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2367  nitroreductase family protein  27.1 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.130661  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2239  nitroreductase family protein  27.1 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.153685  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2080  nitroreductase  27.57 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.123305  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1065  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.1 
 
 
214 aa  70.1  0.00000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.167871  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1974  nitroreductase  27.32 
 
 
183 aa  70.1  0.00000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000485253  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2187  nitroreductase  34.81 
 
 
173 aa  70.1  0.00000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.530109 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2286  nitroreductase family protein  27.57 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.153669  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3917  nitroreductase  30.69 
 
 
221 aa  69.3  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0265412  normal  0.0438071 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0548  nitroreductase  28.49 
 
 
166 aa  68.9  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0921  nitroreductase  25.56 
 
 
204 aa  68.9  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000239248  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1141  nitroreductase family protein  30.53 
 
 
222 aa  68.9  0.0000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.492433  normal  0.120129 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1200  nitroreductase  27.27 
 
 
188 aa  68.9  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1474  nitroreductase  28.05 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1376  nitroreductase  24.88 
 
 
194 aa  68.2  0.0000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.10349 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2038  nitroreductase family protein  26.17 
 
 
215 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0707  nitroreductase  26.84 
 
 
177 aa  68.2  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0082  nitroreductase  28.22 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0116  nitroreductase  29.48 
 
 
252 aa  67  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1459  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  34.29 
 
 
240 aa  67  0.0000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0721  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.33 
 
 
249 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0629951  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2837  nitroreductase  24.88 
 
 
194 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000111277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2101  nitroreductase family protein  26.17 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.320716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2040  nitroreductase family protein  26.17 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0134367  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2257  nitroreductase family protein  26.17 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.328438  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2282  nitroreductase family protein  26.17 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.1661e-35 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2810  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  30.29 
 
 
226 aa  66.2  0.0000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.407169 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2528  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.72 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3177  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  29.65 
 
 
253 aa  65.5  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0534  nitroreductase  27.96 
 
 
166 aa  65.9  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11180  nitroreductase  25 
 
 
176 aa  65.9  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2559  cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  32.76 
 
 
275 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0540417  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3115  nitroreductase  27.62 
 
 
239 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.029346  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2018  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN- binding  34.62 
 
 
149 aa  64.7  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000328973  normal  0.0172812 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4125  nitroreductase  27.23 
 
 
186 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0079  nitroreductase  26.6 
 
 
175 aa  65.1  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.423186  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0115  Cob(II)yrinic acid a,c-diamide reductase  33.72 
 
 
218 aa  65.1  0.000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>