More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1839 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1839  integrase family protein  100 
 
 
310 aa  642    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0047  integrase family protein  45.69 
 
 
314 aa  282  5.000000000000001e-75  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.456307  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0863  phage integrase family protein  48.62 
 
 
313 aa  280  3e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1450  integrase family protein  49.15 
 
 
299 aa  278  7e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00858396  normal  0.734684 
 
 
-
 
NC_002936  DET1215  tyrosine recombinase XerD  48.6 
 
 
302 aa  265  5e-70  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.157843  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_998  integrase/recombinase  48.95 
 
 
302 aa  265  5e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4696  integrase family protein  47.87 
 
 
306 aa  263  2e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1025  tyrosine recombinase XerD subunit  48.25 
 
 
302 aa  263  4e-69  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2257  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 
299 aa  260  2e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.977256  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1751  tyrosine recombinase XerD  46.48 
 
 
294 aa  256  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1668  tyrosine recombinase XerD subunit  45.55 
 
 
295 aa  253  2.0000000000000002e-66  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.179488  normal  0.0195248 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2052  tyrosine recombinase XerD  44.56 
 
 
296 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0676  tyrosine recombinase XerD subunit  44.76 
 
 
296 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0367  site-specific tyrosine recombinase XerD  46.1 
 
 
298 aa  252  7e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1282  tyrosine recombinase XerD  48.41 
 
 
295 aa  250  2e-65  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.63418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1501  tyrosine recombinase XerD subunit  47.5 
 
 
295 aa  249  4e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1099  tyrosine recombinase XerD  46.62 
 
 
296 aa  247  2e-64  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0607  recombinase  44.09 
 
 
296 aa  244  1.9999999999999999e-63  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1038  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.16 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00331502  normal  0.0102802 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4199  site-specific tyrosine recombinase XerD  43.16 
 
 
296 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00345142  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2788  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.14 
 
 
296 aa  235  6e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000777667  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4158  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.44443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3920  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.5 
 
 
296 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000317777  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4222  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 
296 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00160259  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3846  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.81 
 
 
296 aa  233  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0256715  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3999  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.46 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.189801  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3830  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.46 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4113  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.46 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00015e-24 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4311  site-specific tyrosine recombinase XerD  42.46 
 
 
296 aa  233  4.0000000000000004e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.789664  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1750  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 
294 aa  230  2e-59  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19920  tyrosine recombinase XerD  41.36 
 
 
317 aa  225  6e-58  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.210765  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1320  tyrosine recombinase XerD  43.16 
 
 
302 aa  223  4e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0574  integrase family protein  41.72 
 
 
304 aa  221  9e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000663621  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1786  tyrosine recombinase XerD  41.13 
 
 
291 aa  219  3.9999999999999997e-56  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0596225  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4429  tyrosine recombinase XerD  41.02 
 
 
301 aa  218  7e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0676058  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3500  site-specific tyrosine recombinase XerD  38.41 
 
 
314 aa  218  1e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385537  normal  0.347515 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1427  tyrosine recombinase XerD subunit  40.79 
 
 
295 aa  217  2e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2992  tyrosine recombinase XerD  41.64 
 
 
308 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0678  tyrosine recombinase XerD  41.16 
 
 
294 aa  217  2e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0265142 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1201  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.66 
 
 
321 aa  216  5.9999999999999996e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.731595  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3090  tyrosine recombinase XerD  39.09 
 
 
320 aa  215  7e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2957  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 
318 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.271721  normal  0.636956 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2942  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 
318 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2986  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.34 
 
 
318 aa  215  9e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0431132 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  42.66 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1687  tyrosine recombinase XerD subunit  41.44 
 
 
314 aa  214  9.999999999999999e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2821  tyrosine recombinase XerD  41.3 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.346068  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2378  tyrosine recombinase XerD  41.46 
 
 
296 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.336575 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0748  tyrosine recombinase XerD  40.93 
 
 
303 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.50433  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2452  tyrosine recombinase XerD  40.4 
 
 
306 aa  212  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0952029  normal  0.728507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2375  tyrosine recombinase XerD  38.24 
 
 
324 aa  212  5.999999999999999e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.973456  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1521  tyrosine recombinase XerD  40.88 
 
 
346 aa  212  5.999999999999999e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.531713  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1932  tyrosine recombinase XerD  39.2 
 
 
310 aa  211  9e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1473  tyrosine recombinase XerD  40.21 
 
 
296 aa  211  1e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.202075  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1241  tyrosine recombinase XerD  40.27 
 
 
311 aa  211  1e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.657845  normal  0.578091 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1819  integrase/recombinase XerD  40 
 
 
295 aa  210  2e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.530175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2169  tyrosine recombinase XerD  40.75 
 
 
298 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0884  integrase  39.51 
 
 
302 aa  210  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.161871  hitchhiker  0.000000000000894527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1300  tyrosine recombinase XerD subunit  37.72 
 
 
297 aa  210  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2175  tyrosine recombinase XerD  38.43 
 
 
299 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0235  Integrase  39.13 
 
 
308 aa  208  1e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.386202  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1520  tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
362 aa  208  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000383292 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2383  tyrosine recombinase XerD  41.52 
 
 
295 aa  207  1e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2436  tyrosine recombinase XerD  39.22 
 
 
305 aa  208  1e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.578966 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2489  tyrosine recombinase XerD  40.13 
 
 
318 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.189208  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1060  tyrosine recombinase XerD  38.95 
 
 
295 aa  206  4e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.17947  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0396  tyrosine recombinase XerD  39.22 
 
 
309 aa  206  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3281  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.76 
 
 
317 aa  206  5e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1982  tyrosine recombinase XerC  39.1 
 
 
298 aa  206  6e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026523  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0861  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.93 
 
 
299 aa  205  6e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1560  tyrosine recombinase XerD  37.05 
 
 
331 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.736869  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1674  tyrosine recombinase XerD  39.64 
 
 
297 aa  204  1e-51  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0517708  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3396  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.64 
 
 
298 aa  204  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5643  tyrosine recombinase XerD  41.07 
 
 
299 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.776137 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2702  site-specific recombinase  38.72 
 
 
299 aa  203  3e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1827  tyrosine recombinase XerD  38.73 
 
 
306 aa  202  4e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25380  tyrosine recombinase XerD subunit  39.14 
 
 
311 aa  202  5e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.732719 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004441  site-specific recombinase XerD  38.46 
 
 
305 aa  202  5e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39510  site-specific tyrosine recombinase XerD  40.36 
 
 
298 aa  202  6e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1239  hypothetical protein  35.35 
 
 
299 aa  202  7e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.968724 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2994  tyrosine recombinase XerD  38.28 
 
 
315 aa  202  8e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1995  site-specific tyrosine recombinase XerD  37.1 
 
 
302 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0645  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.58 
 
 
299 aa  202  8e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.241995  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2117  tyrosine recombinase XerD  40.75 
 
 
298 aa  201  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.815623  normal  0.0464222 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1513  site-specific recombinase  41.16 
 
 
295 aa  201  9.999999999999999e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.110584  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1659  tyrosine recombinase XerD  46.29 
 
 
254 aa  201  9.999999999999999e-51  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0476  tyrosine recombinase XerD  41.37 
 
 
302 aa  201  9.999999999999999e-51  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1622  tyrosine recombinase XerD  36.93 
 
 
310 aa  200  3e-50  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2834  integrase family protein  39.64 
 
 
314 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.061361  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3426  tyrosine recombinase XerD  39.08 
 
 
299 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0602  phage integrase family protein  38.59 
 
 
317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00243284  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4151  site-specific tyrosine recombinase XerD  40 
 
 
298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.596099 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0478  tyrosine recombinase XerD  37.41 
 
 
319 aa  199  5e-50  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3304  tyrosine recombinase XerD  37.02 
 
 
298 aa  199  5e-50  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0133185  normal  0.394454 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3275  site-specific tyrosine recombinase XerD  39.18 
 
 
298 aa  199  6e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1185  tyrosine recombinase XerD  39.22 
 
 
315 aa  199  6e-50  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0531401  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0716  tyrosine recombinase XerC  37.28 
 
 
307 aa  199  7e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.841608  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1524  integrase family protein  36.88 
 
 
300 aa  198  7.999999999999999e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.681425  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0651  tyrosine recombinase XerC subunit  37.28 
 
 
307 aa  198  9e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0562  site-specific tyrosine recombinase XerD  36.21 
 
 
300 aa  198  9e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>