More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1696 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1696  cysteine desulfurase, SufS subfamily  100 
 
 
417 aa  865    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0306  SufS subfamily cysteine desulfurase  59.16 
 
 
414 aa  492  9.999999999999999e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0801844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  56.02 
 
 
412 aa  489  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0710  SufS subfamily cysteine desulfurase  57.67 
 
 
414 aa  486  1e-136  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.548374  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.14 
 
 
406 aa  475  1e-133  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0497  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.55 
 
 
414 aa  476  1e-133  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0958  cysteine desulfurase, SufS subfamily  58.66 
 
 
412 aa  474  1e-133  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2267  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.9 
 
 
418 aa  477  1e-133  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.53875 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0166  cysteine desulfurase  55.94 
 
 
408 aa  472  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  54.11 
 
 
406 aa  463  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5397  cysteine desulfurase, SufS subfamily  56.68 
 
 
414 aa  464  1e-129  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0498  cysteine desulfurase SufS  53.94 
 
 
413 aa  459  9.999999999999999e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.39 
 
 
406 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  54.14 
 
 
406 aa  455  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  54.14 
 
 
406 aa  455  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  54.14 
 
 
406 aa  456  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  54.14 
 
 
406 aa  455  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  54.14 
 
 
406 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  55.53 
 
 
420 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  53.75 
 
 
405 aa  455  1e-127  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  54.14 
 
 
406 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  54.14 
 
 
406 aa  457  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  54.14 
 
 
406 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  53.62 
 
 
408 aa  458  1e-127  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.14 
 
 
406 aa  456  1e-127  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  54.14 
 
 
406 aa  457  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0861  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.83 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.762782  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.22 
 
 
404 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0845  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.83 
 
 
413 aa  453  1.0000000000000001e-126  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  53.75 
 
 
405 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  53 
 
 
412 aa  452  1.0000000000000001e-126  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.59 
 
 
429 aa  450  1e-125  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.39 
 
 
451 aa  450  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2329  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.96 
 
 
409 aa  448  1e-125  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1138  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.55 
 
 
411 aa  450  1e-125  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.730169  normal  0.0524008 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  54.34 
 
 
414 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.62 
 
 
425 aa  447  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.6 
 
 
429 aa  445  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0427  cysteine desulphurases, SufS  50.86 
 
 
420 aa  444  1e-123  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.21345  normal  0.0671623 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.35 
 
 
429 aa  442  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  51.23 
 
 
419 aa  444  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2314  cysteine desulfurase SufS subfamily  52.85 
 
 
414 aa  443  1e-123  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.828049 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3037  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.55 
 
 
404 aa  443  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0138624 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.85 
 
 
415 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
412 aa  439  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2089  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.9 
 
 
441 aa  441  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.819759 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.16 
 
 
418 aa  437  1e-121  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2959  cysteine desulfurase, SufS subfamily  52.74 
 
 
433 aa  437  1e-121  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4732  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.86 
 
 
420 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  53.51 
 
 
421 aa  437  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000771215  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2554  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.92 
 
 
428 aa  435  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0289  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.49 
 
 
415 aa  435  1e-121  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0988  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.62 
 
 
410 aa  432  1e-120  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.699231  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1664  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.9 
 
 
442 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.4 
 
 
408 aa  434  1e-120  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3442  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.63 
 
 
420 aa  429  1e-119  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000291669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0799  cysteine desulfurase  49.16 
 
 
423 aa  429  1e-119  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.635677  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1738  cysteine desulfurase  50 
 
 
419 aa  429  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.948748 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0699  SufS subfamily cysteine desulfurase  53.83 
 
 
419 aa  431  1e-119  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2570  cysteine desulfurase  51.07 
 
 
422 aa  430  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0220  aminotransferase (class V), putative  51.36 
 
 
410 aa  428  1e-119  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.98 
 
 
404 aa  430  1e-119  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1242  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.27 
 
 
414 aa  429  1e-119  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.473312  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1983  cysteine desulfurase  50.71 
 
 
424 aa  426  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2446  cysteine desulfurase SufS subfamily  50.36 
 
 
429 aa  426  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.929195  normal  0.0353595 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3306  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.52 
 
 
434 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000348872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4358  cysteine desulfurase  50.12 
 
 
420 aa  427  1e-118  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.124519  normal  0.628114 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3079  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.28 
 
 
434 aa  424  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0582401  normal  0.245455 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.14 
 
 
414 aa  423  1e-117  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1968  cysteine desulfurase  51.07 
 
 
421 aa  422  1e-117  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.187156 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5928  cysteine desulfurase  50.25 
 
 
413 aa  424  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1228  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.67 
 
 
415 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  51.89 
 
 
417 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  48.52 
 
 
425 aa  424  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5983  SufS subfamily cysteine desulfurase  52.06 
 
 
419 aa  421  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.593517  normal  0.0658023 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  47.8 
 
 
412 aa  419  1e-116  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1863  SufS subfamily cysteine desulfurase  54.85 
 
 
416 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1838  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.75 
 
 
406 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0112034  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2068  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.12 
 
 
443 aa  419  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.512945  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.09 
 
 
416 aa  419  1e-116  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1840  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.79 
 
 
414 aa  415  9.999999999999999e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00877809  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2103  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.37 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.105912 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1764  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.63 
 
 
406 aa  415  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000868369  hitchhiker  0.0000289207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.12 
 
 
413 aa  417  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2745  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.95 
 
 
415 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  49.88 
 
 
413 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  49.38 
 
 
404 aa  412  1e-114  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  48.4 
 
 
410 aa  413  1e-114  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2279  cysteine desulfurase, SufS subfamily  50.72 
 
 
435 aa  414  1e-114  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000248982  normal  0.0516835 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.27 
 
 
419 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2325  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.63 
 
 
414 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.553712  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.03 
 
 
414 aa  412  1e-114  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16160  cysteine desulfurase  49.41 
 
 
429 aa  415  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1972  hypothetical protein  52.48 
 
 
405 aa  414  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.128198  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.27 
 
 
419 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  48.29 
 
 
414 aa  412  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.88 
 
 
414 aa  414  1e-114  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2394  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  50.62 
 
 
406 aa  408  1e-113  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0201879  hitchhiker  0.000057861 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2837  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.64 
 
 
415 aa  410  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00234776  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2459  SufS subfamily cysteine desulfurase  48.89 
 
 
415 aa  411  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.117109  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>