More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1695 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1695  SUF system FeS assembly protein, NifU family  100 
 
 
128 aa  261  3e-69  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0307  NifU family SUF system FeS assembly protein  58.14 
 
 
132 aa  162  1e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0630803 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0711  NifU family SUF system FeS assembly protein  57.36 
 
 
132 aa  161  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.397203  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0957  SUF system FeS assembly protein, NifU family  57.69 
 
 
130 aa  161  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0408  NifU family SUF system FeS assembly protein  53.54 
 
 
131 aa  147  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0219  SUF system FeS assembly protein, NifU family  53.04 
 
 
139 aa  137  6e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5396  nitrogen-fixing NifU domain protein  50.37 
 
 
137 aa  136  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1833  SUF system FeS assembly protein, NifU family  51.28 
 
 
143 aa  135  3e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1226  SUF system FeS assembly protein, NifU family  52.17 
 
 
163 aa  132  2e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1321  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.83 
 
 
142 aa  127  4e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.927715  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1252  SUF system FeS assembly protein, NifU family  50 
 
 
143 aa  126  1e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0498  NifU family SUF system FeS assembly protein  56.78 
 
 
147 aa  122  2e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2247  SUF system FeS assembly protein, NifU family  46.09 
 
 
140 aa  120  5e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0918709 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0862  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.18 
 
 
154 aa  117  5e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.16993  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0846  NifU family SUF system FeS assembly protein  41.18 
 
 
154 aa  117  5e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.539052  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0989  SUF system FeS assembly protein, NifU family  41.73 
 
 
151 aa  112  2e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.784389  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0165  SUF system FeS assembly protein  40.77 
 
 
140 aa  107  7e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0568  SUF system FeS assembly protein, NifU family  40.43 
 
 
153 aa  105  2e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.654939  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2126  NifU domain-containing protein  40.98 
 
 
144 aa  102  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0499  NifU domain-containing protein  41.18 
 
 
154 aa  100  5e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1895  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.14 
 
 
154 aa  100  6e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2486  SUF system FeS assembly protein  36.3 
 
 
150 aa  100  8e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1864  SUF system FeS assembly protein  41.3 
 
 
162 aa  100  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.861958  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0720  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.66 
 
 
207 aa  100  9e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.985893  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0640  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  99.4  1e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0603  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.31 
 
 
151 aa  99.8  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.281207  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1636  SUF system FeS assembly protein, NifU family  39.42 
 
 
139 aa  99  2e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0656  hypothetical protein  34.07 
 
 
149 aa  98.6  2e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4273  SUF system FeS assembly protein  37.68 
 
 
149 aa  98.2  3e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1665  SUF system FeS assembly protein  36.5 
 
 
172 aa  98.2  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.754519  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0288  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.79 
 
 
211 aa  97.4  6e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26820  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.78 
 
 
145 aa  97.4  6e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2214  nitrogen-fixing NifU-like  39.13 
 
 
143 aa  97.1  7e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.728312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2090  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.77 
 
 
151 aa  97.1  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0741  NifU domain-containing protein  39.47 
 
 
129 aa  96.7  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2850  NifU family SUF system FeS assembly protein  32.33 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0206  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  41.23 
 
 
150 aa  95.9  2e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00147996  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08890  nitrogen-fixing NifU domain protein  39.13 
 
 
138 aa  95.1  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  4.53527e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2339  SUF system FeS assembly protein, NifU family  32.33 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.000980785  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5149  SUF system FeS assembly protein, NifU family  37.96 
 
 
147 aa  95.1  3e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.726273  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1651  nitrogen-fixing NifU-like  39.13 
 
 
125 aa  94.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.86354  normal  0.0135811 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1673  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  37.7 
 
 
131 aa  95.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.439756  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0847  SUF system FeS assembly protein  38.41 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0700  SUF system FeS assembly protein  36.11 
 
 
160 aa  94.4  5e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0893  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.41 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0897  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.41 
 
 
149 aa  94.4  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.341493  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2531  NifU family SUF system FeS assembly protein  36.84 
 
 
148 aa  94  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.855927  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1511  NifU family SUF system FeS assembly protein  34.31 
 
 
148 aa  93.6  8e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0265  hypothetical protein  37.39 
 
 
143 aa  93.6  9e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.164856 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1444  IscU  34.31 
 
 
158 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1754  nifU protein  39.13 
 
 
144 aa  92.8  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00241183  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0765  NifU domain-containing protein  37.39 
 
 
123 aa  93.2  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00307292  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1836  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.26 
 
 
145 aa  93.2  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0842476 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2038  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  39.13 
 
 
142 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16170  SUF system FeS assembly protein, NifU family  38.13 
 
 
150 aa  93.2  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0907  NifU family SUF system FeS assembly protein  35.71 
 
 
149 aa  92  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0314  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.64 
 
 
134 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.764118  normal  0.0431709 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1713  FeS cluster assembly scaffold protein NifU  38.26 
 
 
127 aa  92  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  1.27457e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1970  NifU-like protein for Fe-S cluster formation  36.3 
 
 
152 aa  92  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0831  FeS cluster assembly scaffold IscU  39.83 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.728943  normal  0.471167 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2425  NifU protein  38.6 
 
 
129 aa  92  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.191396 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0719  NifU domain-containing protein  37.84 
 
 
129 aa  92.4  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0403016  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1777  scaffold protein  40.68 
 
 
127 aa  91.7  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  3.3e-05 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3026  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  91.7  3e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.050274  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2313  SUF system FeS assembly protein  32.84 
 
 
147 aa  92  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.960672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1133  scaffold protein  38.98 
 
 
127 aa  91.3  4e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0755  NifU domain-containing protein  40.87 
 
 
173 aa  91.3  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  8.03052e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2697  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0698092  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0174  NifU domain-containing protein  38.46 
 
 
125 aa  90.9  5e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2741  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.484705  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3071  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35 
 
 
149 aa  91.3  5e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2804  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2146  NifU domain-containing protein  35.09 
 
 
129 aa  90.9  5e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.480493  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2916  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.592762  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2782  scaffold protein  36.44 
 
 
128 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.427031  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0894  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.31 
 
 
153 aa  90.5  7e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0702679  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3280  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.23 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.182981  normal  0.0362221 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2229  SUF system FeS assembly protein, NifU family  34.75 
 
 
151 aa  90.1  9e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  7.71916e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0721  nitrogen-fixing NifU-like protein  38.26 
 
 
149 aa  90.1  9e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0316213  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2682  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.490649  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02421  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2328  NifU family SUF system FeS assembly protein  37.4 
 
 
137 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1139  FeS cluster assembly scaffold IscU  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1148  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0205414  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0889  scaffold protein  36.97 
 
 
127 aa  89.7  1e-17  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.112954  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1362  SUF system FeS assembly protein, NifU family  36.36 
 
 
155 aa  89.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.576777  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3761  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000663009  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2814  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0170927  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2680  scaffold protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.955816  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1736  NifU protein  33.62 
 
 
211 aa  89.7  1e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.495331  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02385  hypothetical protein  35.59 
 
 
128 aa  89.7  1e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0047  NifU family SUF system FeS assembly protein  39.37 
 
 
135 aa  89.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2316  scaffold protein  38.14 
 
 
127 aa  89.4  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.624311  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2870  scaffold protein  38.14 
 
 
127 aa  89  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.836462  hitchhiker  1.93406e-08 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1294  scaffold protein  37.4 
 
 
127 aa  89  2e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.691863  normal  0.0125117 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1859  NifU-like protein  34.43 
 
 
122 aa  89  2e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.19001e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2447  SUF system FeS assembly protein, NifU family  35.77 
 
 
156 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0284902 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1793  NifU-like domain-containing protein  32.58 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.310093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5214  NifU domain-containing protein  37.12 
 
 
143 aa  89.4  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2268  SUF system FeS assembly protein, NifU family  31.91 
 
 
163 aa  89  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>