More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1630 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1630  DNA repair protein RadC  100 
 
 		 234 aa  475  1e-133  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1307  DNA repair protein RadC  56.44 
 
 		 231 aa  261  6e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00169173  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0777  DNA repair protein RadC  55.95 
 
 		 229 aa  254  7e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0037  DNA repair protein RadC  54.71 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0767  DNA repair protein RadC  53.81 
 
 		 233 aa  223  2e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.488652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4352  DNA repair protein RadC  52.97 
 
 		 227 aa  213  1.9999999999999998e-54  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000113857  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1642  DNA repair protein RadC  47.19 
 
 		 235 aa  209  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000389911  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2135  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 236 aa  206  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000438114  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0536  DNA repair protein RadC  52.86 
 
 		 229 aa  206  2e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.604905 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1541  DNA repair protein RadC  53.15 
 
 		 232 aa  205  5e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.00000897994  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0899  DNA repair protein RadC  44.59 
 
 		 226 aa  205  6e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2550  DNA repair protein RadC  45.5 
 
 		 226 aa  204  6e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.727412  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1467  DNA repair protein RadC  47.03 
 
 		 230 aa  204  8e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2399  DNA repair protein RadC  44.14 
 
 		 227 aa  199  3e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2111  DNA repair protein RadC  44.2 
 
 		 227 aa  198  5e-50  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3340  DNA repair protein RadC  45.81 
 
 		 233 aa  198  6e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000661948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0662  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.92951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2549  DNA repair protein RadC  46.64 
 
 		 227 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4545  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4351  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.579867  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4187  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4685  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.92537  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4587  DNA repair protein RadC  45.21 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.46911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4572  DNA repair protein RadC  44.75 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0345161  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4198  DNA repair protein RadC  44.75 
 
 		 225 aa  194  7e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000602972  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4299  DNA repair protein RadC  44.29 
 
 		 225 aa  193  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2303  DNA repair protein RadC  44.24 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.432419  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0382  DNA repair protein RadC  43.78 
 
 		 229 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14250  DNA repair protein RadC  43.5 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000326992  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2564  DNA repair protein RadC  40.89 
 
 		 229 aa  185  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_511  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000324187  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0514  DNA repair protein RadC  42.15 
 
 		 241 aa  182  3e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.120777  hitchhiker  0.000000000242554 
 
 
-
 
NC_002936  DET0572  RadC family DNA repair protein  40.72 
 
 		 222 aa  181  7e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.611512  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1530  DNA repair protein RadC  44.75 
 
 		 227 aa  181  1e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0606843  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0546  DNA repair protein RadC  40.99 
 
 		 228 aa  180  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0523  DNA repair protein RadC  44.55 
 
 		 230 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1825  DNA repair protein RadC  43.33 
 
 		 233 aa  176  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2138  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 224 aa  177  2e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.574311  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0598  DNA repair protein RadC  43.78 
 
 		 223 aa  175  5e-43  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1465  DNA repair protein RadC  39.71 
 
 		 222 aa  175  5e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0881  DNA repair protein RadC  41.89 
 
 		 228 aa  175  5e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.701712  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1319  DNA repair protein RadC  40.45 
 
 		 228 aa  175  6e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000567698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2972  DNA repair protein RadC  43.18 
 
 		 224 aa  174  8e-43  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0458817  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2712  DNA repair protein RadC  43.54 
 
 		 224 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2479  DNA repair protein RadC  41.78 
 
 		 245 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4138  DNA repair protein RadC  43.58 
 
 		 228 aa  173  1.9999999999999998e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.592557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3582  DNA repair protein RadC  41.44 
 
 		 229 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0315  DNA repair protein RadC  40.54 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.220116  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2322  DNA repair protein RadC  42.58 
 
 		 224 aa  171  7.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0102136 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0086  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  171  1e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0159  DNA repair protein RadC  40.95 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.130887  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0386  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 229 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1789  DNA repair protein  38.71 
 
 		 224 aa  170  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.582251  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0222  DNA repair protein RadC  39.91 
 
 		 224 aa  169  3e-41  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1818  DNA repair protein RadC  45.62 
 
 		 222 aa  169  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.852458  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3678  DEAD/DEAH box helicase-like  40.18 
 
 		 224 aa  169  5e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00158019  normal  0.0453807 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2262  DNA repair proteins  43.84 
 
 		 206 aa  169  5e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.195306  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2444  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 224 aa  168  6e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.418589  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1761  DNA repair protein RadC  42.92 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3868  DNA repair protein RadC  42.79 
 
 		 231 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.956659 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1412  DNA repair protein RadC  40 
 
 		 227 aa  168  8e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0061  DNA repair protein RadC  42.73 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70230  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 224 aa  167  1e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3142  DNA repair protein RadC  45.58 
 
 		 226 aa  166  2e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00442306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1254  DNA repair protein RadC  41.9 
 
 		 225 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6095  DNA repair protein RadC  40.48 
 
 		 224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.872274  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0100  DNA repair protein RadC  40.72 
 
 		 223 aa  165  4e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.234069  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1917  DNA repair protein RadC  39.15 
 
 		 237 aa  166  4e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5539  DNA repair protein RadC  38.99 
 
 		 224 aa  164  6.9999999999999995e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.856956  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0192  DNA repair protein RadC  40.91 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000306509  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3784  DNA repair protein RadC  42.34 
 
 		 231 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1231  DNA repair protein RadC  42.13 
 
 		 246 aa  164  2.0000000000000002e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.375575 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0056  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 225 aa  162  3e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.183755  normal  0.0623388 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4376  DNA repair protein RadC  39.45 
 
 		 224 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0839768 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2732  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 228 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2155  DNA repair protein RadC  40.55 
 
 		 223 aa  162  6e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.365065  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0831  DNA repair protein RadC  41.12 
 
 		 223 aa  161  6e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.950681  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0735  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 223 aa  161  9e-39  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0413  DNA repair protein RadC  37.27 
 
 		 229 aa  160  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.319313  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1220  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0917  DNA repair protein RadC  38.36 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.372898  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0065  DNA repair protein RadC  38.29 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1235  DNA repair protein RadC  42.11 
 
 		 222 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05605  putative DNA repair protein  40.18 
 
 		 231 aa  159  3e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.762004  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0236  DNA repair protein RadC  39.64 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0935  DNA repair protein RadC  42.86 
 
 		 222 aa  159  4e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.266168  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02940  DNA repair protein RadC  40.28 
 
 		 224 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2376  DNA repair protein RadC  37.5 
 
 		 232 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000665213  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0624  DNA repair protein RadC  37.84 
 
 		 224 aa  157  1e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000507049 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1513  DNA repair protein RadC  39.37 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0820  DNA repair protein RadC  40.09 
 
 		 232 aa  157  2e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1101  DNA repair protein RadC  38.46 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2301  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3960  DNA repair protein RadC  39.05 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0193359  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0046  DNA repair protein RadC  38.01 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.178856  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0101  DNA repair protein RadC  38.74 
 
 		 243 aa  155  7e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2664  DNA repair protein RadC  39.19 
 
 		 224 aa  154  9e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  hitchhiker  0.0000127675 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3564  DNA repair protein RadC  38.71 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.469153  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2291  DNA repair protein RadC  36.44 
 
 		 242 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0121519 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2588  DNA repair protein RadC  38.53 
 
 		 224 aa  153  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.16454 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>