More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1621 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010002  Daci_3755  carboxyl transferase  60.89 
 
 
510 aa  638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0296123  normal  0.253409 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  62.6 
 
 
527 aa  651    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  66.67 
 
 
529 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0271  carboxyl transferase  64.78 
 
 
520 aa  651    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.435103  normal  0.1429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1316  carboxyl transferase  62.06 
 
 
514 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  62.02 
 
 
530 aa  635    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  63.95 
 
 
534 aa  641    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0271  Propionyl-CoA carboxylase  66.6 
 
 
519 aa  669    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.846145  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  62.98 
 
 
520 aa  645    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  61.37 
 
 
513 aa  636    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1521  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  63.95 
 
 
513 aa  637    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  66.86 
 
 
516 aa  699    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  60.51 
 
 
517 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0250  carboxyl transferase  67 
 
 
519 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.135558  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  61.93 
 
 
508 aa  641    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1621  Propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
513 aa  1056    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  64.06 
 
 
531 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1632  carboxyl transferase  62.86 
 
 
522 aa  641    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.605341 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3092  carboxyl transferase  64.17 
 
 
516 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.391297  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  61.67 
 
 
510 aa  636    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1851  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  639    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  66.6 
 
 
518 aa  677    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4697  carboxyl transferase  60.65 
 
 
528 aa  644    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.584075 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  60.78 
 
 
531 aa  656    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  61.63 
 
 
516 aa  666    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  61.05 
 
 
516 aa  650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  64.09 
 
 
516 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  61.06 
 
 
518 aa  657    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  66.21 
 
 
550 aa  706    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  62.57 
 
 
524 aa  646    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05890  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  65.15 
 
 
546 aa  635    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.35884 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  62.79 
 
 
531 aa  679    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  70.88 
 
 
516 aa  700    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0386  propionyl-CoA carboxylase  60.78 
 
 
514 aa  643    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  70.67 
 
 
516 aa  717    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  66.6 
 
 
519 aa  671    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5528  carboxyl transferase  65.63 
 
 
522 aa  698    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  58.56 
 
 
514 aa  637    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  63.25 
 
 
551 aa  653    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  61.28 
 
 
510 aa  644    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  61.09 
 
 
510 aa  639    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  59.69 
 
 
516 aa  637    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  65.75 
 
 
530 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  58.91 
 
 
516 aa  634    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  62.33 
 
 
527 aa  647    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  62.67 
 
 
537 aa  646    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  60.08 
 
 
517 aa  634  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  60.69 
 
 
515 aa  632  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4004  carboxyl transferase  60.58 
 
 
511 aa  634  1e-180  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.680854 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  60.69 
 
 
515 aa  633  1e-180  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11343  propionlyl-CoA carboxylase  59.88 
 
 
513 aa  634  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  60.04 
 
 
540 aa  631  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2130  carboxyl transferase  61.63 
 
 
514 aa  633  1e-180  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.955323  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0053  carboxyl transferase  61.72 
 
 
510 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2803  propionyl-CoA carboxylase  60.51 
 
 
510 aa  630  1e-179  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.342128  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2164  carboxyl transferase  60.51 
 
 
510 aa  629  1e-179  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.158421  normal  0.436276 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2381  carboxyl transferase  60.12 
 
 
510 aa  630  1e-179  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0889  carboxyl transferase  59.34 
 
 
564 aa  627  1e-178  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  60.12 
 
 
519 aa  627  1e-178  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3401  carboxyl transferase  60.7 
 
 
510 aa  625  1e-178  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0447  acyl CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.98 
 
 
516 aa  621  1e-177  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  60.97 
 
 
536 aa  621  1e-177  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1877  propionyl-CoA carboxylase  59.73 
 
 
510 aa  623  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2974  carboxyl transferase  60.61 
 
 
519 aa  623  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1016  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  60.7 
 
 
510 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0424  carboxyl transferase  56.01 
 
 
516 aa  618  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_389  acyl-CoA biotin-dependant carboxyltransferase  56.78 
 
 
516 aa  620  1e-176  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.839187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  60.04 
 
 
536 aa  619  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0930  carboxyl transferase  57.8 
 
 
518 aa  615  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  61.3 
 
 
513 aa  616  1e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1840  carboxyl transferase  59.85 
 
 
542 aa  614  1e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.132711  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0639  carboxyl transferase  58.96 
 
 
513 aa  615  1e-175  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.629685 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2694  carboxyl transferase  59.14 
 
 
510 aa  617  1e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.219092 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  61.35 
 
 
541 aa  616  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45886  predicted protein  62.7 
 
 
581 aa  617  1e-175  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  58.56 
 
 
510 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  61.74 
 
 
510 aa  617  1e-175  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  57.73 
 
 
517 aa  614  9.999999999999999e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  59.3 
 
 
522 aa  613  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6390  carboxyl transferase  59.51 
 
 
543 aa  610  1e-173  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0531526  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  59.22 
 
 
510 aa  610  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2348  carboxyl transferase  60.4 
 
 
512 aa  609  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.964644 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  56.95 
 
 
517 aa  608  1e-173  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1152  carboxyl transferase  62.25 
 
 
529 aa  609  1e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.579492  normal  0.513821 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  61.04 
 
 
529 aa  610  1e-173  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1705  carboxyl transferase  61.34 
 
 
510 aa  610  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514847  normal  0.247972 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0585  carboxyl transferase  57.42 
 
 
512 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  57.78 
 
 
512 aa  605  9.999999999999999e-173  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1375  propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit alpha / propionyl-CoA carboxylase carboxyltransferase subunit beta  55.92 
 
 
524 aa  605  9.999999999999999e-173  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0140013 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2189  propionyl-CoA carboxylase beta chain  58.79 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.124404  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5510  carboxyl transferase  58.75 
 
 
510 aa  604  9.999999999999999e-173  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  59.02 
 
 
510 aa  606  9.999999999999999e-173  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2305  propionyl-CoA carboxylase  58.79 
 
 
510 aa  608  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1754  carboxyl transferase  58.75 
 
 
510 aa  607  9.999999999999999e-173  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.218371  normal  0.119502 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3688  carboxyl transferase  57.98 
 
 
510 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.618461  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5680  propionyl-CoA carboxylase  60 
 
 
510 aa  606  9.999999999999999e-173  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0861  carboxyl transferase  58.79 
 
 
510 aa  605  9.999999999999999e-173  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.833574  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  56.31 
 
 
523 aa  601  1.0000000000000001e-171  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  59.65 
 
 
526 aa  602  1.0000000000000001e-171  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3811  carboxyl transferase  58.45 
 
 
510 aa  602  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>