132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1566 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0925  ATP-dependent serine protease-like protein  68.82 
 
 		 696 aa  864    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1566  ATP-dependent serine protease-like protein  100 
 
 		 684 aa  1384    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1760  zinc finger CHC2-family protein  32.98 
 
 		 654 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0060  hypothetical protein  33.33 
 
 		 895 aa  90.9  7e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130043  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0924  hypothetical protein  91.43 
 
 		 100 aa  73.9  0.000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1259  virulence-associated protein E  51.67 
 
 		 296 aa  69.3  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03470  hypothetical protein  26.79 
 
 		 815 aa  64.7  0.000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  28.44 
 
 		 466 aa  60.1  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06880  DNA repair protein RadA  28 
 
 		 473 aa  59.3  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0498  DNA repair protein RadA  32.09 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.572608  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1978  hypothetical protein  29.52 
 
 		 718 aa  58.2  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.440247  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0493  DNA repair protein RadA  29.73 
 
 		 453 aa  57  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.119863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1314  DNA repair protein RadA  31.55 
 
 		 446 aa  57  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.080824  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0489  DNA repair protein RadA  29.24 
 
 		 457 aa  55.8  0.000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.665667  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1806  DNA repair protein RadA  29.38 
 
 		 453 aa  55.5  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.75981  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1339  DNA repair protein RadA  28.1 
 
 		 446 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.826628  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1220  DNA repair protein RadA  28.1 
 
 		 446 aa  55.1  0.000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0566  DNA repair protein RadA  29.14 
 
 		 473 aa  54.7  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00646319 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  26.6 
 
 		 457 aa  54.7  0.000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1044  DNA repair protein RadA  29.38 
 
 		 466 aa  54.3  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1189  DNA repair protein RadA  29.38 
 
 		 466 aa  53.9  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.380692  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  27.98 
 
 		 462 aa  53.9  0.000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0136  DNA repair protein RadA  30.22 
 
 		 456 aa  53.9  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000364921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  28.28 
 
 		 462 aa  52.8  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0695  DNA repair protein RadA  30.86 
 
 		 450 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1183  DNA repair protein RadA  28.65 
 
 		 447 aa  53.1  0.00002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0398  DNA repair protein RadA  27.5 
 
 		 454 aa  52.8  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0090486 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1479  DNA repair protein RadA  26.54 
 
 		 457 aa  52.8  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0327327  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 		 451 aa  53.1  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0887  DNA repair protein RadA  26.67 
 
 		 450 aa  52.4  0.00003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  27.75 
 
 		 464 aa  52  0.00003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  28.57 
 
 		 467 aa  52  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0525  DNA repair protein RadA  27.62 
 
 		 446 aa  52  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2209  genomic island protein  57.14 
 
 		 312 aa  51.2  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  30.86 
 
 		 451 aa  51.2  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1210  DNA repair protein RadA  27.81 
 
 		 446 aa  51.2  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.651562  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  28.44 
 
 		 453 aa  50.8  0.00008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0403  DNA repair protein RadA  32.43 
 
 		 466 aa  50.8  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0449  DNA repair protein RadA  27.5 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.165637  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4163  hypothetical protein  26.05 
 
 		 278 aa  50.4  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.151048  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1917  hypothetical protein  43.02 
 
 		 759 aa  50.4  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  28.57 
 
 		 453 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0455  DNA repair protein RadA  27.5 
 
 		 467 aa  50.1  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0562  DNA repair protein RadA  27.07 
 
 		 464 aa  50.1  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.814745  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3370  DNA repair protein RadA  23.77 
 
 		 457 aa  50.1  0.0001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1401  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 455 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.227517  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0200  DNA repair protein RadA  29.71 
 
 		 457 aa  49.3  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  27.27 
 
 		 472 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5342  DNA repair protein RadA  28.98 
 
 		 462 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  27.42 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  27.42 
 
 		 454 aa  49.7  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1392  DNA repair protein RadA  26.97 
 
 		 446 aa  49.3  0.0002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0471  DNA repair protein RadA  31.21 
 
 		 492 aa  49.3  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0449312 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  28.38 
 
 		 446 aa  49.7  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2110  DNA repair protein RadA  28.32 
 
 		 452 aa  49.3  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.987747  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  27.96 
 
 		 462 aa  49.3  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0963  DNA repair protein RadA  26.5 
 
 		 446 aa  48.9  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000314277  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1432  DNA repair protein RadA  27.52 
 
 		 458 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.741894  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0360  DNA repair protein RadA  29.71 
 
 		 457 aa  48.9  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012036  Athe_2776  hypothetical protein  23.92 
 
 		 718 aa  48.5  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  27.36 
 
 		 455 aa  48.5  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  27.43 
 
 		 484 aa  48.5  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1854  DNA repair protein RadA  28.74 
 
 		 443 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4304  DNA repair protein RadA  26.64 
 
 		 476 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0337551 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0880  DNA repair protein RadA  27.78 
 
 		 450 aa  48.5  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.510643  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  31.64 
 
 		 443 aa  48.1  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0842  DNA repair protein RadA  24.88 
 
 		 448 aa  48.1  0.0005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0442  virulence-associated protein E  52.38 
 
 		 309 aa  48.1  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.331851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0968  DNA repair protein RadA  31.4 
 
 		 461 aa  48.5  0.0005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  decreased coverage  0.000135308  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1442  DNA repair protein RadA  28.98 
 
 		 467 aa  48.1  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.798431  normal  0.214735 
 
 
-
 
NC_009426  Saro_3920  TOPRIM domain-containing protein  47.83 
 
 		 280 aa  48.1  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2267  hypothetical protein  46.55 
 
 		 741 aa  47.8  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1010  DNA repair protein RadA  22.37 
 
 		 459 aa  47.8  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  29.38 
 
 		 453 aa  47.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0917  DNA repair protein RadA  27.64 
 
 		 456 aa  48.1  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0497  DNA repair protein RadA  27.72 
 
 		 422 aa  48.1  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  27.15 
 
 		 463 aa  47.8  0.0006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1784  DNA repair protein RadA  26.17 
 
 		 454 aa  47.8  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.199022 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0074  hypothetical protein  24.9 
 
 		 867 aa  47.8  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  26.42 
 
 		 458 aa  47.8  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  27.98 
 
 		 476 aa  47.4  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01590  DNA repair protein RadA  29.94 
 
 		 478 aa  47.4  0.0008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0251  DNA repair protein RadA  24.52 
 
 		 462 aa  47.4  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336717  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0957  DnaB-like helicase-like  23.08 
 
 		 469 aa  47.4  0.001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4298  DNA repair protein RadA  28.16 
 
 		 455 aa  47  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  24.53 
 
 		 457 aa  47  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  31.32 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4092  DNA repair protein RadA  26.86 
 
 		 455 aa  47  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  27.14 
 
 		 455 aa  47  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  25.27 
 
 		 457 aa  45.8  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  26.29 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1956  DNA repair protein RadA  27.84 
 
 		 455 aa  46.6  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  26.54 
 
 		 453 aa  46.2  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  26.29 
 
 		 452 aa  46.6  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1461  DNA repair protein RadA  26.9 
 
 		 454 aa  46.6  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.421655  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  26.7 
 
 		 452 aa  46.6  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3936  DNA repair protein RadA  26.2 
 
 		 476 aa  45.8  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.075328 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2504  DNA repair protein RadA  28 
 
 		 460 aa  46.6  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4409  DNA repair protein RadA  26.2 
 
 		 481 aa  46.6  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.589948 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  26.42 
 
 		 458 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>