More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1551 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1551  aminotransferase class V  100 
 
 		 383 aa  786    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4044  aminotransferase, class V  54.15 
 
 		 389 aa  405  1.0000000000000001e-112  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.159236 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0109  aminotransferase, class V  56.49 
 
 		 385 aa  404  1e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0484  aminotransferase, class V  51.05 
 
 		 417 aa  392  1e-108  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0750137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1063  aminotransferase class V  51.04 
 
 		 388 aa  390  1e-107  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1563  cysteine desulfurase IscS  50.13 
 
 		 403 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.353864 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1092  Cysteine desulfurase  50.52 
 
 		 388 aa  385  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.793736 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0437  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  51.3 
 
 		 388 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00696357  normal  0.223385 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0229  Cysteine desulfurase  50.78 
 
 		 405 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  50.26 
 
 		 392 aa  377  1e-103  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0356  aminotransferase, class V  53 
 
 		 390 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.230832 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2412  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3449  cysteine desulfurase  49.87 
 
 		 389 aa  375  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1058  cysteine desulfurase  48.94 
 
 		 405 aa  372  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0834623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3698  cysteine desulfurase IscS  49.21 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.789582  normal  0.356633 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3823  cysteine desulfurase IscS  49.21 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.474065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3416  aminotransferase class V  50.26 
 
 		 399 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.425221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4665  cysteine desulfurase IscS  49.21 
 
 		 436 aa  372  1e-102  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2317  cysteine desulfurase  48.3 
 
 		 404 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.459864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2004  aminotransferase, class V  51.19 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0411095  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6331  cysteine desulfurase IscS  49.08 
 
 		 405 aa  369  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.134755  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2368  aminotransferase, class V  51.19 
 
 		 399 aa  369  1e-101  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0313381  normal  0.503368 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3062  cysteine desulfurase IscS  47.77 
 
 		 403 aa  369  1e-101  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.635367  unclonable  0.000000859331 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1360  cysteine desulfurase IscS  49.74 
 
 		 408 aa  369  1e-101  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1104  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  368  1e-101  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.013649  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3031  cysteine desulfurase  49.21 
 
 		 404 aa  370  1e-101  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.563846  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1025  cysteine desulfurase  48.81 
 
 		 406 aa  368  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00998384  normal  0.30784 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1371  aminotransferase class V  53.57 
 
 		 387 aa  369  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00447816  normal  0.862029 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2751  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 404 aa  371  1e-101  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.173578  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02422  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.657115  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1138  cysteine desulfurase IscS  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2115  aminotransferase class V  50.93 
 
 		 399 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.903448  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3627  cysteine desulfurase  48.95 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0168495  normal  0.888851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2783  cysteine desulfurase  48.95 
 
 		 404 aa  366  1e-100  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0158517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2681  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174524  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2815  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00976282  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2683  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.980146  normal  0.976252 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1147  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0105086  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3762  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00149492  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02386  hypothetical protein  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.730969  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2905  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  365  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0404853  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1019  pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase (NIFS protein)  47.62 
 
 		 405 aa  364  1e-99  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.103423  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2742  cysteine desulfurase  48.69 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.46384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2917  cysteine desulfurase  48.69 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1244  cysteine desulfurase  48.69 
 
 		 404 aa  364  1e-99  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.560354  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2205  cysteine desulfurase IscS  48.57 
 
 		 403 aa  364  1e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00230458  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2698  cysteine desulfurase  48.69 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.016381  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2805  cysteine desulfurase  48.69 
 
 		 404 aa  365  1e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2190  Cysteine desulfurase  47.64 
 
 		 406 aa  363  2e-99  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.980213  normal  0.0116553 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0949  cysteine desulfurase IscS  47.35 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0399375 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0884  cysteine desulfurase IscS  47.35 
 
 		 405 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.293282  normal  0.187166 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0716  aminotransferase class V  50 
 
 		 387 aa  363  3e-99  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4336  cysteine desulfurase  48.83 
 
 		 404 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.180367  hitchhiker  0.00000000219205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0842  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0648359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 384 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0872  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 404 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.368262 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  50 
 
 		 382 aa  360  2e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3027  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 404 aa  360  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0576674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0885  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 404 aa  361  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.306655  hitchhiker  0.00050858 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2579  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.120053  hitchhiker  0.000683499 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0041  aminotransferase class V  51.17 
 
 		 389 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1488  cysteine desulfurase  48.56 
 
 		 404 aa  359  3e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.645778  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2871  cysteine desulfurase  48.04 
 
 		 404 aa  360  3e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000328828 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1144  cysteine desulfurase  48.03 
 
 		 407 aa  360  3e-98  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.282524  normal  0.237339 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1132  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 404 aa  358  7e-98  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  46.83 
 
 		 384 aa  358  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1351  aminotransferase class V  46.86 
 
 		 384 aa  358  8e-98  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000567164 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  48.81 
 
 		 394 aa  358  8e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5192  aminotransferase class V  51.34 
 
 		 392 aa  358  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.34588 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2143  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.950908 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1553  cysteine desulfurase  49.45 
 
 		 407 aa  358  9.999999999999999e-98  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0484493  normal  0.0430953 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2126  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5951  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.350283  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2243  aminotransferase class V  49.21 
 
 		 380 aa  358  9.999999999999999e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0997  cysteine desulfurase  47.38 
 
 		 415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1776  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.743071  hitchhiker  0.0000439392 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4612  cysteine desulfurase  46.86 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0217102  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004360  cysteine desulfurase  47.91 
 
 		 404 aa  357  1.9999999999999998e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.591204  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2036  cysteine desulfurase  49.45 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.639443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2163  cysteine desulfurase  49.45 
 
 		 407 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.675105  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1708  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1489  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.71249  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5432  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.116144  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0637  cysteine desulfurase  49.08 
 
 		 404 aa  357  2.9999999999999997e-97  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.273964 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2217  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3103  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  357  2.9999999999999997e-97  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.412431  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01055  cysteine desulfurase  48.43 
 
 		 404 aa  356  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1299  cysteine desulfurase  47.26 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0382772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14730  cysteine desulfurase  47 
 
 		 404 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.179473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2655  cysteine desulfurase  49.73 
 
 		 407 aa  355  5e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1950  cysteine desulfurase IscS  47.01 
 
 		 405 aa  355  8.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000000843977  normal  0.404205 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2733  cysteine desulfurase  49.45 
 
 		 407 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1423  cysteine desulfurase  47.38 
 
 		 404 aa  354  1e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2599  cysteine desulfurase  49.45 
 
 		 407 aa  354  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.129174  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05560  cysteine desulfhydrase, putative  46.09 
 
 		 502 aa  353  2e-96  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0277  cysteine desulfurase  48.17 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0284858  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3511  cysteine desulfurase  46.48 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1458  cysteine desulfurase  49.18 
 
 		 407 aa  353  2e-96  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40400  cysteine desulfurase  46.74 
 
 		 404 aa  354  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  48.15 
 
 		 402 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>