More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1541 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_1541  NADH dehydrogenase I, D subunit  100 
 
 		 400 aa  824    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4241  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.41 
 
 		 390 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0411944  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0341  NADH dehydrogenase I, D subunit  56.44 
 
 		 390 aa  463  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0211499  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3352  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.67 
 
 		 390 aa  461  1e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.131197  normal  0.0118999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3923  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.24 
 
 		 389 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.587069  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4007  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.73 
 
 		 389 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2044e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1313  NADH dehydrogenase I, D subunit  53 
 
 		 401 aa  450  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3135  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.36 
 
 		 390 aa  444  1e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0132145  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1046  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.98 
 
 		 411 aa  439  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3620  NADH dehydrogenase I, D subunit  52.81 
 
 		 404 aa  434  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.761398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3675  NADH dehydrogenase I, D subunit  54.71 
 
 		 417 aa  431  1e-119  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0132867 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1321  NADH dehydrogenase I, D subunit  55.36 
 
 		 417 aa  428  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.735553  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1442  NADH dehydrogenase subunit D  53.09 
 
 		 408 aa  427  1e-118  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.331272  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1662  NADH dehydrogenase I, D subunit  53.49 
 
 		 383 aa  424  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1289  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.66 
 
 		 381 aa  422  1e-117  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1145  NADH dehydrogenase subunit D  50.61 
 
 		 417 aa  419  1e-116  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5388  NADH dehydrogenase subunit D  49.1 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.9747399999999995e-20 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5422  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5147  NADH dehydrogenase subunit D  49.1 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5532  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00277354 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1031  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 417 aa  414  9.999999999999999e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0235722  normal  0.1717 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5574  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0121919  normal  0.276957 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2211  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.518232 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5539  NADH dehydrogenase subunit D  49.1 
 
 		 366 aa  415  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5418  NADH dehydrogenase subunit D  49.62 
 
 		 366 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1094  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.402289  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1064  NADH dehydrogenase subunit D  49.15 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.240648  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1208  NADH dehydrogenase subunit D  52.55 
 
 		 367 aa  418  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000066562  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5473  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 366 aa  416  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2058  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1504  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00434712 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1634  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.166476  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2284  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0248166  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2246  NADH dehydrogenase subunit D  49.88 
 
 		 417 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.105278  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3632  NADH dehydrogenase subunit D  50.78 
 
 		 397 aa  418  9.999999999999999e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.638594 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1888  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 417 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.187802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0734  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.301756  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4979  NADH dehydrogenase subunit D  49.1 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4997  NADH dehydrogenase subunit D  49.1 
 
 		 366 aa  413  1e-114  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1826  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5095  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 366 aa  412  1e-114  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1302  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2163  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.549103  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1346  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00313693  hitchhiker  0.00709586 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1438  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.09225  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1927  NADH dehydrogenase subunit D  50 
 
 		 408 aa  412  1e-114  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.371072  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0820  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.205502  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0980  NADH dehydrogenase subunit D  51.78 
 
 		 371 aa  411  1e-114  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1133  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.154075  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2006  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000196393  normal  0.17064 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2270  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0316798  normal  0.103385 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3253  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  412  1e-114  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.626895  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3211  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  414  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0416  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1293  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  413  1e-114  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3082  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.26 
 
 		 422 aa  412  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2059  NADH dehydrogenase subunit D  48.91 
 
 		 417 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102892  normal  0.0817308 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1747  NADH dehydrogenase subunit D  49.75 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1561  NADH dehydrogenase subunit D  49.75 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0422295  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1406  NADH dehydrogenase subunit D  47.45 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.564759  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1961  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.64 
 
 		 417 aa  409  1e-113  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00447389  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0141  NADH dehydrogenase I, D subunit  50.64 
 
 		 408 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.345176  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1427  NADH dehydrogenase subunit D  47.45 
 
 		 417 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.448612  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1745  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2043  NADH dehydrogenase subunit D  51.54 
 
 		 366 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.004112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0989  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.287966  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0366  NADH dehydrogenase I, D subunit  47.3 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3816  NADH dehydrogenase subunit D  47.06 
 
 		 366 aa  402  1e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0964  NADH dehydrogenase subunit D  48.42 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.389115  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1280  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.14 
 
 		 414 aa  403  1e-111  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.658271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2254  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154911 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1496  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.709173  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1614  NADH dehydrogenase I, D subunit  51.03 
 
 		 414 aa  404  1e-111  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0548  NADH dehydrogenase subunit D  49.64 
 
 		 424 aa  402  1e-111  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.899987  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1762  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1967  NADH dehydrogenase subunit D  47.93 
 
 		 417 aa  402  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0788296 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2155  NADH dehydrogenase I, D subunit  49.49 
 
 		 441 aa  404  1e-111  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2627  NADH dehydrogenase subunit D  48.66 
 
 		 417 aa  404  1e-111  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02414  hypothetical protein similar to NADH-ubiquinone oxidoreductase 49 kDa subunit, mitochondrial precursor (Eurofung)  49.74 
 
 		 475 aa  398  9.999999999999999e-111  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.151267 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0882  NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 49kDa  48.6 
 
 		 580 aa  400  9.999999999999999e-111  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000293416  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0875  NADH dehydrogenase subunit D  46.96 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.334972  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2562  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3507  NADH dehydrogenase subunit D  47.45 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0960  NADH dehydrogenase subunit D  46.96 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000966275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0333  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.23 
 
 		 793 aa  400  9.999999999999999e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0711  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.91 
 
 		 417 aa  398  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.577358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0930  NADH dehydrogenase subunit D  47.2 
 
 		 417 aa  399  9.999999999999999e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156514  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1615  NADH dehydrogenase subunit D  49.39 
 
 		 417 aa  400  9.999999999999999e-111  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0833647  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3410  NADH dehydrogenase subunit D  49.87 
 
 		 367 aa  398  9.999999999999999e-111  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0184  NADH dehydrogenase subunit D  51.03 
 
 		 408 aa  400  9.999999999999999e-111  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0952  NADH dehydrogenase subunit D  49.15 
 
 		 417 aa  396  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.597503 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1266  NADH dehydrogenase subunit D  45.74 
 
 		 417 aa  395  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26222 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1048  NADH dehydrogenase subunit D  47.2 
 
 		 417 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3444  trifunctional NADH dehydrogenase I subunit B/C/D  49.49 
 
 		 792 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2833  NADH dehydrogenase subunit D  48.42 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2702  NADH dehydrogenase subunit D  48.18 
 
 		 417 aa  394  1e-108  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1526  NADH dehydrogenase subunit D  49.36 
 
 		 409 aa  394  1e-108  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.013165  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0483  NADH dehydrogenase I, D subunit  48.6 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0824  NADH dehydrogenase subunit D  46.04 
 
 		 417 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3298  NADH dehydrogenase subunit D  48.08 
 
 		 366 aa  388  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>