More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1403 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1403  radical SAM enzyme, Cfr family  100 
 
 
371 aa  771  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0286  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  49.3 
 
 
361 aa  337  3e-91  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4305  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.81 
 
 
363 aa  326  5e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09940  radical SAM enzyme, Cfr family  47.95 
 
 
349 aa  317  1e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1376  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.13 
 
 
399 aa  318  1e-85  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.503977 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3583  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.99 
 
 
399 aa  317  1e-85  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1955  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.38 
 
 
365 aa  308  1e-82  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1065  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.82 
 
 
364 aa  306  5e-82  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2516  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.54 
 
 
362 aa  304  2e-81  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00628508  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1751  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  46.04 
 
 
342 aa  303  4e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.493385  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1436  radical SAM enzyme, Cfr family  44.67 
 
 
348 aa  299  5e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3605  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  5e-80  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3623  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4002  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3715  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3906  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3912  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00181542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3878  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.84 
 
 
362 aa  299  6e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.42646e-19 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1711  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.57 
 
 
347 aa  299  7e-80  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.294696  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1993  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.57 
 
 
347 aa  298  1e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3963  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.95 
 
 
362 aa  297  2e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0906  hypothetical protein  47.09 
 
 
354 aa  294  1e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  8.83258e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3687  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
362 aa  294  2e-78  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1313  radical SAM enzyme, Cfr family  47.08 
 
 
360 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1280  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
362 aa  293  3e-78  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0793601 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0572  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.81 
 
 
349 aa  292  7e-78  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00705994  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0784  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.89 
 
 
364 aa  290  2e-77  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1590  radical SAM protein  47.59 
 
 
318 aa  289  6e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1043  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.2 
 
 
341 aa  286  4e-76  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2783  radical SAM enzyme, Cfr family  44.57 
 
 
408 aa  286  4e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1277  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.48 
 
 
364 aa  285  6e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1302  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.48 
 
 
364 aa  285  6e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.902149  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2012  radical SAM enzyme, Cfr family  42.34 
 
 
357 aa  286  6e-76  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1385  radical SAM protein  42.94 
 
 
351 aa  285  7e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1708  radical SAM protein  46.06 
 
 
350 aa  284  2e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1323  radical SAM enzyme, Cfr family  42.86 
 
 
348 aa  283  4e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5902  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.98 
 
 
368 aa  281  2e-74  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.185229  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1678  radical SAM enzyme, Cfr family  40.97 
 
 
371 aa  280  3e-74  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.3 
 
 
395 aa  280  4e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0799869 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3404  radical SAM enzyme, Cfr family  44.89 
 
 
388 aa  279  5e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00306025  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3577  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.58 
 
 
421 aa  278  1e-73  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2203  radical SAM enzyme, Cfr family  45.8 
 
 
388 aa  278  2e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00426672  normal  0.359249 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0596  radical SAM enzyme, Cfr family  41.59 
 
 
353 aa  276  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2178  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.82 
 
 
372 aa  276  3e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0846545  hitchhiker  0.000495188 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1000  radical SAM enzyme, Cfr family  44.69 
 
 
388 aa  276  6e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.189733  normal  0.570497 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09960  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.3 
 
 
370 aa  275  8e-73  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.434962  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1536  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.12 
 
 
430 aa  275  1e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.571829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1869  radical SAM protein  43.47 
 
 
374 aa  274  2e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.340482 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1533  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.72 
 
 
349 aa  274  2e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0021  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.54 
 
 
356 aa  273  4e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0665  radical SAM enzyme, Cfr family  40.47 
 
 
341 aa  272  8e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1743  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.87 
 
 
358 aa  271  1e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.499617  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1816  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.74 
 
 
354 aa  271  2e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3980  radical SAM enzyme, Cfr family  45.58 
 
 
395 aa  271  2e-71  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2093  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  40 
 
 
356 aa  271  2e-71  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1882  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44 
 
 
356 aa  270  3e-71  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.461219  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2087  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44 
 
 
356 aa  270  3e-71  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.122222  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4057  radical SAM domain-containing protein  44.54 
 
 
342 aa  270  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.291969  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1327  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.09 
 
 
353 aa  269  6e-71  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2006  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
374 aa  268  9e-71  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.578114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2052  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
374 aa  268  9e-71  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1987  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
374 aa  268  9e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0876088  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1699  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.15 
 
 
348 aa  268  1e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0732  radical SAM enzyme, Cfr family  44.06 
 
 
377 aa  268  1e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2310  radical SAM enzyme, Cfr family  40.06 
 
 
349 aa  267  2e-70  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0772545  hitchhiker  0.000694436 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0007  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.43 
 
 
356 aa  268  2e-70  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0937459  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3850  radical SAM enzyme, Cfr family  42.57 
 
 
357 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0683  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.54 
 
 
365 aa  266  5e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.882739  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2051  radical SAM protein  43.75 
 
 
376 aa  266  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0429585  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1011  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.23 
 
 
343 aa  266  6e-70  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2502  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  44.04 
 
 
383 aa  264  1e-69  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.293735  normal  0.506779 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0458  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.76 
 
 
368 aa  265  1e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0059  radical SAM enzyme, Cfr family  39.84 
 
 
358 aa  265  1e-69  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.955574  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2223  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  45.12 
 
 
365 aa  264  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.522742  normal  0.264818 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2114  radical SAM enzyme, Cfr family  41.74 
 
 
368 aa  264  2e-69  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1420  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.82 
 
 
391 aa  263  3e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0340942  normal  0.291727 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2988  hypothetical protein  42.82 
 
 
364 aa  263  3e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.45923  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2488  radical SAM protein  39 
 
 
356 aa  263  4e-69  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00360289  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1235  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.87 
 
 
380 aa  263  4e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.478405  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3237  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.66 
 
 
376 aa  263  4e-69  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1905  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.69 
 
 
347 aa  263  4e-69  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0212666  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1489  radical SAM enzyme, Cfr family  42.54 
 
 
375 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0834  radical SAM protein  41.08 
 
 
428 aa  263  4e-69  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0281827 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1660  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42 
 
 
389 aa  262  5e-69  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2022  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.73 
 
 
371 aa  262  7e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23560  radical SAM enzyme, Cfr family  43.8 
 
 
364 aa  261  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0928  radical SAM enzyme, Cfr family  43.79 
 
 
364 aa  261  2e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.947592  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1338  radical SAM enzyme, Cfr family  42 
 
 
351 aa  260  2e-68  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0802459  normal  0.737261 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1227  hypothetical protein  40.62 
 
 
357 aa  261  2e-68  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.75541  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0445  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.74 
 
 
386 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21300  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.94 
 
 
465 aa  259  4e-68  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.830404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.6 
 
 
371 aa  259  6e-68  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1421  radical SAM protein  42.53 
 
 
373 aa  259  6e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.196113  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1119  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  41.06 
 
 
343 aa  259  6e-68  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3677  radical SAM enzyme, Cfr family  43.21 
 
 
365 aa  259  8e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1503  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.98 
 
 
340 aa  258  8e-68  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.578618  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12894  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  43.1 
 
 
364 aa  258  9e-68  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.942196  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0591  hypothetical protein  43.82 
 
 
372 aa  258  9e-68  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.196855  normal  0.247417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4121  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.36 
 
 
365 aa  258  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3089  ribosomal RNA large subunit methyltransferase N  42.32 
 
 
360 aa  257  2e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.929572  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>