More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1381 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1381  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 
862 aa  1771    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0767  DNA mismatch repair protein MutS  42.51 
 
 
863 aa  691    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0525  DNA mismatch repair protein MutS  41.07 
 
 
881 aa  652    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.751671  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1219  DNA mismatch repair protein MutS  47.93 
 
 
858 aa  806    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.34292  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  46.49 
 
 
871 aa  717    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1077  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 
853 aa  716    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0095  DNA mismatch repair protein MutS  40.99 
 
 
891 aa  649    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0480084 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  44.65 
 
 
872 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3815  DNA mismatch repair protein MutS  43.42 
 
 
907 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.548974 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  43.19 
 
 
854 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1033  DNA mismatch repair protein MutS  42.94 
 
 
872 aa  652    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.256802  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002517  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
853 aa  650    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.919799  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2957  DNA mismatch repair protein MutS  42.12 
 
 
854 aa  637    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4137  DNA mismatch repair protein MutS  40.96 
 
 
872 aa  636    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.757749  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0063  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
862 aa  645    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  47.88 
 
 
870 aa  787    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3768  DNA mismatch repair protein MutS  43.25 
 
 
968 aa  713    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  45.02 
 
 
869 aa  706    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1500  DNA mismatch repair protein MutS  46.08 
 
 
863 aa  744    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  47.15 
 
 
873 aa  768    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3368  DNA mismatch repair protein MutS  44.26 
 
 
888 aa  668    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.583963  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1202  DNA mismatch repair protein MutS  42.78 
 
 
860 aa  677    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000170445  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1709  DNA mismatch repair protein MutS  43.21 
 
 
871 aa  659    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0842  DNA mismatch repair protein MutS  43.04 
 
 
860 aa  667    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.899937  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  40.86 
 
 
855 aa  643    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1883  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 
858 aa  671    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.245146  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0553  DNA mismatch repair protein MutS  47.54 
 
 
882 aa  719    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2125  DNA mismatch repair protein MutS  45.36 
 
 
897 aa  719    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0565829  normal  0.043993 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1495  DNA mismatch repair protein MutS  44.1 
 
 
900 aa  719    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1216  DNA mismatch repair protein MutS  45.68 
 
 
903 aa  682    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0405457 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
871 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3186  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 
854 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0251089 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  48.39 
 
 
932 aa  756    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  42.99 
 
 
863 aa  649    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1246  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
856 aa  638    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000000830859 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05155  putative DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
869 aa  669    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  45.35 
 
 
870 aa  722    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1029  DNA mismatch repair protein MutS  47.53 
 
 
858 aa  790    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0324603  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 
873 aa  658    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  45.94 
 
 
872 aa  710    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0346  DNA mismatch repair protein MutS  46.38 
 
 
823 aa  667    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0580477  normal  0.279118 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  40.37 
 
 
871 aa  640    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1900  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
868 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.419193  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1611  DNA mismatch repair protein MutS  47.03 
 
 
867 aa  786    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.749504  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2247  DNA mismatch repair protein MutS  45.08 
 
 
882 aa  657    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0873729  normal  0.14084 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  42.79 
 
 
878 aa  650    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2983  DNA mismatch repair protein MutS  43.01 
 
 
864 aa  674    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.773158  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1113  DNA mismatch repair protein MutS  47.99 
 
 
863 aa  694    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000302948  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  43.66 
 
 
881 aa  660    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1925  DNA mismatch repair protein MutS  48.32 
 
 
865 aa  706    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4078  DNA mismatch repair protein MutS  47.36 
 
 
928 aa  829    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.980246  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  42.63 
 
 
861 aa  635    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3226  DNA mismatch repair protein MutS  43.81 
 
 
892 aa  676    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
856 aa  638    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1723  DNA mismatch repair protein MutS  42.33 
 
 
855 aa  666    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  42.07 
 
 
859 aa  652    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  42.49 
 
 
855 aa  637    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0516  DNA mismatch repair protein MutS  41.27 
 
 
886 aa  663    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.544146  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1950  DNA mismatch repair protein MutS  45.76 
 
 
872 aa  717    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.998424  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0935  DNA mismatch repair protein MutS  44.37 
 
 
874 aa  697    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2734  DNA mismatch repair protein MutS  44.31 
 
 
888 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1887  DNA mismatch repair protein MutS  47.6 
 
 
868 aa  747    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00463381  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1355  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
872 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.653089  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1207  DNA mismatch repair protein MutS  41.71 
 
 
862 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1704  DNA mismatch repair protein MutS  45.98 
 
 
887 aa  781    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.470624  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03515  DNA mismatch repair protein MutS  41.58 
 
 
853 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1753  DNA mismatch repair protein MutS  42.38 
 
 
837 aa  647    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.581518  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1542  DNA mismatch repair protein MutS  48.47 
 
 
898 aa  695    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.883963  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  42.64 
 
 
856 aa  637    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2234  DNA mismatch repair protein MutS  42.7 
 
 
894 aa  642    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.282824  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  44.76 
 
 
882 aa  706    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2743  DNA mismatch repair protein MutS  42.55 
 
 
868 aa  669    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1169  DNA mismatch repair protein MutS  43.8 
 
 
864 aa  646    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.29255 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  45.64 
 
 
870 aa  717    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2421  DNA mismatch repair protein MutS  40.9 
 
 
895 aa  640    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  42.42 
 
 
880 aa  650    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2735  DNA mismatch repair protein MutS  47.09 
 
 
850 aa  717    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  47.29 
 
 
869 aa  769    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0147  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 
856 aa  680    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.692226  normal  0.372979 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1358  DNA mismatch repair protein MutS  42.44 
 
 
910 aa  719    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.476923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1171  DNA mismatch repair protein MutS  42.56 
 
 
910 aa  720    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11670  DNA mismatch repair protein MutS  45.76 
 
 
896 aa  758    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.199521  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3645  DNA mismatch repair protein MutS  43.27 
 
 
901 aa  642    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.473403 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1031  DNA mismatch repair protein MutS  43.14 
 
 
851 aa  636    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1332  DNA mismatch repair protein MutS  47.31 
 
 
930 aa  692    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2515  DNA mismatch repair protein MutS  43.23 
 
 
885 aa  657    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1061  DNA mismatch repair protein MutS  42.73 
 
 
861 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  45.04 
 
 
859 aa  720    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  42.37 
 
 
872 aa  647    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1381  DNA mismatch repair protein MutS  40.07 
 
 
872 aa  640    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.640627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1002  DNA mismatch repair protein  48.11 
 
 
858 aa  818    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2095  DNA mismatch repair protein MutS  43.83 
 
 
903 aa  659    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0412  DNA mismatch repair protein MutS  43.16 
 
 
857 aa  657    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  41.7 
 
 
891 aa  658    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1599  DNA mismatch repair protein MutS  42.86 
 
 
875 aa  664    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  44.15 
 
 
872 aa  679    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1477  DNA mismatch repair protein MutS  44.32 
 
 
857 aa  706    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.480331  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0730  DNA mismatch repair protein MutS  44.53 
 
 
889 aa  706    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.687248  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0964  DNA mismatch repair protein MutS  42.31 
 
 
854 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0854968  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  42.21 
 
 
856 aa  632  1e-180  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>