More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1351 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1351  aminotransferase class V  100 
 
 
363 aa  748    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0575  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  54.24 
 
 
362 aa  412  1e-114  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0600  soluble hydrogenase, tritium exchange subunit  53.95 
 
 
362 aa  409  1e-113  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00706485  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_540  aminotransferase, class V  53.67 
 
 
362 aa  408  1e-113  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0499245  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0040  aminotransferase class V  51.39 
 
 
385 aa  368  1e-101  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0119169  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0008  serine--glyoxylate transaminase  51.62 
 
 
383 aa  342  5e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0160251  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2126  aminotransferase class V  45.76 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000896436  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1429  aminotransferase class V  43.85 
 
 
384 aa  335  9e-91  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.126435  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1383  aminotransferase, class V  43.58 
 
 
384 aa  335  1e-90  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000831703  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11530  L-aspartate aminotransferase;phosphoserine aminotransferase  46.82 
 
 
384 aa  332  6e-90  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000426602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0011  aminotransferase, class V  46.26 
 
 
384 aa  329  4e-89  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000196245  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1188  aminotransferase class V  44.38 
 
 
383 aa  325  8.000000000000001e-88  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.26379  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0945  Serine--pyruvate transaminase  47.23 
 
 
386 aa  322  6e-87  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0754728  normal  0.345409 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00341  soluble hydrogenase small subunit  42.94 
 
 
387 aa  322  8e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3486  aminotransferase class V  43.77 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2630  aminotransferase class V  43.77 
 
 
382 aa  320  1.9999999999999998e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.83 
 
 
387 aa  317  2e-85  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1361  soluble hydrogenase small subunit  41.55 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00331  soluble hydrogenase small subunit  41.55 
 
 
384 aa  315  9.999999999999999e-85  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417582  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0019  Serine--glyoxylate transaminase  43.98 
 
 
388 aa  314  1.9999999999999998e-84  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000322298  hitchhiker  0.00000185369 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0035  soluble hydrogenase small subunit  41.27 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3167  Serine--glyoxylate transaminase  43.85 
 
 
385 aa  313  3.9999999999999997e-84  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0836  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  44.44 
 
 
400 aa  312  6.999999999999999e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.259424  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0191  Serine--glyoxylate transaminase  43.98 
 
 
382 aa  310  2e-83  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.746637 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0044  soluble hydrogenase small subunit  45.43 
 
 
382 aa  308  1.0000000000000001e-82  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0013  aminotransferase, class V  43.66 
 
 
385 aa  306  3e-82  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00141675  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00341  soluble hydrogenase small subunit  41.81 
 
 
387 aa  306  5.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0257  response regulator receiver protein  43.38 
 
 
382 aa  305  1.0000000000000001e-81  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00431  soluble hydrogenase small subunit  44.04 
 
 
382 aa  304  2.0000000000000002e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2307  alanine--glyoxylate transaminase  42.45 
 
 
360 aa  302  8.000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0040  soluble hydrogenase small subunit  43.77 
 
 
397 aa  301  1e-80  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0009  aminotransferase class V  44.19 
 
 
383 aa  301  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0111  aminotransferase, class V  40.78 
 
 
380 aa  298  8e-80  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1504  aminotransferase class V  40.83 
 
 
379 aa  298  9e-80  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0103  class V aminotransferase  42.74 
 
 
382 aa  297  2e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00351  soluble hydrogenase small subunit  40.17 
 
 
385 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.269173 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3803  aminotransferase class V  41.9 
 
 
384 aa  296  4e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0104  aminotransferase class V  39.72 
 
 
380 aa  291  9e-78  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1378  Serine--pyruvate transaminase  40.5 
 
 
382 aa  290  2e-77  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4341  aminotransferase class V  42.54 
 
 
382 aa  288  1e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2693  aminotransferase class V  39.89 
 
 
381 aa  286  4e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00390195  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1247  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.73 
 
 
382 aa  285  8e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.465201  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1389  alanine--glyoxylate transaminase  40.45 
 
 
382 aa  282  5.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0519  alanine--glyoxylate transaminase  40.45 
 
 
382 aa  282  6.000000000000001e-75  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1323  alanine--glyoxylate transaminase  39.61 
 
 
387 aa  278  1e-73  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2460  Serine--glyoxylate transaminase  36.74 
 
 
379 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0106  aminotransferase, class V  38.12 
 
 
379 aa  272  8.000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2300  Serine--glyoxylate transaminase  36.84 
 
 
379 aa  269  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000212673  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2413  aminotransferase, class V  41.37 
 
 
415 aa  269  5e-71  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0849168 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0155  Serine--glyoxylate transaminase  37.02 
 
 
380 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.686638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0217  Serine--glyoxylate transaminase  36.57 
 
 
379 aa  266  5e-70  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0514  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  40.72 
 
 
380 aa  263  3e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2447  Serine--glyoxylate transaminase  36.41 
 
 
389 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.372161 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2804  Serine--glyoxylate transaminase  40 
 
 
399 aa  261  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.19938  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2080  phosphoserine aminotransferase / L-aspartate aminotransferase  38.94 
 
 
383 aa  256  5e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00351015  normal  0.87954 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3400  Serine--glyoxylate transaminase  39 
 
 
402 aa  255  9e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0386  aminotransferase class V  36.11 
 
 
360 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.823228  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3325  serine--glyoxylate aminotransferase  37.22 
 
 
422 aa  254  2.0000000000000002e-66  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0804  aminotransferase class V  37.46 
 
 
394 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1388  serine-glyoxylate aminotransferase  37.5 
 
 
391 aa  252  7e-66  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2405  aminotransferase class V  36.03 
 
 
395 aa  252  7e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.134118 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0923  aminotransferase, class V  39.17 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000440044  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3452  aminotransferase, class V  36.75 
 
 
391 aa  249  4e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0781  aminotransferase, class V  39.66 
 
 
381 aa  247  2e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.329422  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3524  Serine--glyoxylate transaminase  37.53 
 
 
398 aa  246  4e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.119567  normal  0.298821 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4200  aminotransferase class V  39.78 
 
 
391 aa  246  4e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.357141 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4570  Serine--glyoxylate transaminase  39.51 
 
 
391 aa  245  9e-64  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0189325 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0981  aminotransferase, class V  36.96 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4717  Serine--glyoxylate transaminase  39.78 
 
 
391 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00393654 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6959  Serine--glyoxylate transaminase  38.68 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.987633  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4253  Serine--glyoxylate transaminase  37.5 
 
 
406 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.340668  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3308  serine-glyoxylate aminotransferase  40.06 
 
 
398 aa  242  6e-63  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.662608  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3921  Serine--glyoxylate transaminase  38.26 
 
 
396 aa  242  7e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1715  aminotransferase class V  35.9 
 
 
389 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2602  serine-glyoxylate aminotransferase  38.95 
 
 
396 aa  240  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0190637  normal  0.923656 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3001  Serine--glyoxylate transaminase  38.73 
 
 
406 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000231297  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5729  Serine-glyoxylate aminotransferase  36.39 
 
 
401 aa  240  4e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.31736  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0114  L-aspartate aminotransferase / phosphoserine aminotransferase  36.89 
 
 
395 aa  238  9e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.31089  normal  0.387069 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5140  aminotransferase, class V  36.14 
 
 
406 aa  238  2e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7112  aminotransferase class V  39.94 
 
 
417 aa  238  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0602  Serine--glyoxylate transaminase  36.6 
 
 
394 aa  238  2e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6552  Serine--glyoxylate transaminase  39.94 
 
 
417 aa  237  3e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.323999 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1162  aminotransferase, class V  36.29 
 
 
398 aa  236  3e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000700049  normal  0.406686 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5929  Serine--glyoxylate transaminase  38.67 
 
 
421 aa  236  4e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.293616  normal  0.115656 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3261  serine-glyoxylate aminotransferase  38.8 
 
 
415 aa  235  7e-61  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.491157  normal 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3418  Serine--glyoxylate transaminase  38.27 
 
 
400 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3022  aminotransferase, class V  37.82 
 
 
406 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.376021 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0548  Serine--glyoxylate transaminase  36.99 
 
 
403 aa  234  2.0000000000000002e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5630  Serine-glyoxylate aminotransferase (SGAT)  38.23 
 
 
401 aa  233  3e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2906  aminotransferase class V  36.13 
 
 
414 aa  233  4.0000000000000004e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0887  serine--glyoxylate transaminase  35.91 
 
 
396 aa  233  5e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.894708 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1795  Serine--glyoxylate transaminase  36.27 
 
 
402 aa  232  7.000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.758509  normal  0.307754 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2699  serine-glyoxylate aminotransferase  38.89 
 
 
396 aa  231  1e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.734695  normal  0.425338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3052  Serine--glyoxylate transaminase  35.2 
 
 
413 aa  231  1e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.160259 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2131  aminotransferase class V  35.73 
 
 
402 aa  230  3e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1762  aminotransferase class V  36.95 
 
 
412 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.229115  normal  0.0159311 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1778  aminotransferase, class V  34.93 
 
 
385 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.182739  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1813  aminotransferase class V  34.93 
 
 
385 aa  228  9e-59  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.300679  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1714  aminotransferase class V  37.13 
 
 
396 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.280776 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1747  aminotransferase class V  35.52 
 
 
402 aa  227  2e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.223279 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>