More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1242 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1242  3-dehydroquinate dehydratase, type II  100 
 
 
145 aa  299  8.000000000000001e-81  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3731  3-dehydroquinate dehydratase  61.59 
 
 
157 aa  187  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.318206  hitchhiker  0.00144149 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3243  3-dehydroquinate dehydratase  62.6 
 
 
144 aa  184  4e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.414343 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2973  3-dehydroquinate dehydratase  60 
 
 
144 aa  174  5e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.013509  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06130  3-dehydroquinate dehydratase, type II  54.68 
 
 
148 aa  171  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3151  3-dehydroquinate dehydratase  59.69 
 
 
147 aa  169  7.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1823  3-dehydroquinate dehydratase  52.48 
 
 
144 aa  168  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000527848  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0981  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
150 aa  167  4e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00261283  normal  0.0932644 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2022  3-dehydroquinate dehydratase  52.11 
 
 
150 aa  166  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1456  3-dehydroquinate dehydratase  55.4 
 
 
145 aa  164  2.9999999999999998e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.903143  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2664  3-dehydroquinate dehydratase  48.97 
 
 
150 aa  160  4.0000000000000004e-39  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2695  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 
145 aa  160  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.800528 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0744  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00682582  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0715  3-dehydroquinate dehydratase  52.82 
 
 
153 aa  160  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1050  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
147 aa  159  1e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000995076  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0032  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
149 aa  157  6e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0662  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
147 aa  157  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1505  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
159 aa  156  9e-38  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2190  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.3 
 
 
150 aa  156  9e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.369696  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1474  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
152 aa  155  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00136549  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1551  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
150 aa  155  2e-37  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.961806  normal  0.25542 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0849  3-dehydroquinate dehydratase  52.59 
 
 
142 aa  154  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00904578  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1595  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.41 
 
 
144 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4097  3-dehydroquinate dehydratase, type II  49.65 
 
 
165 aa  154  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.517045  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1540  3-dehydroquinate dehydratase  53.9 
 
 
156 aa  154  4e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0606879 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3469  3-dehydroquinate dehydratase, type II  50 
 
 
152 aa  152  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.411498 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1698  3-dehydroquinate dehydratase, type II  52.9 
 
 
145 aa  152  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
146 aa  152  2e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114768  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2657  3-dehydroquinate dehydratase  49.3 
 
 
149 aa  151  2.9999999999999998e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000254633 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0370  3-dehydroquinate dehydratase  51.11 
 
 
159 aa  150  7e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00140278  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1559  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
149 aa  149  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.897026  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0695  3-dehydroquinate dehydratase  50.35 
 
 
144 aa  148  2e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0103169  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5722  3-dehydroquinate dehydratase  45 
 
 
149 aa  148  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0337  3-dehydroquinate dehydratase  52.21 
 
 
146 aa  148  3e-35  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1003  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
150 aa  147  4e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2893  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  147  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0307948  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2547  3-dehydroquinate dehydratase, type II  51.82 
 
 
142 aa  147  5e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.758716  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0925  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  147  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4272  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  147  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4329  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  147  6e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4103  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  146  7e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.478145  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3941  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  146  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3952  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  146  7e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.405359  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4423  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  146  7e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4219  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  146  7e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0915  3-dehydroquinate dehydratase  45.77 
 
 
149 aa  146  9e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.249833  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4309  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0364  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 
159 aa  146  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0718569  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4052  3-dehydroquinate dehydratase  48.23 
 
 
146 aa  145  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0255  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.89 
 
 
184 aa  145  2.0000000000000003e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04381  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
145 aa  145  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0561971  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0189  3-dehydroquinate dehydratase  50 
 
 
156 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2300  3-dehydroquinate dehydratase  46.48 
 
 
148 aa  144  3e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.562117  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1796  3-dehydroquinate dehydratase, type II  53.03 
 
 
146 aa  144  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0209  3-dehydroquinate dehydratase  49.64 
 
 
155 aa  144  5e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0306548 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5387  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
153 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.878433  normal  0.435849 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0200  3-dehydroquinate dehydratase  51.47 
 
 
156 aa  143  6e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0230  3-dehydroquinate dehydratase  46.04 
 
 
160 aa  143  7.0000000000000006e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0211  3-dehydroquinate dehydratase  50.74 
 
 
156 aa  142  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1211  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.89 
 
 
155 aa  142  1e-33  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0544  3-dehydroquinate dehydratase  47.41 
 
 
152 aa  142  1e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2531  3-dehydroquinate dehydratase  51.08 
 
 
145 aa  142  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1538  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
145 aa  142  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1721  3-dehydroquinate dehydratase  48.59 
 
 
145 aa  142  2e-33  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0290  3-dehydroquinate dehydratase, type II  48.15 
 
 
160 aa  141  3e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.347415  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0533  3-dehydroquinate dehydratase  46.85 
 
 
151 aa  141  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.665564 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0954  3-dehydroquinate dehydratase  47.83 
 
 
148 aa  140  5e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0330586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0668  3-dehydroquinate dehydratase  44.68 
 
 
156 aa  140  5e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3290  3-dehydroquinate dehydratase  44.78 
 
 
152 aa  140  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267239  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2778  3-dehydroquinate dehydratase  47.55 
 
 
150 aa  140  7e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.692707  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1732  3-dehydroquinate dehydratase  48.53 
 
 
145 aa  140  7e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.676815  normal  0.0717581 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3499  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
207 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3425  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
151 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.112625  normal  0.0823 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0421  3-dehydroquinate dehydratase  47.22 
 
 
207 aa  139  9.999999999999999e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01135  Catabolic 3-dehydroquinase (EC 4.2.1.10)(3-dehydroquinate dehydratase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P05147]  48.51 
 
 
153 aa  139  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.174731 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3502  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248237  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0063  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2500  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.263847  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1924  3-dehydroquinate dehydratase  48.15 
 
 
142 aa  138  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.132739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1521  3-dehydroquinate dehydratase  45.83 
 
 
148 aa  138  1.9999999999999998e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3284  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1164  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
207 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1280  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0532  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.68766  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0104  3-dehydroquinate dehydratase  50.37 
 
 
159 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0508  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  138  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3464  3-dehydroquinate dehydratase  46.9 
 
 
150 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2228  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.1 
 
 
149 aa  138  3e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3063  3-dehydroquinate dehydratase  48.89 
 
 
162 aa  137  3e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0088  3-dehydroquinate dehydratase  47.18 
 
 
161 aa  138  3e-32  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.2275  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2094  3-dehydroquinate dehydratase, type II  45.86 
 
 
142 aa  137  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.641417  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0123  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0606  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2628  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
154 aa  137  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0575  3-dehydroquinate dehydratase  46.15 
 
 
150 aa  137  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000460325 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1707  3-dehydroquinate dehydratase  45.07 
 
 
146 aa  137  6e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0599881  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0076  3-dehydroquinate dehydratase  49.63 
 
 
159 aa  137  6e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38070  3-dehydroquinate dehydratase  47.01 
 
 
147 aa  137  7e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.633165  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2407  3-dehydroquinate dehydratase  45.45 
 
 
149 aa  135  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0668809  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0246  3-dehydroquinate dehydratase, type II  47.86 
 
 
156 aa  136  1e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>