243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1167 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3273  pepF/M3 family oligoendopeptidase  51.69 
 
 
603 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.474589 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  100 
 
 
593 aa  1228    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1998  pepF/M3 family oligoendopeptidase  50.93 
 
 
603 aa  634  1e-180  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  47.72 
 
 
606 aa  561  1.0000000000000001e-159  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1211  oligoendopeptidase pepF/M3 family  44.05 
 
 
587 aa  496  1e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.000000802852  normal  0.797975 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2647  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  43.59 
 
 
584 aa  493  9.999999999999999e-139  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00961781  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1212  pepF/M3 family oligoendopeptidase  39.8 
 
 
586 aa  443  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0407734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  38.66 
 
 
597 aa  418  9.999999999999999e-116  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3298  pepF/M3 family oligoendopeptidase  37.67 
 
 
582 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6864  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  33.28 
 
 
612 aa  325  2e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.176327 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1955  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  32.39 
 
 
607 aa  288  2.9999999999999996e-76  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0130  Oligopeptidase F  29.51 
 
 
593 aa  287  4e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  31.52 
 
 
598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0490  oligoendopeptidase F  29.72 
 
 
603 aa  259  7e-68  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0281  oligoendopeptidase F  30.53 
 
 
600 aa  258  2e-67  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.651782  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02130  oligopeptidase  28.55 
 
 
599 aa  235  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1729  oligopeptidase F  28.76 
 
 
593 aa  232  1e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0341754  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003689  oligoendopeptidase F  28.05 
 
 
598 aa  230  4e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0884  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.39 
 
 
578 aa  218  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000022902  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2068  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.77 
 
 
603 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1873  oligoendopeptidase F  27.39 
 
 
596 aa  210  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.201769  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2055  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.5 
 
 
591 aa  206  8e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00862679  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0081  oligoendopeptidase F  26.17 
 
 
620 aa  202  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.73 
 
 
612 aa  201  3e-50  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2988  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.37 
 
 
588 aa  200  5e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.68469e-23 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.29 
 
 
625 aa  200  7e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0076  oligoendopeptidase F  26.01 
 
 
620 aa  199  7.999999999999999e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  26.04 
 
 
625 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1482  pepF/M3 family oligoendopeptidase  30.47 
 
 
615 aa  197  3e-49  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1295  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  23.86 
 
 
588 aa  197  4.0000000000000005e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0778267  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4566  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.03 
 
 
607 aa  196  1e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0554379  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2576  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.01 
 
 
620 aa  195  2e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.855226 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4260  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.83 
 
 
620 aa  193  6e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6862  putative oligoendopeptidase F  30.56 
 
 
664 aa  193  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.916639  normal  0.20394 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2877  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.88 
 
 
601 aa  192  1e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0929363  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1993  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.29 
 
 
592 aa  192  2e-47  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000167694  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2052  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.29 
 
 
614 aa  190  5.999999999999999e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.841739  hitchhiker  0.00000309933 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3296  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.3 
 
 
617 aa  190  5.999999999999999e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2803  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.18 
 
 
623 aa  190  5.999999999999999e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.121144  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1054  oligoendopeptidase F  29.8 
 
 
573 aa  189  1e-46  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2684  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.77 
 
 
627 aa  188  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.667149 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0213  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.73 
 
 
616 aa  188  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.227297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3148  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.17 
 
 
616 aa  187  4e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00629046 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3597  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.42 
 
 
617 aa  187  5e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.794644  normal  0.398139 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0370  pepF/M3 family oligoendopeptidase  25.88 
 
 
622 aa  186  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1694  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.55 
 
 
584 aa  185  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0882  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.57 
 
 
608 aa  183  6e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83984  normal  0.332504 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3702  oligoendopeptidase F  25.85 
 
 
619 aa  182  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2070  pepF/M3 family oligoendopeptidase  29.25 
 
 
634 aa  182  1e-44  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.024965  normal  0.33011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2192  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.52 
 
 
597 aa  182  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.246068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3392  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  29.79 
 
 
607 aa  182  2e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.935472  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.86 
 
 
625 aa  181  2.9999999999999997e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1177  pepF/M3 family oligoendopeptidase  23.65 
 
 
590 aa  181  4e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  27.43 
 
 
626 aa  180  7e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2360  peptidase, family M3  30.98 
 
 
529 aa  179  9e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.995178  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2730  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.53 
 
 
616 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.797581  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0569  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  30.09 
 
 
606 aa  179  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0425519  hitchhiker  0.00000722694 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1832  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.78 
 
 
620 aa  179  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.657708 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1242  oligoendopeptidase F  27.92 
 
 
573 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.906065  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0623  oligoendopeptidase F  25 
 
 
573 aa  176  8e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  29.1 
 
 
626 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1382  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.13 
 
 
589 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000209164  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1117  oligoendopeptidase F  25.34 
 
 
572 aa  175  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1570  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.12 
 
 
606 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713222  normal  0.288392 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  30.02 
 
 
527 aa  174  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.7 
 
 
638 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.77 
 
 
632 aa  174  5e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2885  peptidase, family M3  30.07 
 
 
527 aa  172  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  28.57 
 
 
610 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1636  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  25.3 
 
 
573 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  30.18 
 
 
527 aa  172  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0719  oligoendopeptidase F, putative  26.24 
 
 
569 aa  171  2e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.954418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  29.95 
 
 
527 aa  171  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0066  rhomboid family protein  27.72 
 
 
573 aa  171  4e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.411672  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  30.3 
 
 
527 aa  170  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0329  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  28.22 
 
 
615 aa  170  7e-41  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.559929 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1896  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.75 
 
 
601 aa  169  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0701  putative oligoendopeptidase F  27.06 
 
 
571 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  27.22 
 
 
527 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2412  oligoendopeptidase F  26.27 
 
 
606 aa  165  2.0000000000000002e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0632065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0533  pepF/M3 family oligoendopeptidase  27.84 
 
 
589 aa  165  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18439  normal  0.721981 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2603  oligoendopeptidase  28.7 
 
 
611 aa  164  5.0000000000000005e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0093862 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1075  pepF/M3 family oligoendopeptidase  28.26 
 
 
606 aa  163  7e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.371255  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2672  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  29.47 
 
 
539 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0535944  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2674  oligoendopeptidase F, putative  25.46 
 
 
598 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2299  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25.46 
 
 
598 aa  160  7e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.39572 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1422  oligoendopeptidase F  24 
 
 
596 aa  156  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0811423  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  32.36 
 
 
394 aa  154  4e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0388  oligoendopeptidase F  27.59 
 
 
608 aa  152  2e-35  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0196949  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0738  oligoendopeptidase F  25.25 
 
 
609 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08170  Oligoendopeptidase F  24.25 
 
 
598 aa  151  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1817  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.11 
 
 
597 aa  144  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0058  oligoendopeptidase F  26.19 
 
 
592 aa  145  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0099  oligoendopeptidase F  25.48 
 
 
619 aa  144  4e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.893555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2002  oligoendopeptidase F  24.53 
 
 
594 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000655164  normal  0.321245 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1105  peptidase  28.1 
 
 
566 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.567346  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D12  oligopeptidase F  24.71 
 
 
604 aa  141  3e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34179  predicted protein  25.86 
 
 
577 aa  139  1e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.137613  normal  0.109742 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1121  oligoendopeptidase F  26.35 
 
 
600 aa  139  2e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2457  oligoendopeptidase F  22.53 
 
 
595 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0101459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>