More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1123 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1123  ABC-2 type transporter  100 
 
 
257 aa  501  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  48.85 
 
 
259 aa  239  2e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3547  ABC-2 type transporter  43.24 
 
 
259 aa  193  3e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.369986 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6126  ABC-2 type transporter  46.53 
 
 
275 aa  181  1e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0365687  normal  0.579785 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0062  ABC-2 type transporter  31.92 
 
 
260 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000566487  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0014  ABC-2 type transporter  33.47 
 
 
304 aa  140  3e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0786  ABC-2 type transporter  34.52 
 
 
254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.585621  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1533  ABC-2 type transporter  33.48 
 
 
274 aa  128  9.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0497  ABC-2 type transporter  29 
 
 
286 aa  124  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.779296  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0363  ABC-2 type transporter  32.23 
 
 
289 aa  123  4e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4106  ABC-2 type transporter  30.84 
 
 
293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2409  ABC-2 type transporter  32.79 
 
 
253 aa  120  3e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0476  ABC transporter  29.61 
 
 
261 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0918062 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2864  ABC-2 type transporter  32.5 
 
 
290 aa  115  5e-25  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3408  ABC-2 type transporter, permease protein  32.67 
 
 
243 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.184246  normal  0.618546 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3882  ABC-2 type transporter  31.13 
 
 
278 aa  111  9e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.214261 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3861  ABC-2 type transporter  34.8 
 
 
291 aa  111  9e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.92497  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0192  hypothetical protein  35.2 
 
 
295 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.144906 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1593  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.77 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.327285  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0340  ABC-2 type transporter  29.82 
 
 
273 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.171685  hitchhiker  0.00234396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1170  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  30.59 
 
 
253 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.780816  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3518  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
298 aa  108  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2588  ABC-2 type transporter  32.89 
 
 
298 aa  108  9.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1730  hypothetical protein  31.33 
 
 
251 aa  107  1e-22  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.45161 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4873  ABC-2 type transporter  32.31 
 
 
298 aa  106  3e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0785  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  31.72 
 
 
253 aa  106  3e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1079  ABC-2 type transporter  33.33 
 
 
296 aa  107  3e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0666  ABC-2 type transporter  31.11 
 
 
285 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1478  ABC-2 type transporter  27.69 
 
 
254 aa  104  1e-21  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2250  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
256 aa  104  1e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.239998  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1448  ABC-2 type transporter  31.02 
 
 
251 aa  104  1e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0318973  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4150  hypothetical protein  29.72 
 
 
261 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000233601  normal  0.0693377 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0918  ABC-2 type transporter  28.24 
 
 
254 aa  102  5e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1750  putative multidrug efflux ABC transporter  33.92 
 
 
277 aa  102  8e-21  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0190039  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1165  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.96 
 
 
253 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1510  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  29.96 
 
 
253 aa  102  8e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.525568  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04481  putative multidrug efflux ABC transporter  31.25 
 
 
284 aa  102  9e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.86864  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1766  multidrug ABC transporter, permease protein  31.1 
 
 
242 aa  101  1e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1473  hypothetical protein  31.8 
 
 
269 aa  100  3e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.377134  normal  0.24112 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1203  ABC-2 type transporter  29.57 
 
 
251 aa  100  3e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0595438 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3137  ABC-2 type transporter  30 
 
 
277 aa  99.8  4e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.428202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0223  hypothetical protein  29.49 
 
 
251 aa  99.4  5e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.587044  normal  0.793487 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3247  ABC-2 type transporter  30.74 
 
 
254 aa  99  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.590775 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0612  putative multidrug efflux ABC transporter  35 
 
 
284 aa  99  7e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1448  putative ABC transporter transmembrane protein  29.53 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0121  ABC-2 type transporter  31.05 
 
 
252 aa  98.6  8e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0240531  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4023  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.293949  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4992  ABC-2 type transporter  30.45 
 
 
270 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.402209  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4056  ABC-2 type transporter  29.67 
 
 
267 aa  97.8  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1380  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.07 
 
 
256 aa  97.8  2e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000932687  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1839  ABC-2 type transporter  29.13 
 
 
266 aa  96.7  3e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3916  ABC transporter, inner membrane subunit  29.67 
 
 
267 aa  97.1  3e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1426  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  28.44 
 
 
256 aa  96.3  4e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0562869  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0906  ABC-2 type transporter  30 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000570099 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1561  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
252 aa  95.9  6e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.403911  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05051  putative multidrug efflux ABC transporter  31.65 
 
 
274 aa  95.5  6e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.507008  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04741  putative multidrug efflux ABC transporter  31.65 
 
 
274 aa  95.9  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2515  ABC transporter, permease protein  29.05 
 
 
278 aa  95.5  8e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.551545 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0449  putative multidrug efflux ABC transporter  29.07 
 
 
274 aa  95.1  9e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.603097  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0538  ABC-2 type transporter  27.03 
 
 
267 aa  94.7  1e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.690834  hitchhiker  0.000010786 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1358  ABC-2 type transporter  31.56 
 
 
294 aa  94  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.624692  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06471  putative multidrug efflux ABC transporter  34.53 
 
 
284 aa  94.4  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.620136 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0242  ABC-2 type transporter  26.64 
 
 
278 aa  94.4  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3245  multidrug ABC transporter, permease protein  30.28 
 
 
250 aa  93.6  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.234725  normal  0.0779856 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3574  ABC transporter, permease protein  32.54 
 
 
254 aa  93.2  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.426841  normal  0.115682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4936  ABC-2 type transporter  30.2 
 
 
280 aa  93.2  3e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.707728  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30730  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.08 
 
 
277 aa  93.2  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.364162  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0251  ABC-2 type transporter  29.46 
 
 
255 aa  92.4  6e-18  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.452318 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2056  ABC-2 type transporter  32.04 
 
 
241 aa  92.4  6e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.794734  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05121  putative multidrug efflux ABC transporter  31.65 
 
 
274 aa  92  8e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07250  ABC-type polysaccharide/polyol phosphate export systems, permease component  30.09 
 
 
265 aa  92  9e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.307058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1958  ABC-2 type transporter  30.32 
 
 
250 aa  92  9e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00055396  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1528  hypothetical protein  32.61 
 
 
249 aa  91.7  1e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3986  ABC-2 type transporter  28.9 
 
 
280 aa  91.7  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1755  ABC-2 type transporter  36.95 
 
 
264 aa  91.3  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.586856  decreased coverage  0.00328589 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3328  ABC-2 type transporter  29.15 
 
 
281 aa  90.5  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.45338  normal  0.334159 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4200  ABC-2 type transporter  30.53 
 
 
275 aa  90.1  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.724357  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3718  ABC-2 type transporter  29.72 
 
 
260 aa  90.1  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.282288  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1020  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  32 
 
 
249 aa  90.1  3e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0552463  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0427  ABC-2 type transporter  27.51 
 
 
278 aa  89.7  4e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.469533  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2149  ABC-2 type transport system permease protein  34.07 
 
 
286 aa  89.4  6e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.157353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1122  ABC-2 type transporter  25.98 
 
 
285 aa  89  8e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.408605  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2171  ABC-2 type transporter  29.52 
 
 
256 aa  88.2  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0176  hypothetical protein  32.14 
 
 
241 aa  87.8  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.67071  normal  0.0449558 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2561  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  33.7 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.760407 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1123  ABC-2 type transporter  28.26 
 
 
275 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1342  ABC-2 type transporter  28.71 
 
 
279 aa  87.4  2e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.333729  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3922  ABC-2 type transporter  29.27 
 
 
266 aa  87  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0348636  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2407  ABC-2 type transporter  29.35 
 
 
288 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000146811  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0327  daunorubicin resistance ABC transporter, inner membrane subunit B  27.73 
 
 
249 aa  87  3e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.315936  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1459  ABC-2 type transporter  34.62 
 
 
249 aa  86.3  5e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1781  putative multidrug efflux ABC transporter  32.02 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  32.02 
 
 
284 aa  85.5  7e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.112221 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0388  ABC efflux pump, inner membrane subunit  28.57 
 
 
249 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.169706  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2016  ABC-2 type transporter  31.7 
 
 
268 aa  84.3  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4170  ABC-2 type transporter  25.93 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8873  ABC-2 type transporter  28.63 
 
 
270 aa  84.3  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.53633  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2897  ABC-2 type transporter  28.46 
 
 
274 aa  83.2  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.643507  normal  0.323486 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0451  ABC-type multidrug transport system, permease component  26.67 
 
 
269 aa  83.2  0.000000000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0034336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2294  ABC-2 type transporter  27.65 
 
 
277 aa  83.6  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.911135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>