More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_1047 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  100 
 
 
221 aa  457  9.999999999999999e-129  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  33.18 
 
 
223 aa  134  9.999999999999999e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  35.89 
 
 
215 aa  128  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0143  putative competence protein F  32.47 
 
 
230 aa  125  5e-28  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  36.18 
 
 
247 aa  124  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1623  phosphoribosyltransferase  38.12 
 
 
227 aa  123  2e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.933338  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2573  amidophosphoribosyltransferase  39.02 
 
 
247 aa  122  5e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  36.04 
 
 
229 aa  121  7e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  36.36 
 
 
243 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0784  ComF family protein  42.58 
 
 
251 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0887705  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0093  competence protein F  30.74 
 
 
230 aa  115  6.9999999999999995e-25  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3693  amidophosphoribosyl-transferase  33.8 
 
 
230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  32.87 
 
 
238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  39.56 
 
 
213 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  39.31 
 
 
249 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1314  hypothetical protein  34.91 
 
 
226 aa  109  3e-23  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  32.86 
 
 
220 aa  108  5e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
270 aa  108  7.000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  38.55 
 
 
255 aa  108  7.000000000000001e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  32.09 
 
 
259 aa  108  7.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  34.21 
 
 
271 aa  108  9.000000000000001e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  32.77 
 
 
238 aa  106  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0109  phosphoribosyltransferase  32.32 
 
 
245 aa  106  2e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.0864582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  30.57 
 
 
233 aa  106  3e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  30.38 
 
 
242 aa  105  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2181  hypothetical protein  32.99 
 
 
227 aa  105  5e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000180305  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  32.63 
 
 
255 aa  105  7e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0090  phosphoribosyltransferase  30.37 
 
 
220 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.97 
 
 
233 aa  104  1e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  30.7 
 
 
226 aa  104  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  30.18 
 
 
233 aa  103  2e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0158  competence protein F-related protein  33.49 
 
 
246 aa  103  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1128  phosphoribosyltransferase  32.89 
 
 
239 aa  103  2e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  31.08 
 
 
233 aa  103  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0737  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
246 aa  102  3e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.113594  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  33.94 
 
 
239 aa  102  4e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1537  putative competence protein F  31.53 
 
 
228 aa  102  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0200  competence protein  31.49 
 
 
269 aa  102  6e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0234  putative competence protein F-related protein  34.15 
 
 
240 aa  101  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0348529 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2252  hypothetical protein  32.93 
 
 
234 aa  101  9e-21  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3771  phosphoribosyltransferase  33.48 
 
 
239 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2280  hypothetical protein  32.93 
 
 
234 aa  101  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  31.33 
 
 
239 aa  100  1e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3855  phosphoribosyltransferase  32.73 
 
 
239 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00709027 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0215  putative competence protein F-related protein  32.68 
 
 
240 aa  99.8  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.162002 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  33.01 
 
 
235 aa  99  5e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  32.74 
 
 
255 aa  98.6  6e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  29.6 
 
 
246 aa  98.6  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  32.83 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.64 
 
 
258 aa  98.2  9e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2240  phosphoribosyltransferase  32.26 
 
 
230 aa  98.2  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0026  phosphoribosyltransferase  38.06 
 
 
254 aa  97.4  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2284  phosphoribosyltransferase  32.58 
 
 
258 aa  98.2  1e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0107952 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0049  competence protein F  30.13 
 
 
241 aa  96.7  2e-19  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3495  amidophosphoribosyltransferase  28.82 
 
 
236 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.552167 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  32.75 
 
 
255 aa  96.3  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0107  phosphoribosyltransferase  32.02 
 
 
272 aa  95.9  5e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0129  competence protein F  33.78 
 
 
237 aa  95.5  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0520  phosphoribosyltransferase  36.4 
 
 
269 aa  95.1  7e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  31.28 
 
 
233 aa  94.7  9e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0040  competence protein F  30.13 
 
 
241 aa  94.7  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.648348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  31.03 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0317  hypothetical protein  30.61 
 
 
230 aa  94.4  1e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0134906 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0242  competence protein  29.29 
 
 
263 aa  94.7  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  31.37 
 
 
243 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  32.23 
 
 
207 aa  94.4  1e-18  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0418  competence protein F  29.44 
 
 
237 aa  94.4  1e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000113575 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2371  phosphoribosyltransferase  28.38 
 
 
231 aa  94.4  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.115381  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  37.14 
 
 
206 aa  93.6  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2183  phosphoribosyltransferase  28.57 
 
 
230 aa  94  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000715358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  29.18 
 
 
258 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3081  phosphoribosyltransferase  29.09 
 
 
237 aa  93.6  2e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000295242  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  32.91 
 
 
264 aa  93.2  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  28.76 
 
 
258 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  31.34 
 
 
232 aa  93.2  3e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  26.52 
 
 
245 aa  92.8  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2014  phosphoribosyltransferase  30.09 
 
 
230 aa  92.8  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.545639 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1679  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  32.5 
 
 
231 aa  92.4  4e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  32.02 
 
 
267 aa  92.8  4e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  33.49 
 
 
232 aa  92.4  5e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  30.73 
 
 
246 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  31.22 
 
 
246 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  29.34 
 
 
276 aa  91.7  8e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  28.71 
 
 
247 aa  91.3  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  33.96 
 
 
255 aa  91.3  1e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  32.41 
 
 
242 aa  90.9  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  33.51 
 
 
245 aa  90.9  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  32.19 
 
 
236 aa  90.1  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  32.39 
 
 
248 aa  90.1  2e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  31.56 
 
 
231 aa  90.5  2e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3140  K+-dependent Na+/Ca+ exchanger related-protein  30.18 
 
 
296 aa  90.5  2e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.012105  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  34.22 
 
 
262 aa  89.7  3e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  31.74 
 
 
279 aa  89  5e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  30.96 
 
 
269 aa  89  6e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1412  hypothetical protein  30.19 
 
 
231 aa  88.6  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0156224  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  33.17 
 
 
242 aa  88.2  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3504  competence protein ComF  30.62 
 
 
250 aa  88.2  9e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  31.28 
 
 
233 aa  87.4  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  45.05 
 
 
118 aa  87.8  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>