More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0947 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0947  ribosomal protein S20  100 
 
 		 100 aa  187  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2090  30S ribosomal protein S20  46.74 
 
 		 94 aa  78.6  0.00000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000134662  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1176  SSU ribosomal protein S20P  50.63 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.150472  hitchhiker  0.00109182 
 
 
-
 
NC_002936  DET1639  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000663879  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1521  ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 88 aa  71.6  0.000000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000787873  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1383  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 88 aa  70.1  0.000000000009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000140868  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0292  30S ribosomal protein S20  46.43 
 
 		 87 aa  68.6  0.00000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.161586 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2005  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 95 aa  68.9  0.00000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.894621  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2318  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000431209  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2972  30S ribosomal protein S20  51.9 
 
 		 94 aa  67.4  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000017573 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1552  ribosomal protein S20  49.38 
 
 		 86 aa  67  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0324223  normal  0.177559 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1740  30S ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.632163  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1919  30S ribosomal protein S20  39.76 
 
 		 99 aa  66.2  0.0000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000179184  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17390  SSU ribosomal protein S20P  45.35 
 
 		 88 aa  65.9  0.0000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.3443  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3076  30S ribosomal protein S20  51.25 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.00000000126326  hitchhiker  0.00230121 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3522  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.824464  normal  0.131692 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3510  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3582  30S ribosomal protein S20  48.19 
 
 		 86 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.179695  normal  0.0144899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2105  30S ribosomal protein S20  48.78 
 
 		 107 aa  65.1  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0577  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 105 aa  64.7  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12440  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 86 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2031  30S ribosomal protein S20  45.78 
 
 		 87 aa  64.3  0.0000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0513769  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1179  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 86 aa  64.3  0.0000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1013  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  63.5  0.0000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000773203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1145  30S ribosomal protein S20  50.65 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.576615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3421  ribosomal protein S20  48 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.144385  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3912  30S ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  63.5  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1843  ribosomal protein S20  45.57 
 
 		 88 aa  63.2  0.000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3262  ribosomal protein S20  47.06 
 
 		 90 aa  63.2  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521997  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1780  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1753  30S ribosomal protein S20  43.33 
 
 		 97 aa  63.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1261  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 89 aa  62.4  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0399917 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1587  30S ribosomal protein S20  40.96 
 
 		 88 aa  62.8  0.000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0510441  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60400  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 91 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1556  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 86 aa  62  0.000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2725  30S ribosomal protein S20  44.3 
 
 		 92 aa  61.6  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0313698  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16091  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 100 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1295  ribosomal protein S20  42.39 
 
 		 89 aa  61.6  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.312929  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1932  ribosomal protein S20  40.51 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000591631  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2960  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000020022  normal  0.711019 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3042  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000000711095  normal  0.679659 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3140  30S ribosomal protein S20  46.59 
 
 		 88 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000322066  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0490  ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 99 aa  61.6  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2505  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0849  SSU ribosomal protein S20P  43.37 
 
 		 88 aa  61.2  0.000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3546  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 89 aa  60.8  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0950  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 92 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.466719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40720  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 91 aa  61.2  0.000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5467  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2665  30S ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 86 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.213865  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0827  SSU ribosomal protein S20P  48.19 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0352915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2446  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  60.5  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000240091  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3844  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  60.5  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.160691  hitchhiker  0.0019697 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0700  ribosomal protein S20  46.75 
 
 		 92 aa  60.1  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.000000000536683  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3537  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1056  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.134446  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3238  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000254037  normal  0.534831 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7071  ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.595098  normal  0.725666 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3465  30S ribosomal protein S20  45.88 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1281  30S ribosomal protein S20  48.24 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000755686  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1520  30S ribosomal protein S20  40.86 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.171164 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0689  ribosomal protein S20  44.58 
 
 		 89 aa  60.1  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.152983 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1051  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000204572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1576  ribosomal protein S20  45.56 
 
 		 89 aa  59.7  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2299  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00503928  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2014  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 87 aa  60.1  0.00000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1118  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000408096  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2067  ribosomal protein S20  42.17 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1152  30S ribosomal protein S20  44.32 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000294185  normal  0.185993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2181  30S ribosomal protein S20  44.94 
 
 		 97 aa  60.1  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.752642  normal  0.564535 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1106  30S ribosomal protein S20  38.55 
 
 		 93 aa  59.3  0.00000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00644283  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2206  30S ribosomal protein S20  44.44 
 
 		 87 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.935236  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2250  30S ribosomal protein S20  42.53 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4855  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 90 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2941  30S ribosomal protein S20  41.38 
 
 		 112 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.205918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13310  SSU ribosomal protein S20P  46.99 
 
 		 86 aa  58.5  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.170233  normal  0.153651 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0554  ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 87 aa  58.5  0.00000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1846  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2188  30S ribosomal protein S20  46.84 
 
 		 91 aa  58.5  0.00000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0220995  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0917  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2098  30S ribosomal protein S20  45.45 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00199179  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0001  ribosomal protein S20  41.98 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0152754  hitchhiker  4.7444199999999996e-21 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1019  30S ribosomal protein S20  39.13 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.230406  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0527  ribosomal protein S20  40.91 
 
 		 88 aa  58.2  0.00000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1685  30S ribosomal protein S20  44.71 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.462249  normal  0.0272644 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1267  30S ribosomal protein S20  43.37 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.771067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0094  ribosomal protein S20  43.04 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2817  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2909  30S ribosomal protein S20  41.77 
 
 		 91 aa  57.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4370  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664055 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1005  30S ribosomal protein S20  42.7 
 
 		 89 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2069  30S ribosomal protein S20  41.11 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1979  30S ribosomal protein S20  45.68 
 
 		 86 aa  57.8  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000253249 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1172  30S ribosomal protein S20  42.86 
 
 		 96 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.0000300859  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0002  30S ribosomal protein S20  47.73 
 
 		 88 aa  57.8  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  unclonable  0.00000000182845  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4641  30S ribosomal protein S20  45.35 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.647122  hitchhiker  0.00990259 
 
 
-
 
NC_004310  BR2185  30S ribosomal protein S20  48.15 
 
 		 88 aa  57.4  0.00000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0585  30S ribosomal protein S20  43.75 
 
 		 87 aa  57.4  0.00000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000109999  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2223  ribosomal protein S20  46.99 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133967  normal  0.0102835 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17380  SSU ribosomal protein S20P  42.35 
 
 		 86 aa  57  0.00000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.573431  hitchhiker  0.00388054 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>