More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0939 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0939  alanine racemase domain protein  100 
 
 
229 aa  471  1e-132  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1865  alanine racemase domain protein  48.62 
 
 
242 aa  180  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.227715  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3251  alanine racemase domain-containing protein  43.21 
 
 
244 aa  176  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.183035  hitchhiker  0.000198069 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3740  alanine racemase domain-containing protein  46.23 
 
 
240 aa  175  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0083568  unclonable  0.000000000341691 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0816  alanine racemase domain protein  42.54 
 
 
230 aa  166  4e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000900984  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1763  alanine racemase domain protein  41.67 
 
 
231 aa  162  3e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.510381  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1179  alanine racemase domain-containing protein  41.7 
 
 
227 aa  163  3e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1062  hypothetical protein  43.75 
 
 
216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0792  hypothetical protein  39.47 
 
 
234 aa  162  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000822407  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1892  alanine racemase domain-containing protein  43.5 
 
 
202 aa  161  9e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000005505  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1533  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 
230 aa  159  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.84787e-35 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0896  hypothetical protein  39.3 
 
 
231 aa  159  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000533107 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1238  alanine racemase domain protein  39.3 
 
 
235 aa  158  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.878338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3256  alanine racemase domain-containing protein  42.34 
 
 
228 aa  158  6e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.902673  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2544  hypothetical protein  43.84 
 
 
231 aa  157  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1555  alanine racemase domain protein  41.1 
 
 
224 aa  155  3e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2707  alanine racemase domain protein  38.86 
 
 
230 aa  154  1e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0546341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4204  hypothetical protein  41.15 
 
 
231 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.810944  hitchhiker  0.00932277 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2739  alanine racemase domain protein  41.63 
 
 
231 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1552  alanine racemase domain-containing protein  41.28 
 
 
248 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1414  alanine racemase domain-containing protein  38.96 
 
 
234 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000108104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3657  alanine racemase domain-containing protein  41.33 
 
 
235 aa  152  5e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0664896  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1272  alanine racemase domain protein  40.38 
 
 
218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03578  hypothetical protein  38.6 
 
 
236 aa  151  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2168  alanine racemase domain protein  40.51 
 
 
244 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1265  alanine racemase domain protein  42.15 
 
 
235 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1232  alanine racemase domain protein  41.15 
 
 
228 aa  149  5e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0708926  normal  0.361735 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1082  alanine racemase domain protein  38.5 
 
 
225 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000765684  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0596  alanine racemase domain protein  39.06 
 
 
235 aa  148  8e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000000505441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0858  hypothetical protein  41.56 
 
 
236 aa  148  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0454343  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0085  alanine racemase domain protein  42 
 
 
235 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0278  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 
232 aa  147  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.334709  normal  0.0228737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2263  alanine racemase domain protein  41.94 
 
 
212 aa  147  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0460  alanine racemase domain protein  42.38 
 
 
228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002457  hypothetical protein  38.1 
 
 
233 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0491  alanine racemase domain protein  39.72 
 
 
244 aa  145  4.0000000000000006e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000538385  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4903  hypothetical protein  40.49 
 
 
226 aa  145  4.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.116989  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3685  alanine racemase domain-containing protein  38.99 
 
 
237 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000728212  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0760  alanine racemase domain protein  40.43 
 
 
241 aa  145  5e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1189  alanine racemase domain-containing protein  39.29 
 
 
235 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000138535  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4423  alanine racemase domain-containing protein  40.29 
 
 
222 aa  144  9e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.0000180777  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1702  alanine racemase domain-containing protein  42.29 
 
 
214 aa  144  1e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.348168  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0712  alanine racemase domain-containing protein  39.53 
 
 
226 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1127  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 
233 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0116545  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2362  alanine racemase domain-containing protein  35.6 
 
 
253 aa  143  3e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000227174  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2910  alanine racemase domain-containing protein  41.51 
 
 
242 aa  142  3e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.0000373899  normal  0.226909 
 
 
-
 
NC_003296  RS01766  hypothetical protein  41.51 
 
 
226 aa  142  5e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.720058  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0403  PLP dependent enzymes class III-like protein  40.62 
 
 
228 aa  142  5e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2687  alanine racemase domain-containing protein  38.46 
 
 
232 aa  142  5e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.91415  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1356  alanine racemase domain-containing protein  36.4 
 
 
231 aa  141  7e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2208  alanine racemase domain protein  39.74 
 
 
272 aa  141  8e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.834769 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1015  alanine racemase domain protein  37.67 
 
 
247 aa  140  9.999999999999999e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09220  conserved hypothetical protein TIGR00044  38.74 
 
 
230 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00199115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0153  alanine racemase domain-containing protein  36.89 
 
 
235 aa  140  9.999999999999999e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00359094  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0102  hypothetical protein  36.36 
 
 
226 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1857  alanine racemase domain protein  38.26 
 
 
247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.821186 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0013  hypothetical protein  40.19 
 
 
236 aa  140  1.9999999999999998e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2856  alanine racemase domain-containing protein  41.13 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0170216  normal  0.0492664 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1094  alanine racemase domain-containing protein  38.57 
 
 
229 aa  139  3e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.952967  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1026  alanine racemase domain-containing protein  38.57 
 
 
229 aa  139  3e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1021  alanine racemase domain protein  42.03 
 
 
227 aa  139  3e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.952251  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03080  alanine racemase domain protein  40.18 
 
 
234 aa  139  3e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.00378005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3208  hypothetical protein  37.99 
 
 
225 aa  139  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.491657  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1808  hypothetical protein  40 
 
 
226 aa  139  4.999999999999999e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1578  alanine racemase domain-containing protein  37.83 
 
 
247 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.417677  normal  0.0750539 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1264  hypothetical protein  37.27 
 
 
238 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00567806  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0953  hypothetical protein  39.01 
 
 
225 aa  138  6e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000358691  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4150  alanine racemase domain-containing protein  39.91 
 
 
230 aa  138  6e-32  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.766912 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1232  alanine racemase domain-containing protein  40.38 
 
 
234 aa  138  7e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  normal  0.432188 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1834  hypothetical protein  40.26 
 
 
227 aa  138  7e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.413133  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0498  alanine racemase domain-containing protein  39.04 
 
 
235 aa  138  7e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.812973  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1403  alanine racemase domain-containing protein  41.36 
 
 
227 aa  137  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.113582 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2899  hypothetical protein  38.35 
 
 
222 aa  137  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000414809  unclonable  0.000000149465 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1094  alanine racemase domain-containing protein  41.63 
 
 
250 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1741  hypothetical protein  39.57 
 
 
226 aa  137  1e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2503  hypothetical protein  41.87 
 
 
227 aa  136  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0282  hypothetical protein  40.09 
 
 
219 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.118746 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2108  hypothetical protein  37.98 
 
 
241 aa  137  2e-31  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1193  hypothetical protein  38.65 
 
 
238 aa  136  2e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107185  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3040  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 
232 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000913695  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1449  alanine racemase domain protein  41.87 
 
 
223 aa  136  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3607  alanine racemase domain protein  36.4 
 
 
237 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.94886  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3131  alanine racemase domain-containing protein  40.57 
 
 
220 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.803662  hitchhiker  0.000192693 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3352  hypothetical protein  38.16 
 
 
237 aa  135  4e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0543  membrane protein, related to K+ transport  37.22 
 
 
255 aa  135  5e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.42956  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1661  alanine racemase domain protein  37.39 
 
 
244 aa  135  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.19823 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2517  alanine racemase domain-containing protein  39.57 
 
 
232 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.225473  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1365  alanine racemase domain-containing protein  41.67 
 
 
213 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0384344  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1539  alanine racemase domain-containing protein  35.91 
 
 
228 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.237332  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3912  alanine racemase domain protein  39.71 
 
 
243 aa  135  7.000000000000001e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.459164  normal  0.0218623 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3025  alanine racemase domain-containing protein  36.56 
 
 
232 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000116618  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4047  alanine racemase domain protein  34.63 
 
 
233 aa  135  8e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0138922  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1338  alanine racemase domain protein  37 
 
 
239 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00300901  hitchhiker  0.000000312862 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3183  alanine racemase domain-containing protein  36.8 
 
 
232 aa  134  8e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000633261  normal  0.03889 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2762  alanine racemase domain-containing protein  43.54 
 
 
217 aa  134  9e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0716815  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4107  alanine racemase domain-containing protein  38.6 
 
 
250 aa  134  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.760524  normal  0.399061 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0717  alanine racemase domain protein  38.79 
 
 
232 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.799329 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0089  hypothetical protein  37.27 
 
 
224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.937473  normal  0.0909898 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1141  hypothetical protein  37.84 
 
 
271 aa  133  1.9999999999999998e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1332  alanine racemase domain-containing protein  39.52 
 
 
244 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00993906 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>