More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0829 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0829  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 504 aa  1027    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0719  extracellular solute-binding protein family 1  29.43 
 
 		 413 aa  160  6e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0236757  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  28.42 
 
 		 399 aa  157  5.0000000000000005e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00780  extracellular solute-binding protein family 1  27.32 
 
 		 411 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0480859  n/a   
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_2919  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.33 
 
 		 407 aa  142  9.999999999999999e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4520  extracellular solute-binding protein  26.75 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1727  extracellular solute-binding protein family 1  31.2 
 
 		 422 aa  133  6e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0381  extracellular solute-binding protein family 1  31.41 
 
 		 421 aa  133  6.999999999999999e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4883  extracellular solute-binding protein family 1  29.72 
 
 		 436 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.504344  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  29.03 
 
 		 430 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2315  extracellular solute-binding protein family 1  26.25 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7208  extracellular solute-binding protein family 1  29.66 
 
 		 410 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  27.83 
 
 		 446 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4916  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 410 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.06645  normal  0.512511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0420  ABC sugar transporter, periplasmic ligand binding protein  27.29 
 
 		 410 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6572  extracellular solute-binding protein family 1  28.39 
 
 		 410 aa  126  9e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00103217  normal  0.480926 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  27.68 
 
 		 402 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6156  extracellular solute-binding protein family 1  28.24 
 
 		 410 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.889741  hitchhiker  0.000305646 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  29.17 
 
 		 445 aa  124  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  26.01 
 
 		 424 aa  124  4e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5398  ABC transporter substrate binding protein (sugar)  27.59 
 
 		 403 aa  122  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.14652  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1607  ABC transporter sugar-binding protein  27.23 
 
 		 430 aa  121  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1550  extracellular solute-binding protein  27.23 
 
 		 430 aa  120  3.9999999999999996e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19770  extracellular solute-binding protein family 1  27.09 
 
 		 423 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2218  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 479 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00910899  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2451  extracellular solute-binding protein family 1  27.27 
 
 		 449 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.135643  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00880  ABC transporter sugar binding protein  28.5 
 
 		 440 aa  116  7.999999999999999e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.106592  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4057  extracellular solute-binding protein  29.1 
 
 		 410 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2733  extracellular solute-binding protein family 1  31.35 
 
 		 434 aa  116  1.0000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0602915  normal  0.13145 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3430  extracellular solute-binding protein family 1  29.05 
 
 		 415 aa  113  7.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3538  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  24.31 
 
 		 406 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.385239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2818  extracellular solute-binding protein  26.54 
 
 		 488 aa  113  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.179577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  27.09 
 
 		 411 aa  113  1.0000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 464 aa  111  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2303  extracellular solute-binding protein family 1  24.47 
 
 		 480 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.316955  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  24.94 
 
 		 414 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1229  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 461 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0257979  normal  0.868479 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0476  ABC transporter, substrate-binding protein  27.48 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0291  extracellular solute-binding protein  26.91 
 
 		 449 aa  109  1e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  31.29 
 
 		 420 aa  109  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  26.58 
 
 		 411 aa  108  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  29.91 
 
 		 420 aa  108  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.33 
 
 		 427 aa  107  4e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3042  extracellular solute-binding protein  28.27 
 
 		 406 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0658677  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  26.42 
 
 		 426 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0729  extracellular solute-binding protein family 1  28.79 
 
 		 443 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000254304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4632  extracellular solute-binding protein  29.29 
 
 		 419 aa  107  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.448727  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  29.2 
 
 		 430 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 429 aa  106  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4988  extracellular solute-binding protein  28.53 
 
 		 414 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.601947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  26.08 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1494  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  29.9 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04610  extracellular solute-binding protein family 1  27.14 
 
 		 431 aa  105  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21150  carbohydrate-binding protein  25.43 
 
 		 428 aa  104  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.396929  normal  0.174783 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0075  extracellular solute-binding protein family 1  29.57 
 
 		 441 aa  104  3e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4688  extracellular solute-binding protein family 1  31.43 
 
 		 418 aa  104  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.733472 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2571  extracellular solute-binding protein  26.81 
 
 		 417 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06560  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  29.22 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2546  extracellular solute-binding protein  26.92 
 
 		 488 aa  103  7e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.39868  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4083  extracellular solute-binding protein family 1  27.91 
 
 		 417 aa  103  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3422  ABC-type sugar transport systems permease component  25.38 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3226  Transcriptional regulator  25.38 
 
 		 410 aa  102  1e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  25.39 
 
 		 424 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3572  extracellular solute-binding protein family 1  25.13 
 
 		 427 aa  102  1e-20  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.405751  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1316  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 		 423 aa  102  1e-20  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1899  extracellular solute-binding protein, putative  25.85 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.41529  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1634  sugar ABC transporter, sugar-binding protein  25.85 
 
 		 416 aa  102  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  25.18 
 
 		 428 aa  101  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2504  extracellular solute-binding protein family 1  28.17 
 
 		 442 aa  100  6e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1215  extracellular solute-binding protein family 1  28.62 
 
 		 446 aa  100  6e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000064062  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2726  extracellular solute-binding protein  23.15 
 
 		 437 aa  100  7e-20  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.290956  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1846  extracellular solute-binding protein family 1  25.68 
 
 		 425 aa  100  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.169612  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5349  extracellular solute-binding protein family 1  27.07 
 
 		 406 aa  100  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.535832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3337  extracellular solute-binding protein family 1  24.33 
 
 		 427 aa  99.8  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.806542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0183  extracellular solute-binding protein family 1  28.74 
 
 		 429 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3276  extracellular solute-binding protein family 1  24.46 
 
 		 420 aa  99.4  1e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.147153  normal  0.336546 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1152  extracellular solute-binding protein  29.25 
 
 		 393 aa  99  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0401617  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3957  extracellular solute-binding protein family 1  26.07 
 
 		 432 aa  99  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2294  extracellular solute-binding protein family 1  26.6 
 
 		 448 aa  99  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  26.2 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1999  extracellular solute-binding protein family 1  29.23 
 
 		 468 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  25.23 
 
 		 483 aa  98.2  3e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27690  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.82 
 
 		 431 aa  97.8  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.340884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4038  extracellular solute-binding protein family 1  24.22 
 
 		 405 aa  97.4  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3641  extracellular solute-binding protein  28.21 
 
 		 444 aa  97.4  5e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4697  extracellular solute-binding protein family 1  25.72 
 
 		 442 aa  97.1  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00367387  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1020  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 459 aa  97.4  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000124434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3157  extracellular solute-binding protein family 1  27.99 
 
 		 429 aa  97.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0206164  normal  0.300299 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.44 
 
 		 444 aa  97.1  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6528  extracellular solute-binding protein family 1  26.77 
 
 		 415 aa  97.1  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0147922 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0144  extracellular solute-binding protein  27.3 
 
 		 403 aa  97.1  8e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.442205  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2031  extracellular solute-binding protein family 1  26.5 
 
 		 442 aa  96.3  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.298737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  26.27 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4289  extracellular solute-binding protein  26.53 
 
 		 466 aa  95.5  2e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5802  extracellular solute-binding protein family 1  25.3 
 
 		 444 aa  94.7  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0809589 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5331  extracellular solute-binding protein family 1  27.97 
 
 		 424 aa  94.7  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04070  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  27.3 
 
 		 444 aa  94.4  5e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5048  extracellular solute-binding protein family 1  27.33 
 
 		 424 aa  94  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.133709  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3271  extracellular solute-binding protein family 1  27.75 
 
 		 473 aa  93.6  7e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2164  extracellular solute-binding protein family 1  25.75 
 
 		 435 aa  93.6  7e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>