More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0779 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  100 
 
 		 147 aa  297  3e-80  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  60.34 
 
 		 192 aa  145  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  58.97 
 
 		 138 aa  142  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  62.28 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  52.27 
 
 		 176 aa  137  6e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  51.91 
 
 		 175 aa  136  8.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  49.36 
 
 		 151 aa  135  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  53.91 
 
 		 152 aa  132  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  51.16 
 
 		 175 aa  124  5e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  47.79 
 
 		 164 aa  121  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  52.1 
 
 		 172 aa  119  9.999999999999999e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  50 
 
 		 188 aa  119  9.999999999999999e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  49.57 
 
 		 157 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  45.6 
 
 		 159 aa  114  5e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  50.86 
 
 		 154 aa  113  7.999999999999999e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  44.8 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  48.67 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  42.75 
 
 		 201 aa  111  3e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  43.06 
 
 		 135 aa  110  6e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  41.96 
 
 		 135 aa  108  3e-23  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  39.57 
 
 		 172 aa  108  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 220 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  48.7 
 
 		 160 aa  107  4.0000000000000004e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  41.96 
 
 		 135 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 231 aa  107  5e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  46.22 
 
 		 165 aa  107  6e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  43.97 
 
 		 242 aa  107  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  46.96 
 
 		 171 aa  107  6e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  44.35 
 
 		 225 aa  107  7.000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 184 aa  106  8.000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  47.5 
 
 		 161 aa  106  1e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  46.9 
 
 		 158 aa  105  3e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  46.21 
 
 		 136 aa  104  3e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  43.48 
 
 		 222 aa  103  6e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  45.61 
 
 		 158 aa  103  8e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  45.61 
 
 		 158 aa  103  9e-22  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 155 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  39.13 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  45.13 
 
 		 160 aa  102  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  49.11 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2137  single-strand binding protein  45.21 
 
 		 139 aa  102  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000000567752  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03705  single-stranded DNA-binding protein  50.48 
 
 		 178 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  48.6 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 134 aa  101  3e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  48.6 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  48.6 
 
 		 182 aa  101  3e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002363  single-stranded DNA-binding protein  49.06 
 
 		 178 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.298235  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0723  single-strand binding protein  47.66 
 
 		 180 aa  101  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 163 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2539  single-strand binding protein  51.38 
 
 		 150 aa  100  5e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000000217555  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  46.02 
 
 		 186 aa  100  5e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 161 aa  100  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  47.27 
 
 		 166 aa  100  8e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2186  single-strand binding protein  44.19 
 
 		 138 aa  100  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000035303  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.97 
 
 		 148 aa  100  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  44.04 
 
 		 157 aa  99.4  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  39.07 
 
 		 149 aa  99.4  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  40 
 
 		 231 aa  100  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.81 
 
 		 146 aa  99.8  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3512  single-stranded DNA-binding protein  47.66 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.534706  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0461  single-stranded DNA-binding protein  46.79 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  45.08 
 
 		 177 aa  99  2e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4439  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 181 aa  98.6  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.580245  normal  0.977465 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4105  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 181 aa  99  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  44.63 
 
 		 176 aa  98.6  2e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  44.17 
 
 		 238 aa  98.6  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  44.25 
 
 		 163 aa  98.2  3e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3662  single-stranded DNA-binding protein  47.66 
 
 		 180 aa  97.8  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.311594  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  44.17 
 
 		 222 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  51.82 
 
 		 140 aa  98.2  4e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5266  single-stranded DNA-binding protein  48.31 
 
 		 173 aa  97.8  5e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000287682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5335  single-stranded DNA-binding protein  48.31 
 
 		 172 aa  97.4  5e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000380691  hitchhiker  0.000000431686 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0688  single-strand binding protein  43.92 
 
 		 140 aa  97.4  6e-20  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.682205  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 236 aa  97.4  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 236 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  41.41 
 
 		 234 aa  97.1  7e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0422  single-stranded DNA-binding protein  41.96 
 
 		 178 aa  97.1  8e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.508741 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 165 aa  97.1  8e-20  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_011081  SeHA_A0051  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 175 aa  96.7  9e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.772758  normal  0.0108774 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03522  Single-strand binding protein (SSB) (Helix-destabilizing protein)  45.79 
 
 		 161 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.721181  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  39.86 
 
 		 146 aa  95.9  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5624  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 169 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00000012759  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5154  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000326746  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5170  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 172 aa  95.9  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00247541  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5562  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.214992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5661  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 173 aa  96.3  1e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000522021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0312  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 168 aa  96.7  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000035276 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5722  single-stranded DNA-binding protein  47.46 
 
 		 172 aa  95.9  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000060973  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0002  single-stranded DNA-binding protein  45.71 
 
 		 175 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3968  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0530108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  46.73 
 
 		 178 aa  96.3  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>