More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0762 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0762  HhH-GPD family protein  100 
 
 
236 aa  491  9.999999999999999e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2402  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.75 
 
 
222 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000142862  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0911  HhH-GPD family protein  48.1 
 
 
219 aa  192  5e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.581755  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0797  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.74 
 
 
241 aa  175  5e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.366524 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0980  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  44.81 
 
 
232 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000000905623  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2013  HhH-GPD family protein  42.86 
 
 
236 aa  160  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.367934 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4286  HhH-GPD family protein  40 
 
 
224 aa  158  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.507198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1044  HhH-GPD family protein  44.21 
 
 
233 aa  157  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.86718 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2290  HhH-GPD  39.91 
 
 
242 aa  154  9e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1733  HhH-GPD family protein  39.32 
 
 
241 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.361007  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5333  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.59 
 
 
253 aa  148  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.278444  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3412  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  42.08 
 
 
239 aa  138  6e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.396422 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2840  HhH-GPD family protein  39.82 
 
 
259 aa  131  7.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.465492  normal  0.201292 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3948  DNA-cytosine methyltransferase  33.93 
 
 
657 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2718  HhH-GPD family protein  41.97 
 
 
254 aa  129  3e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.74745 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2945  Endonuclease III FCL domain protein  41.45 
 
 
254 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.590508  hitchhiker  0.00145788 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2702  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  37.09 
 
 
274 aa  125  8.000000000000001e-28  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.620908  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1412  HhH-GPD family protein  35.09 
 
 
242 aa  120  3e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2595  HhH-GPD family protein  36.02 
 
 
269 aa  113  3e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0141  HhH-GPD family protein  34.86 
 
 
236 aa  112  3e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0317  HhH-GPD family protein  34.91 
 
 
278 aa  112  5e-24  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.196708  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2110  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  34.87 
 
 
230 aa  108  6e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3075  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.03 
 
 
270 aa  107  1e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.156528  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0393  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.79 
 
 
240 aa  107  2e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0160174  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0457  endonuclease III  33.18 
 
 
211 aa  106  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.791842 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0066  HhH-GPD family protein  35.71 
 
 
219 aa  106  3e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0093  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  35.44 
 
 
222 aa  106  3e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.169395 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0416  endonuclease III/Nth  32.74 
 
 
208 aa  105  6e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0504  endonuclease III  32.74 
 
 
212 aa  102  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1172  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.55 
 
 
218 aa  102  7e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0261583  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0501  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.27 
 
 
216 aa  101  8e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0399  endonuclease III  34.72 
 
 
221 aa  100  2e-20  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00555795  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0438  endonuclease III  33.86 
 
 
203 aa  100  3e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0343367  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1482  endonuclease III  32.68 
 
 
211 aa  99.4  4e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1140  HhH-GPD family protein  33.33 
 
 
222 aa  99.8  4e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000000277091 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1990  endonuclease III  34.43 
 
 
212 aa  98.6  7e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1090  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.5 
 
 
236 aa  97.4  2e-19  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.311677  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0052  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31 
 
 
218 aa  97.4  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1525  endonuclease III  32.27 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000000771043  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1318  endonuclease III  31.36 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000293814  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3627  endonuclease III  33.18 
 
 
220 aa  96.3  4e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.620738  normal  0.69522 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0493  endonuclease III  33.95 
 
 
220 aa  95.5  6e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1887  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  29.57 
 
 
230 aa  95.5  7e-19  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00394166  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0552  endonuclease III  30.93 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000152359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0566  endonuclease III  30.93 
 
 
213 aa  95.5  7e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000803822  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  33.97 
 
 
211 aa  95.5  7e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0101  HhH-GPD family protein  34.17 
 
 
218 aa  94.7  1e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0547  HhH-GPD family protein  29.9 
 
 
220 aa  94.4  1e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1062  endonuclease III  33.33 
 
 
227 aa  94.7  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.561785 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1461  endonuclease III  34.95 
 
 
216 aa  94  2e-18  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0533  HhH-GPD family protein  28.92 
 
 
220 aa  93.6  2e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.208461  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2157  HhH-GPD family protein  28.64 
 
 
218 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.242107 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1388  endonuclease III  31.96 
 
 
210 aa  94  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.212617  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1681  endonuclease III/Nth  31.94 
 
 
212 aa  93.6  3e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0804  endonuclease III  35.16 
 
 
219 aa  93.6  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.61713 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6030  endonuclease III  33.18 
 
 
215 aa  91.3  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.22516 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0785  HhH-GPD  31.25 
 
 
269 aa  90.9  1e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1299  endonuclease III  33.18 
 
 
213 aa  91.7  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000804758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3156  HhH-GPD family protein  27.69 
 
 
223 aa  90.1  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0734145 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3057  endonuclease III  35.85 
 
 
208 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0936  endonuclease III  30.95 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.324146  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1037  endonuclease III  33.33 
 
 
218 aa  89.7  3e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.36835  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1523  HhH-GPD family protein  27.01 
 
 
216 aa  89.7  4e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.951977  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  33.01 
 
 
211 aa  89.4  4e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0436  endonuclease III  32.8 
 
 
220 aa  89.4  5e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.22324  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1794  base excision repair protein, HhH-GPD family  25.96 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1471  HhH-GPD family protein  25.96 
 
 
223 aa  89.4  5e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.598554  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2676  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  35.64 
 
 
214 aa  89.4  5e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  31.36 
 
 
236 aa  89  7e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18220  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase /endonuclease III  35.24 
 
 
268 aa  89  7e-17  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.331491  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  34.63 
 
 
212 aa  87.8  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  33.5 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0950  endonuclease III  32.5 
 
 
214 aa  87.8  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.066309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  32.64 
 
 
212 aa  87  2e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1273  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  32.62 
 
 
215 aa  87  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0070  DNA-3-methyladenine glycosylase III  28.37 
 
 
223 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.678566 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  33 
 
 
214 aa  87.4  2e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  34.38 
 
 
237 aa  86.3  4e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10790  endonuclease III  31.28 
 
 
212 aa  86.3  4e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10840  hypothetical base excision DNA repair protein (Eurofung)  30.53 
 
 
502 aa  85.5  6e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00957228  normal  0.419828 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5194  endonuclease III  34.76 
 
 
221 aa  85.9  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.03252e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0353  HhH-GPD family protein  27.75 
 
 
222 aa  85.5  6e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.822084 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0366  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  31.12 
 
 
211 aa  85.5  7e-16  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0190  endonuclease III  33.33 
 
 
224 aa  85.5  7e-16  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1752  HhH-GPD family protein  29.3 
 
 
216 aa  85.5  7e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.249541 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_9330  predicted protein  38.24 
 
 
107 aa  85.1  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0770912 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2500  endonuclease III  33.5 
 
 
240 aa  85.1  9e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0666144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  32.2 
 
 
230 aa  85.1  9e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  30.13 
 
 
223 aa  84.7  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2405  endonuclease III  33.33 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.997056  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1050  endonuclease III  34.47 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.872905  normal  0.0952767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2355  endonuclease III  33.33 
 
 
220 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1270  endonuclease III  30.87 
 
 
215 aa  84.3  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2246  endonuclease III  32.5 
 
 
214 aa  84  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.769441 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>