More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0710 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0710  ribosomal protein S12  100 
 
 
141 aa  278  3e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1190  30S ribosomal protein S12  77.7 
 
 
144 aa  205  1e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0609738  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4031  30S ribosomal protein S12  77.7 
 
 
144 aa  205  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000129313  hitchhiker  0.0000334928 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3275  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 
146 aa  203  6e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000000846161  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3030  30S ribosomal protein S12  76.98 
 
 
151 aa  202  1e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000363453  hitchhiker  0.0000189693 
 
 
-
 
NC_002936  DET0470  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000814349  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_413  ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  197  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000235971  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0447  30S ribosomal protein S12  73.33 
 
 
144 aa  197  5e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000000945225  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0235  30S ribosomal protein S12  70.21 
 
 
140 aa  194  4.0000000000000005e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000000397858  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0704  30S ribosomal protein S12  72.34 
 
 
123 aa  193  7e-49  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000738801  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0099  30S ribosomal protein S12  72.34 
 
 
140 aa  193  8.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000814574  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1529  ribosomal protein S12  70.92 
 
 
124 aa  192  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000223739  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0105  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000168481  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0105  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000228293  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0101  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.6494e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0099  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000000000147316  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0117  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.27577e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0105  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000155228  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0136  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
140 aa  191  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000243353  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4009  ribosomal protein S12  72.34 
 
 
123 aa  191  2e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0866702  normal  0.990626 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0457  ribosomal protein S12  71.22 
 
 
135 aa  191  2e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000930962  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0106  30S ribosomal protein S12  70.21 
 
 
140 aa  191  2e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000499342  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0807  30S ribosomal protein S12  69.5 
 
 
145 aa  191  3e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000025178  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2716  ribosomal protein S12  71.63 
 
 
137 aa  191  4e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0495747  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5200  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
140 aa  189  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000425498  unclonable  1.01821e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0126  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
140 aa  189  8e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000151619  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0296  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
135 aa  189  8e-48  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0100  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
140 aa  189  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000459587  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0260  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
135 aa  189  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000200867  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2597  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
137 aa  189  1e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000786434  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0287  30S ribosomal protein S12  71.94 
 
 
135 aa  189  1e-47  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  8.37447e-16  hitchhiker  0.00000000000000939126 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1771  30S ribosomal protein S12  71.63 
 
 
137 aa  188  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.0000038493  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0389  30S ribosomal protein S12  70.21 
 
 
124 aa  187  2.9999999999999997e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0696  30S ribosomal protein S12  70.21 
 
 
123 aa  187  5e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.85077e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1764  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
137 aa  186  7e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000016487  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0417  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
140 aa  186  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000726978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0210  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
124 aa  186  9e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000110555  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1290  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
127 aa  186  9e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0116832  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1316  30S ribosomal protein S12  70.92 
 
 
137 aa  186  9e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000011083  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0795  30S ribosomal protein S12  68.79 
 
 
124 aa  185  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.182051  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl624  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
137 aa  186  1e-46  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2263  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
123 aa  186  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.12469  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0711  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
136 aa  186  1e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.305716  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2338  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
125 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.00000000575958  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1551  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  186  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00133332  normal  0.90394 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1047  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
124 aa  184  2e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000000000671738  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0887  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
124 aa  185  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000822603 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0473  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
124 aa  185  2e-46  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0075  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
123 aa  185  2e-46  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.392906 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0492  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00450059  hitchhiker  0.000000284598 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0322  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  184  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0874299  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0659  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
127 aa  184  4e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.254594  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1063  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  184  5e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000011853  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0315  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
142 aa  184  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000451595  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2719  30S ribosomal protein S12  68.79 
 
 
126 aa  183  5e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0011677  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2405  30S ribosomal protein S12  68.79 
 
 
126 aa  183  5e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000879391  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0842  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  184  5e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117432  hitchhiker  0.000366661 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2069  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
128 aa  183  6e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.0000594982  normal  0.793383 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3442  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000394059  normal  0.236546 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0271  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.635943 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0151  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
139 aa  183  6e-46  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2764  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0416814  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1098  ribosomal protein S12  69.5 
 
 
123 aa  183  6e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0244  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.240123  normal  0.127892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0262  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.822385  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0322  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.46074  normal  0.0169836 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0343  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0675  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  183  6e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00545662  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0281  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
124 aa  183  7e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000103953  decreased coverage  0.00000987169 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1488  30S ribosomal protein S12  69.5 
 
 
139 aa  183  7e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000142047  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2912  ribosomal protein S12  70 
 
 
137 aa  183  7e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.00000187241  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0052  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
123 aa  183  7e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1564  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
125 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0581883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0976  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
128 aa  183  8e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000000391683  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3649  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
126 aa  183  8e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000111216  hitchhiker  0.000000000929733 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1539  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
125 aa  183  8e-46  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0948  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
124 aa  183  9e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000100992  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2301  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
128 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000703033  decreased coverage  0.000703335 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2624  30S ribosomal protein S12  69.29 
 
 
138 aa  181  2.0000000000000003e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.0000552514  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0175  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
129 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.000000000018595  normal  0.463989 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1341  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
123 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000369822  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0102  30S ribosomal protein S12  69.12 
 
 
140 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2428  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
135 aa  181  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0584234  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0186  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
137 aa  181  3e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000101911  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0621  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
123 aa  181  3e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000330783  decreased coverage  1.9094399999999998e-21 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0274  30S ribosomal protein S12  67.38 
 
 
125 aa  181  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.0000000000134966  unclonable  0.0000000817173 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0568  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
137 aa  181  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.0000132236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0582  30S ribosomal protein S12  68.09 
 
 
137 aa  181  3e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000131582  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3751  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0182749  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3782  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00172098  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3073  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0733593  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3809  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2845  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.904067  normal  0.207657 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10060  SSU ribosomal protein S12P  68.09 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000265331  hitchhiker  0.000000000840597 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2465  30S ribosomal protein S12  66.67 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0122546 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0309  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0102814  normal  0.289006 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0220  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
124 aa  180  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00000630102  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0333  30S ribosomal protein S12  65.25 
 
 
125 aa  180  5.0000000000000004e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00769915 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2071  30S ribosomal protein S12  65.96 
 
 
123 aa  180  6e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.944717  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2664  ribosomal protein S12  68.35 
 
 
122 aa  180  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>